Protein–RNA interactions for Protein: P34228

SEF1, Putative transcription factor SEF1, yeastyeast

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Length 1,148 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SEF1P34228 YDR095CYDR095C 411 nt11.33□□□□□ -0.6
SEF1P34228 NVJ2YPR091C 2313 nt11.32□□□□□ -0.6
SEF1P34228 DSK2YMR276W 1122 nt11.31□□□□□ -0.6
SEF1P34228 YLR236CYLR236C 324 nt11.3□□□□□ -0.6
SEF1P34228 ALF1YNL148C 765 nt11.3□□□□□ -0.6
SEF1P34228 MRPL8YJL063C 717 nt11.27□□□□□ -0.61
SEF1P34228 SUF2tP(AGG)C 72 nt11.26□□□□□ -0.61
SEF1P34228 SUF10tP(AGG)N 72 nt11.26□□□□□ -0.61
SEF1P34228 YCH1YGR203W 447 nt11.25□□□□□ -0.61
SEF1P34228 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt11.23□□□□□ -0.61
SEF1P34228 IMP2'YIL154C 1041 nt11.22□□□□□ -0.61
SEF1P34228 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt11.22□□□□□ -0.61
SEF1P34228 MEP2YNL142W 1500 nt11.19□□□□□ -0.62
SEF1P34228 SIS1YNL007C 1059 nt11.15□□□□□ -0.62
SEF1P34228 BDF1YLR399C 2061 nt11.13□□□□□ -0.63
SEF1P34228 FPS1YLL043W 2010 nt11.12□□□□□ -0.63
SEF1P34228 RPP2AYOL039W 321 nt11.1□□□□□ -0.63
SEF1P34228 ADO1YJR105W 1023 nt11.08□□□□□ -0.64
SEF1P34228 LPX1YOR084W 1164 nt11.07□□□□□ -0.64
SEF1P34228 PTP1YDL230W 1008 nt11.05□□□□□ -0.64
SEF1P34228 UBX6YJL048C 1191 nt11.05□□□□□ -0.64
SEF1P34228 SPP1YPL138C 1062 nt11.05□□□□□ -0.64
SEF1P34228 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt11.04□□□□□ -0.64
SEF1P34228 YEL076CYEL076C 651 nt11.04□□□□□ -0.64
SEF1P34228 YLR464WYLR464W 651 nt11.04□□□□□ -0.64
SEF1P34228 YJL152WYJL152W 360 nt11.03□□□□□ -0.64
SEF1P34228 ERV46YAL042W 1248 nt11.02□□□□□ -0.65
SEF1P34228 DCW1YKL046C 1350 nt11□□□□□ -0.65
SEF1P34228 RTG1YOL067C 534 nt10.99□□□□□ -0.65
SEF1P34228 TAT1YBR069C 1860 nt10.96□□□□□ -0.65
SEF1P34228 TIR4YOR009W 1464 nt10.96□□□□□ -0.65
SEF1P34228 IDH1YNL037C 1083 nt10.94□□□□□ -0.66
SEF1P34228 ART5YGR068C 1761 nt10.93□□□□□ -0.66
SEF1P34228 PET9YBL030C 957 nt10.92□□□□□ -0.66
SEF1P34228 CAC2YML102W 1407 nt10.92□□□□□ -0.66
SEF1P34228 GFD2YCL036W 1701 nt10.9□□□□□ -0.66
SEF1P34228 YDR433WYDR433W 441 nt10.9□□□□□ -0.66
SEF1P34228 EMI2YDR516C 1503 nt10.89□□□□□ -0.67
SEF1P34228 YKR040CYKR040C 504 nt10.88□□□□□ -0.67
SEF1P34228 YDL221WYDL221W 552 nt10.82□□□□□ -0.68
SEF1P34228 GBP2YCL011C 1284 nt10.82□□□□□ -0.68
SEF1P34228 YMR090WYMR090W 684 nt10.81□□□□□ -0.68
SEF1P34228 YMR057CYMR057C 372 nt10.8□□□□□ -0.68
SEF1P34228 MXR2YCL033C 507 nt10.8□□□□□ -0.68
SEF1P34228 IRC15YPL017C 1500 nt10.77□□□□□ -0.69
SEF1P34228 HUA1YGR268C 597 nt10.75□□□□□ -0.69
SEF1P34228 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt10.75□□□□□ -0.69
SEF1P34228 YDR094WYDR094W 336 nt10.74□□□□□ -0.69
SEF1P34228 RTS2YOR077W 699 nt10.73□□□□□ -0.69
SEF1P34228 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt10.7□□□□□ -0.7
SEF1P34228 CUE1YMR264W 612 nt10.68□□□□□ -0.7
SEF1P34228 GIS3YLR094C 1509 nt10.68□□□□□ -0.7
SEF1P34228 SDH1YKL148C 1923 nt10.67□□□□□ -0.7
SEF1P34228 YBR220CYBR220C 1683 nt10.66□□□□□ -0.7
SEF1P34228 TCD2YKL027W 1344 nt10.64□□□□□ -0.71
SEF1P34228 DED1YOR204W 1815 nt10.62□□□□□ -0.71
SEF1P34228 SCC4YER147C 1875 nt10.61□□□□□ -0.71
SEF1P34228 RRD1YIL153W 1182 nt10.59□□□□□ -0.71
SEF1P34228 FRD1YEL047C 1413 nt10.58□□□□□ -0.72
SEF1P34228 YIL100WYIL100W 354 nt10.53□□□□□ -0.72
SEF1P34228 PTH1YHR189W 573 nt10.5□□□□□ -0.73
SEF1P34228 FMT1YBL013W 1206 nt10.5□□□□□ -0.73
SEF1P34228 YKL030WYKL030W 606 nt10.47□□□□□ -0.73
SEF1P34228 SOR2YDL246C 1074 nt10.46□□□□□ -0.73
SEF1P34228 SOR1YJR159W 1074 nt10.46□□□□□ -0.73
SEF1P34228 FMP52YER004W 696 nt10.44□□□□□ -0.74
SEF1P34228 YCL042WYCL042W 360 nt10.44□□□□□ -0.74
SEF1P34228 UME6YDR207C 2511 nt10.44□□□□□ -0.74
SEF1P34228 YJL225CYJL225C 5277 nt10.43□□□□□ -0.74
SEF1P34228 YLR235CYLR235C 399 nt10.43□□□□□ -0.74
SEF1P34228 SBA1YKL117W 651 nt10.41□□□□□ -0.74
SEF1P34228 LCB1YMR296C 1677 nt10.39□□□□□ -0.75
SEF1P34228 PAU16YKL224C 372 nt10.36□□□□□ -0.75
SEF1P34228 YNL195CYNL195C 786 nt10.36□□□□□ -0.75
SEF1P34228 YSC84YHR016C 1407 nt10.33□□□□□ -0.76
SEF1P34228 CWP1YKL096W 720 nt10.32□□□□□ -0.76
SEF1P34228 ADH2YMR303C 1047 nt10.31□□□□□ -0.76
SEF1P34228 RRT12YCR045C 1476 nt10.3□□□□□ -0.76
SEF1P34228 YHL050CYHL050C 2094 nt10.29□□□□□ -0.76
SEF1P34228 YFR018CYFR018C 1092 nt10.29□□□□□ -0.76
SEF1P34228 SEC11YIR022W 504 nt10.29□□□□□ -0.76
SEF1P34228 PCM1YEL058W 1674 nt10.27□□□□□ -0.77
SEF1P34228 PCH2YBR186W 1695 nt10.26□□□□□ -0.77
SEF1P34228 GUT2YIL155C 1950 nt10.25□□□□□ -0.77
SEF1P34228 PRE6YOL038W 765 nt10.25□□□□□ -0.77
SEF1P34228 RRT5YFR032C 870 nt10.24□□□□□ -0.77
SEF1P34228 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt10.24□□□□□ -0.77
SEF1P34228 SNF6YHL025W 999 nt10.22□□□□□ -0.77
SEF1P34228 TIM23YNR017W 669 nt10.22□□□□□ -0.77
SEF1P34228 DIC1YLR348C 897 nt10.21□□□□□ -0.77
SEF1P34228 YIH1YCR059C 777 nt10.15□□□□□ -0.78
SEF1P34228 RNQ1YCL028W 1218 nt10.14□□□□□ -0.79
SEF1P34228 YLR179CYLR179C 606 nt10.13□□□□□ -0.79
SEF1P34228 PIB2YGL023C 1908 nt10.12□□□□□ -0.79
SEF1P34228 BIO4YNR057C 714 nt10.09□□□□□ -0.79
SEF1P34228 YPR064WYPR064W 420 nt10.09□□□□□ -0.79
SEF1P34228 SIM1YIL123W 1431 nt10.08□□□□□ -0.8
SEF1P34228 WSC2YNL283C 1512 nt10.08□□□□□ -0.8
SEF1P34228 RDN37-1RDN37-1 5354 nt10.07□□□□□ -0.8
SEF1P34228 RDN37-2RDN37-2 5354 nt10.07□□□□□ -0.8
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