Protein–RNA interactions for Protein: P34220

YBL055C, Deoxyribonuclease Tat-D, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YBL055CP34220 TAT1YBR069C 1860 nt12.91□□□□□ -0.34
YBL055CP34220 YOL037CYOL037C 354 nt12.9□□□□□ -0.34
YBL055CP34220 ART5YGR068C 1761 nt12.89□□□□□ -0.35
YBL055CP34220 NPL3YDR432W 1245 nt12.86□□□□□ -0.35
YBL055CP34220 YBR220CYBR220C 1683 nt12.86□□□□□ -0.35
YBL055CP34220 GFD2YCL036W 1701 nt12.85□□□□□ -0.35
YBL055CP34220 IRC15YPL017C 1500 nt12.82□□□□□ -0.36
YBL055CP34220 SDH1YKL148C 1923 nt12.8□□□□□ -0.36
YBL055CP34220 TIR4YOR009W 1464 nt12.8□□□□□ -0.36
YBL055CP34220 PET9YBL030C 957 nt12.79□□□□□ -0.36
YBL055CP34220 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt12.74□□□□□ -0.37
YBL055CP34220 GIS3YLR094C 1509 nt12.73□□□□□ -0.37
YBL055CP34220 YCH1YGR203W 447 nt12.73□□□□□ -0.37
YBL055CP34220 RTS2YOR077W 699 nt12.73□□□□□ -0.37
YBL055CP34220 SCC4YER147C 1875 nt12.7□□□□□ -0.38
YBL055CP34220 YJL152WYJL152W 360 nt12.7□□□□□ -0.38
YBL055CP34220 YMR057CYMR057C 372 nt12.69□□□□□ -0.38
YBL055CP34220 YLR281CYLR281C 468 nt12.65□□□□□ -0.38
YBL055CP34220 WHI5YOR083W 888 nt12.65□□□□□ -0.38
YBL055CP34220 CUE1YMR264W 612 nt12.6□□□□□ -0.39
YBL055CP34220 FPS1YLL043W 2010 nt12.54□□□□□ -0.4
YBL055CP34220 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt12.49□□□□□ -0.41
YBL055CP34220 PUS2YGL063W 1113 nt12.47□□□□□ -0.41
YBL055CP34220 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt12.46□□□□□ -0.41
YBL055CP34220 IMT4tM(CAU)E 72 nt12.46□□□□□ -0.41
YBL055CP34220 IMT3tM(CAU)J3 72 nt12.46□□□□□ -0.41
YBL055CP34220 IMT1tM(CAU)O1 72 nt12.46□□□□□ -0.41
YBL055CP34220 IMT2tM(CAU)P 72 nt12.46□□□□□ -0.41
YBL055CP34220 YIL100WYIL100W 354 nt12.44□□□□□ -0.42
YBL055CP34220 YLR236CYLR236C 324 nt12.43□□□□□ -0.42
YBL055CP34220 PCH2YBR186W 1695 nt12.42□□□□□ -0.42
YBL055CP34220 PAC11YDR488C 1602 nt12.42□□□□□ -0.42
YBL055CP34220 YSC84YHR016C 1407 nt12.42□□□□□ -0.42
YBL055CP34220 SEC11YIR022W 504 nt12.4□□□□□ -0.42
YBL055CP34220 IDH1YNL037C 1083 nt12.38□□□□□ -0.43
YBL055CP34220 RRT12YCR045C 1476 nt12.38□□□□□ -0.43
YBL055CP34220 GUT2YIL155C 1950 nt12.38□□□□□ -0.43
YBL055CP34220 YHL050CYHL050C 2094 nt12.36□□□□□ -0.43
YBL055CP34220 DSK2YMR276W 1122 nt12.35□□□□□ -0.43
YBL055CP34220 IMP2'YIL154C 1041 nt12.34□□□□□ -0.43
YBL055CP34220 GBP2YCL011C 1284 nt12.34□□□□□ -0.43
YBL055CP34220 YNL195CYNL195C 786 nt12.33□□□□□ -0.44
YBL055CP34220 YPR011CYPR011C 981 nt12.32□□□□□ -0.44
YBL055CP34220 RRD1YIL153W 1182 nt12.26□□□□□ -0.45
YBL055CP34220 TCD2YKL027W 1344 nt12.21□□□□□ -0.45
YBL055CP34220 DED1YOR204W 1815 nt12.21□□□□□ -0.46
YBL055CP34220 YDR433WYDR433W 441 nt12.2□□□□□ -0.46
YBL055CP34220 FMP45YDL222C 930 nt12.19□□□□□ -0.46
YBL055CP34220 PIB2YGL023C 1908 nt12.17□□□□□ -0.46
YBL055CP34220 MXR2YCL033C 507 nt12.15□□□□□ -0.46
YBL055CP34220 LPX1YOR084W 1164 nt12.14□□□□□ -0.47
YBL055CP34220 ERV46YAL042W 1248 nt12.12□□□□□ -0.47
YBL055CP34220 FMT1YBL013W 1206 nt12.12□□□□□ -0.47
YBL055CP34220 FMP52YER004W 696 nt12.09□□□□□ -0.47
YBL055CP34220 RTF1YGL244W 1677 nt12.09□□□□□ -0.47
YBL055CP34220 YKR040CYKR040C 504 nt12.06□□□□□ -0.48
YBL055CP34220 BOP3YNL042W 1191 nt12.04□□□□□ -0.48
YBL055CP34220 PCM1YEL058W 1674 nt12.03□□□□□ -0.48
YBL055CP34220 CWP1YKL096W 720 nt12.01□□□□□ -0.49
YBL055CP34220 ADH2YMR303C 1047 nt12□□□□□ -0.49
YBL055CP34220 NCP1YHR042W 2076 nt11.99□□□□□ -0.49
YBL055CP34220 LCB1YMR296C 1677 nt11.97□□□□□ -0.49
YBL055CP34220 SOR2YDL246C 1074 nt11.97□□□□□ -0.49
YBL055CP34220 SOR1YJR159W 1074 nt11.97□□□□□ -0.49
YBL055CP34220 YCL042WYCL042W 360 nt11.97□□□□□ -0.49
YBL055CP34220 FRD1YEL047C 1413 nt11.94□□□□□ -0.5
YBL055CP34220 Q0182Q0182 405 nt11.93□□□□□ -0.5
YBL055CP34220 NVJ2YPR091C 2313 nt11.92□□□□□ -0.5
YBL055CP34220 SNF6YHL025W 999 nt11.92□□□□□ -0.5
YBL055CP34220 PTK1YKL198C 1989 nt11.91□□□□□ -0.5
YBL055CP34220 SIM1YIL123W 1431 nt11.91□□□□□ -0.5
YBL055CP34220 MOT3YMR070W 1473 nt11.86□□□□□ -0.51
YBL055CP34220 BIO4YNR057C 714 nt11.84□□□□□ -0.51
YBL055CP34220 SPP1YPL138C 1062 nt11.84□□□□□ -0.51
YBL055CP34220 YIH1YCR059C 777 nt11.78□□□□□ -0.52
YBL055CP34220 RNQ1YCL028W 1218 nt11.75□□□□□ -0.53
YBL055CP34220 YLL053CYLL053C 459 nt11.72□□□□□ -0.53
YBL055CP34220 LYS4YDR234W 2082 nt11.72□□□□□ -0.53
YBL055CP34220 PTH1YHR189W 573 nt11.71□□□□□ -0.53
YBL055CP34220 YFL054CYFL054C 1941 nt11.7□□□□□ -0.54
YBL055CP34220 DIC1YLR348C 897 nt11.7□□□□□ -0.54
YBL055CP34220 ERF2YLR246W 1080 nt11.66□□□□□ -0.54
YBL055CP34220 FTR1YER145C 1215 nt11.62□□□□□ -0.55
YBL055CP34220 CRR1YLR213C 1269 nt11.62□□□□□ -0.55
YBL055CP34220 YLR235CYLR235C 399 nt11.62□□□□□ -0.55
YBL055CP34220 ATF2YGR177C 1608 nt11.6□□□□□ -0.55
YBL055CP34220 SPT8YLR055C 1809 nt11.59□□□□□ -0.55
YBL055CP34220 GAL1YBR020W 1587 nt11.58□□□□□ -0.56
YBL055CP34220 TRM5YHR070W 1500 nt11.57□□□□□ -0.56
YBL055CP34220 TIM23YNR017W 669 nt11.56□□□□□ -0.56
YBL055CP34220 YFL067WYFL067W 528 nt11.54□□□□□ -0.56
YBL055CP34220 MIC10YCL057C-A 294 nt11.53□□□□□ -0.56
YBL055CP34220 HEM12YDR047W 1089 nt11.52□□□□□ -0.57
YBL055CP34220 YKL030WYKL030W 606 nt11.52□□□□□ -0.57
YBL055CP34220 YLR179CYLR179C 606 nt11.52□□□□□ -0.57
YBL055CP34220 DDR2YOL052C-A 186 nt11.52□□□□□ -0.57
YBL055CP34220 RTG1YOL067C 534 nt11.5□□□□□ -0.57
YBL055CP34220 SNG1YGR197C 1644 nt11.49□□□□□ -0.57
YBL055CP34220 AQY1YPR192W 918 nt11.48□□□□□ -0.57
YBL055CP34220 BOR1YNL275W 1731 nt11.47□□□□□ -0.57
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