Protein–RNA interactions for Protein: P34072

MKS1, Negative regulator of RAS-cAMP pathway, yeastyeast

Predictions only

Length 584 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
MKS1P34072 TRM9YML014W 840 nt11.11□□□□□ -0.63
MKS1P34072 YBR220CYBR220C 1683 nt11.1□□□□□ -0.63
MKS1P34072 ALF1YNL148C 765 nt11.08□□□□□ -0.64
MKS1P34072 EMI2YDR516C 1503 nt11.06□□□□□ -0.64
MKS1P34072 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt11.06□□□□□ -0.64
MKS1P34072 LSM3YLR438C-A 270 nt11.06□□□□□ -0.64
MKS1P34072 PTP1YDL230W 1008 nt11.04□□□□□ -0.64
MKS1P34072 YLR122CYLR122C 378 nt11.04□□□□□ -0.64
MKS1P34072 SRN2YLR119W 642 nt11.02□□□□□ -0.65
MKS1P34072 CCT6YDR188W 1641 nt11.02□□□□□ -0.65
MKS1P34072 YIR018C-AYIR018C-A 138 nt11.01□□□□□ -0.65
MKS1P34072 RPP2AYOL039W 321 nt11.01□□□□□ -0.65
MKS1P34072 CAC2YML102W 1407 nt11.01□□□□□ -0.65
MKS1P34072 YGR021WYGR021W 873 nt11□□□□□ -0.65
MKS1P34072 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt10.99□□□□□ -0.65
MKS1P34072 HOM6YJR139C 1080 nt10.99□□□□□ -0.65
MKS1P34072 YDR509WYDR509W 348 nt10.96□□□□□ -0.65
MKS1P34072 YDL221WYDL221W 552 nt10.95□□□□□ -0.66
MKS1P34072 SIS1YNL007C 1059 nt10.95□□□□□ -0.66
MKS1P34072 YMR090WYMR090W 684 nt10.94□□□□□ -0.66
MKS1P34072 ABZ2YMR289W 1125 nt10.94□□□□□ -0.66
MKS1P34072 SDH1YKL148C 1923 nt10.92□□□□□ -0.66
MKS1P34072 MNP1YGL068W 585 nt10.92□□□□□ -0.66
MKS1P34072 SUF2tP(AGG)C 72 nt10.92□□□□□ -0.66
MKS1P34072 SUF10tP(AGG)N 72 nt10.92□□□□□ -0.66
MKS1P34072 YKL097CYKL097C 411 nt10.88□□□□□ -0.67
MKS1P34072 IRC15YPL017C 1500 nt10.84□□□□□ -0.67
MKS1P34072 RKM5YLR137W 1104 nt10.83□□□□□ -0.68
MKS1P34072 ART5YGR068C 1761 nt10.82□□□□□ -0.68
MKS1P34072 PCH2YBR186W 1695 nt10.81□□□□□ -0.68
MKS1P34072 GUT2YIL155C 1950 nt10.81□□□□□ -0.68
MKS1P34072 GFD2YCL036W 1701 nt10.8□□□□□ -0.68
MKS1P34072 Q0144Q0144 330 nt10.79□□□□□ -0.68
MKS1P34072 LCP5YER127W 1074 nt10.77□□□□□ -0.69
MKS1P34072 TOM20YGR082W 552 nt10.77□□□□□ -0.69
MKS1P34072 SCC4YER147C 1875 nt10.76□□□□□ -0.69
MKS1P34072 GIS3YLR094C 1509 nt10.76□□□□□ -0.69
MKS1P34072 SEM1YDR363W-A 270 nt10.76□□□□□ -0.69
MKS1P34072 RTS2YOR077W 699 nt10.72□□□□□ -0.69
MKS1P34072 PIB2YGL023C 1908 nt10.72□□□□□ -0.69
MKS1P34072 PET9YBL030C 957 nt10.71□□□□□ -0.69
MKS1P34072 TIR4YOR009W 1464 nt10.7□□□□□ -0.7
MKS1P34072 ARP10YDR106W 855 nt10.7□□□□□ -0.7
MKS1P34072 URH1YDR400W 1023 nt10.7□□□□□ -0.7
MKS1P34072 SEC11YIR022W 504 nt10.7□□□□□ -0.7
MKS1P34072 UME6YDR207C 2511 nt10.66□□□□□ -0.7
MKS1P34072 YJL225CYJL225C 5277 nt10.66□□□□□ -0.7
MKS1P34072 YCH1YGR203W 447 nt10.63□□□□□ -0.71
MKS1P34072 AI5_BETAQ0075 1065 nt10.62□□□□□ -0.71
MKS1P34072 YMR057CYMR057C 372 nt10.62□□□□□ -0.71
MKS1P34072 NPL3YDR432W 1245 nt10.61□□□□□ -0.71
MKS1P34072 YHL050CYHL050C 2094 nt10.59□□□□□ -0.71
MKS1P34072 CUE1YMR264W 612 nt10.58□□□□□ -0.72
MKS1P34072 YSC84YHR016C 1407 nt10.58□□□□□ -0.72
MKS1P34072 YOL037CYOL037C 354 nt10.57□□□□□ -0.72
MKS1P34072 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt10.55□□□□□ -0.72
MKS1P34072 UTP6YDR449C 1323 nt10.54□□□□□ -0.72
MKS1P34072 YJL152WYJL152W 360 nt10.53□□□□□ -0.72
MKS1P34072 YOR139CYOR139C 393 nt10.53□□□□□ -0.72
MKS1P34072 VAR1Q0140 1197 nt10.51□□□□□ -0.73
MKS1P34072 YJL118WYJL118W 660 nt10.51□□□□□ -0.73
MKS1P34072 RRT12YCR045C 1476 nt10.49□□□□□ -0.73
MKS1P34072 HMT1YBR034C 1047 nt10.46□□□□□ -0.73
MKS1P34072 RTF1YGL244W 1677 nt10.45□□□□□ -0.74
MKS1P34072 YIL100WYIL100W 354 nt10.44□□□□□ -0.74
MKS1P34072 YPL071CYPL071C 471 nt10.43□□□□□ -0.74
MKS1P34072 PET20YPL159C 762 nt10.43□□□□□ -0.74
MKS1P34072 YNL067W-AYNL067W-A 147 nt10.42□□□□□ -0.74
MKS1P34072 PTK1YKL198C 1989 nt10.41□□□□□ -0.74
MKS1P34072 YJR154WYJR154W 1041 nt10.4□□□□□ -0.74
MKS1P34072 YLR236CYLR236C 324 nt10.4□□□□□ -0.74
MKS1P34072 WHI5YOR083W 888 nt10.4□□□□□ -0.74
MKS1P34072 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt10.4□□□□□ -0.74
MKS1P34072 YNL195CYNL195C 786 nt10.39□□□□□ -0.75
MKS1P34072 BOR1YNL275W 1731 nt10.38□□□□□ -0.75
MKS1P34072 YLR281CYLR281C 468 nt10.37□□□□□ -0.75
MKS1P34072 YCR099CYCR099C 468 nt10.36□□□□□ -0.75
MKS1P34072 SKG1YKR100C 1068 nt10.36□□□□□ -0.75
MKS1P34072 YHM2YMR241W 945 nt10.35□□□□□ -0.75
MKS1P34072 snR78snR78 87 nt10.33□□□□□ -0.76
MKS1P34072 BOP3YNL042W 1191 nt10.32□□□□□ -0.76
MKS1P34072 NCP1YHR042W 2076 nt10.32□□□□□ -0.76
MKS1P34072 RDN37-1RDN37-1 5354 nt10.25□□□□□ -0.77
MKS1P34072 RDN37-2RDN37-2 5354 nt10.25□□□□□ -0.77
MKS1P34072 AI3Q0060 1248 nt10.22□□□□□ -0.77
MKS1P34072 IDH1YNL037C 1083 nt10.22□□□□□ -0.77
MKS1P34072 RRD1YIL153W 1182 nt10.21□□□□□ -0.77
MKS1P34072 GBP2YCL011C 1284 nt10.21□□□□□ -0.77
MKS1P34072 YNR068CYNR068C 819 nt10.2□□□□□ -0.78
MKS1P34072 YPL041CYPL041C 624 nt10.2□□□□□ -0.78
MKS1P34072 PUS2YGL063W 1113 nt10.19□□□□□ -0.78
MKS1P34072 PAB1YER165W 1734 nt10.19□□□□□ -0.78
MKS1P34072 MCH5YOR306C 1566 nt10.18□□□□□ -0.78
MKS1P34072 FTH1YBR207W 1398 nt10.17□□□□□ -0.78
MKS1P34072 DED1YOR204W 1815 nt10.17□□□□□ -0.78
MKS1P34072 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt10.14□□□□□ -0.79
MKS1P34072 IMT4tM(CAU)E 72 nt10.14□□□□□ -0.79
MKS1P34072 IMT3tM(CAU)J3 72 nt10.14□□□□□ -0.79
MKS1P34072 IMT1tM(CAU)O1 72 nt10.14□□□□□ -0.79
MKS1P34072 IMT2tM(CAU)P 72 nt10.14□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 42.1 ms