Protein–RNA interactions for Protein: P35736

YKL050C, Uncharacterized protein YKL050C, yeast

Predictions only

Length 922 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YKL050C	P35736	NPL3	YDR432W	1245 nt		13.08	□□□□□ -0.32
YKL050C	P35736	YMR090W	YMR090W	684 nt		13.07	□□□□□ -0.32
YKL050C	P35736	ART5	YGR068C	1761 nt		13.06	□□□□□ -0.32
YKL050C	P35736	GFD2	YCL036W	1701 nt		13.03	□□□□□ -0.32
YKL050C	P35736	YBR220C	YBR220C	1683 nt		13.02	□□□□□ -0.33
YKL050C	P35736	BDF1	YLR399C	2061 nt		13.01	□□□□□ -0.33
YKL050C	P35736	TIR4	YOR009W	1464 nt		13	□□□□□ -0.33
YKL050C	P35736	IRC15	YPL017C	1500 nt		12.99	□□□□□ -0.33
YKL050C	P35736	PET9	YBL030C	957 nt		12.98	□□□□□ -0.33
YKL050C	P35736	SDH1	YKL148C	1923 nt		12.96	□□□□□ -0.33
YKL050C	P35736	YLR154C-G	YLR154C-G	150 nt		12.94	□□□□□ -0.34
YKL050C	P35736	YCH1	YGR203W	447 nt		12.91	□□□□□ -0.34
YKL050C	P35736	GIS3	YLR094C	1509 nt		12.9	□□□□□ -0.34
YKL050C	P35736	YLR281C	YLR281C	468 nt		12.89	□□□□□ -0.35
YKL050C	P35736	RTS2	YOR077W	699 nt		12.89	□□□□□ -0.35
YKL050C	P35736	WHI5	YOR083W	888 nt		12.87	□□□□□ -0.35
YKL050C	P35736	SCC4	YER147C	1875 nt		12.86	□□□□□ -0.35
YKL050C	P35736	YJL152W	YJL152W	360 nt		12.85	□□□□□ -0.35
YKL050C	P35736	YMR057C	YMR057C	372 nt		12.85	□□□□□ -0.35
YKL050C	P35736	TAT1	YBR069C	1860 nt		12.82	□□□□□ -0.36
YKL050C	P35736	CUE1	YMR264W	612 nt		12.78	□□□□□ -0.36
YKL050C	P35736	FPS1	YLL043W	2010 nt		12.73	□□□□□ -0.37
YKL050C	P35736	tM(CAU)C	tM(CAU)C	72 nt		12.7	□□□□□ -0.38
YKL050C	P35736	IMT4	tM(CAU)E	72 nt		12.7	□□□□□ -0.38
YKL050C	P35736	IMT3	tM(CAU)J3	72 nt		12.7	□□□□□ -0.38
YKL050C	P35736	IMT1	tM(CAU)O1	72 nt		12.7	□□□□□ -0.38
YKL050C	P35736	IMT2	tM(CAU)P	72 nt		12.7	□□□□□ -0.38
YKL050C	P35736	MOT3	YMR070W	1473 nt		12.68	□□□□□ -0.38
YKL050C	P35736	PUS2	YGL063W	1113 nt		12.68	□□□□□ -0.38
YKL050C	P35736	YCL048W-A	YCL048W-A	240 nt		12.66	□□□□□ -0.38
YKL050C	P35736	YIL100W	YIL100W	354 nt		12.58	□□□□□ -0.4
YKL050C	P35736	YLR236C	YLR236C	324 nt		12.58	□□□□□ -0.4
YKL050C	P35736	IDH1	YNL037C	1083 nt		12.58	□□□□□ -0.4
YKL050C	P35736	DSK2	YMR276W	1122 nt		12.57	□□□□□ -0.4
YKL050C	P35736	YSC84	YHR016C	1407 nt		12.56	□□□□□ -0.4
YKL050C	P35736	YPR011C	YPR011C	981 nt		12.56	□□□□□ -0.4
YKL050C	P35736	IMP2'	YIL154C	1041 nt		12.55	□□□□□ -0.4
YKL050C	P35736	SEC11	YIR022W	504 nt		12.53	□□□□□ -0.4
YKL050C	P35736	YHL050C	YHL050C	2094 nt		12.52	□□□□□ -0.4
YKL050C	P35736	GBP2	YCL011C	1284 nt		12.52	□□□□□ -0.41
YKL050C	P35736	RRT12	YCR045C	1476 nt		12.52	□□□□□ -0.41
YKL050C	P35736	PCH2	YBR186W	1695 nt		12.5	□□□□□ -0.41
YKL050C	P35736	RRD1	YIL153W	1182 nt		12.46	□□□□□ -0.41
YKL050C	P35736	YNL195C	YNL195C	786 nt		12.45	□□□□□ -0.42
YKL050C	P35736	GUT2	YIL155C	1950 nt		12.45	□□□□□ -0.42
YKL050C	P35736	DED1	YOR204W	1815 nt		12.41	□□□□□ -0.42
YKL050C	P35736	FMP45	YDL222C	930 nt		12.39	□□□□□ -0.43
YKL050C	P35736	YDR433W	YDR433W	441 nt		12.38	□□□□□ -0.43
YKL050C	P35736	TCD2	YKL027W	1344 nt		12.37	□□□□□ -0.43
YKL050C	P35736	ERV46	YAL042W	1248 nt		12.35	□□□□□ -0.43
YKL050C	P35736	LPX1	YOR084W	1164 nt		12.35	□□□□□ -0.43
YKL050C	P35736	MXR2	YCL033C	507 nt		12.35	□□□□□ -0.43
YKL050C	P35736	FMT1	YBL013W	1206 nt		12.32	□□□□□ -0.44
YKL050C	P35736	PIB2	YGL023C	1908 nt		12.3	□□□□□ -0.44
YKL050C	P35736	FMP52	YER004W	696 nt		12.29	□□□□□ -0.44
YKL050C	P35736	YKR040C	YKR040C	504 nt		12.26	□□□□□ -0.45
YKL050C	P35736	RTF1	YGL244W	1677 nt		12.22	□□□□□ -0.45
YKL050C	P35736	PCM1	YEL058W	1674 nt		12.19	□□□□□ -0.46
YKL050C	P35736	SOR2	YDL246C	1074 nt		12.18	□□□□□ -0.46
YKL050C	P35736	SOR1	YJR159W	1074 nt		12.18	□□□□□ -0.46
YKL050C	P35736	ADH2	YMR303C	1047 nt		12.18	□□□□□ -0.46
YKL050C	P35736	NCP1	YHR042W	2076 nt		12.17	□□□□□ -0.46
YKL050C	P35736	CWP1	YKL096W	720 nt		12.17	□□□□□ -0.46
YKL050C	P35736	BOP3	YNL042W	1191 nt		12.17	□□□□□ -0.46
YKL050C	P35736	FRD1	YEL047C	1413 nt		12.16	□□□□□ -0.46
YKL050C	P35736	LCB1	YMR296C	1677 nt		12.14	□□□□□ -0.47
YKL050C	P35736	YCL042W	YCL042W	360 nt		12.12	□□□□□ -0.47
YKL050C	P35736	SNF6	YHL025W	999 nt		12.09	□□□□□ -0.47
YKL050C	P35736	PTK1	YKL198C	1989 nt		12.07	□□□□□ -0.48
YKL050C	P35736	SPP1	YPL138C	1062 nt		12.06	□□□□□ -0.48
YKL050C	P35736	SIM1	YIL123W	1431 nt		12.05	□□□□□ -0.48
YKL050C	P35736	NVJ2	YPR091C	2313 nt		12.02	□□□□□ -0.49
YKL050C	P35736	BIO4	YNR057C	714 nt		12.02	□□□□□ -0.49
YKL050C	P35736	PAC11	YDR488C	1602 nt		12	□□□□□ -0.49
YKL050C	P35736	YIH1	YCR059C	777 nt		11.97	□□□□□ -0.49
YKL050C	P35736	RNQ1	YCL028W	1218 nt		11.93	□□□□□ -0.5
YKL050C	P35736	LYS4	YDR234W	2082 nt		11.9	□□□□□ -0.5
YKL050C	P35736	PTH1	YHR189W	573 nt		11.89	□□□□□ -0.51
YKL050C	P35736	YLL053C	YLL053C	459 nt		11.89	□□□□□ -0.51
YKL050C	P35736	DIC1	YLR348C	897 nt		11.89	□□□□□ -0.51
YKL050C	P35736	ERF2	YLR246W	1080 nt		11.82	□□□□□ -0.52
YKL050C	P35736	YFL054C	YFL054C	1941 nt		11.82	□□□□□ -0.52
YKL050C	P35736	CRR1	YLR213C	1269 nt		11.81	□□□□□ -0.52
YKL050C	P35736	YLR235C	YLR235C	399 nt		11.81	□□□□□ -0.52
YKL050C	P35736	FTR1	YER145C	1215 nt		11.78	□□□□□ -0.52
YKL050C	P35736	ATF2	YGR177C	1608 nt		11.77	□□□□□ -0.53
YKL050C	P35736	GAL1	YBR020W	1587 nt		11.75	□□□□□ -0.53
YKL050C	P35736	RTG1	YOL067C	534 nt		11.75	□□□□□ -0.53
YKL050C	P35736	TIM23	YNR017W	669 nt		11.74	□□□□□ -0.53
YKL050C	P35736	TRM5	YHR070W	1500 nt		11.73	□□□□□ -0.53
YKL050C	P35736	SPT8	YLR055C	1809 nt		11.72	□□□□□ -0.53
YKL050C	P35736	YKL030W	YKL030W	606 nt		11.72	□□□□□ -0.53
YKL050C	P35736	YFL067W	YFL067W	528 nt		11.7	□□□□□ -0.54
YKL050C	P35736	YLR179C	YLR179C	606 nt		11.69	□□□□□ -0.54
YKL050C	P35736	MIC10	YCL057C-A	294 nt		11.69	□□□□□ -0.54
YKL050C	P35736	HEM12	YDR047W	1089 nt		11.67	□□□□□ -0.54
YKL050C	P35736	SNG1	YGR197C	1644 nt		11.67	□□□□□ -0.54
YKL050C	P35736	AQY1	YPR192W	918 nt		11.66	□□□□□ -0.54
YKL050C	P35736	DDR2	YOL052C-A	186 nt		11.65	□□□□□ -0.54
YKL050C	P35736	RDN37-1	RDN37-1	5354 nt		11.64	□□□□□ -0.55

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