Protein–RNA interactions for Protein: P32338

RME1, Zinc finger protein RME1, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RME1P32338 YPR011CYPR011C 981 nt13.48□□□□□ -0.25
RME1P32338 IMP2'YIL154C 1041 nt13.46□□□□□ -0.25
RME1P32338 YLR236CYLR236C 324 nt13.42□□□□□ -0.26
RME1P32338 YPS1YLR120C 1710 nt13.41□□□□□ -0.26
RME1P32338 YDR095CYDR095C 411 nt13.37□□□□□ -0.27
RME1P32338 YCH1YGR203W 447 nt13.37□□□□□ -0.27
RME1P32338 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt13.36□□□□□ -0.27
RME1P32338 SIS1YNL007C 1059 nt13.28□□□□□ -0.28
RME1P32338 IDH1YNL037C 1083 nt13.28□□□□□ -0.28
RME1P32338 LPX1YOR084W 1164 nt13.22□□□□□ -0.29
RME1P32338 YDR433WYDR433W 441 nt13.21□□□□□ -0.29
RME1P32338 RPP2AYOL039W 321 nt13.18□□□□□ -0.3
RME1P32338 TIR4YOR009W 1464 nt13.17□□□□□ -0.3
RME1P32338 GBP2YCL011C 1284 nt13.14□□□□□ -0.31
RME1P32338 ERV46YAL042W 1248 nt13.13□□□□□ -0.31
RME1P32338 SPP1YPL138C 1062 nt13.11□□□□□ -0.31
RME1P32338 ART5YGR068C 1761 nt13.09□□□□□ -0.31
RME1P32338 MRPL8YJL063C 717 nt13.08□□□□□ -0.32
RME1P32338 SPT5YML010W 3192 nt13.08□□□□□ -0.32
RME1P32338 YKR040CYKR040C 504 nt13.07□□□□□ -0.32
RME1P32338 YMR057CYMR057C 372 nt13.07□□□□□ -0.32
RME1P32338 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt13.06□□□□□ -0.32
RME1P32338 MEP2YNL142W 1500 nt13.05□□□□□ -0.32
RME1P32338 PET9YBL030C 957 nt13.04□□□□□ -0.32
RME1P32338 CAC2YML102W 1407 nt13.04□□□□□ -0.32
RME1P32338 MXR2YCL033C 507 nt13.03□□□□□ -0.32
RME1P32338 PTP1YDL230W 1008 nt13.01□□□□□ -0.33
RME1P32338 ADO1YJR105W 1023 nt12.99□□□□□ -0.33
RME1P32338 SSA4YER103W 1929 nt12.98□□□□□ -0.33
RME1P32338 GFD2YCL036W 1701 nt12.95□□□□□ -0.34
RME1P32338 PAC11YDR488C 1602 nt12.95□□□□□ -0.34
RME1P32338 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt12.94□□□□□ -0.34
RME1P32338 YEL076CYEL076C 651 nt12.94□□□□□ -0.34
RME1P32338 YLR464WYLR464W 651 nt12.94□□□□□ -0.34
RME1P32338 TCD2YKL027W 1344 nt12.93□□□□□ -0.34
RME1P32338 DCW1YKL046C 1350 nt12.88□□□□□ -0.35
RME1P32338 NVJ2YPR091C 2313 nt12.88□□□□□ -0.35
RME1P32338 RTG1YOL067C 534 nt12.87□□□□□ -0.35
RME1P32338 RTS2YOR077W 699 nt12.83□□□□□ -0.36
RME1P32338 UBX6YJL048C 1191 nt12.76□□□□□ -0.37
RME1P32338 EMI2YDR516C 1503 nt12.75□□□□□ -0.37
RME1P32338 HUA1YGR268C 597 nt12.75□□□□□ -0.37
RME1P32338 FPS1YLL043W 2010 nt12.74□□□□□ -0.37
RME1P32338 DED1YOR204W 1815 nt12.72□□□□□ -0.37
RME1P32338 RRD1YIL153W 1182 nt12.71□□□□□ -0.37
RME1P32338 YCL042WYCL042W 360 nt12.71□□□□□ -0.37
RME1P32338 YMR090WYMR090W 684 nt12.7□□□□□ -0.38
RME1P32338 FRD1YEL047C 1413 nt12.7□□□□□ -0.38
RME1P32338 BDF1YLR399C 2061 nt12.69□□□□□ -0.38
RME1P32338 PTH1YHR189W 573 nt12.67□□□□□ -0.38
RME1P32338 IRC15YPL017C 1500 nt12.67□□□□□ -0.38
RME1P32338 YDL221WYDL221W 552 nt12.65□□□□□ -0.38
RME1P32338 CUE1YMR264W 612 nt12.65□□□□□ -0.38
RME1P32338 FMT1YBL013W 1206 nt12.6□□□□□ -0.39
RME1P32338 GIS3YLR094C 1509 nt12.59□□□□□ -0.39
RME1P32338 YIL100WYIL100W 354 nt12.59□□□□□ -0.39
RME1P32338 YKL030WYKL030W 606 nt12.58□□□□□ -0.4
RME1P32338 YLR235CYLR235C 399 nt12.57□□□□□ -0.4
RME1P32338 CWP1YKL096W 720 nt12.54□□□□□ -0.4
RME1P32338 SOR2YDL246C 1074 nt12.51□□□□□ -0.41
RME1P32338 SOR1YJR159W 1074 nt12.51□□□□□ -0.41
RME1P32338 YDR094WYDR094W 336 nt12.5□□□□□ -0.41
RME1P32338 LCB1YMR296C 1677 nt12.48□□□□□ -0.41
RME1P32338 FMP52YER004W 696 nt12.48□□□□□ -0.41
RME1P32338 ADH2YMR303C 1047 nt12.46□□□□□ -0.41
RME1P32338 SCC4YER147C 1875 nt12.44□□□□□ -0.42
RME1P32338 TAT1YBR069C 1860 nt12.43□□□□□ -0.42
RME1P32338 SDH1YKL148C 1923 nt12.42□□□□□ -0.42
RME1P32338 SNF6YHL025W 999 nt12.36□□□□□ -0.43
RME1P32338 TIM23YNR017W 669 nt12.34□□□□□ -0.43
RME1P32338 PCM1YEL058W 1674 nt12.34□□□□□ -0.43
RME1P32338 YBR220CYBR220C 1683 nt12.32□□□□□ -0.44
RME1P32338 DIC1YLR348C 897 nt12.32□□□□□ -0.44
RME1P32338 YNL195CYNL195C 786 nt12.32□□□□□ -0.44
RME1P32338 YLR179CYLR179C 606 nt12.29□□□□□ -0.44
RME1P32338 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt12.26□□□□□ -0.45
RME1P32338 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt12.25□□□□□ -0.45
RME1P32338 YPR064WYPR064W 420 nt12.23□□□□□ -0.45
RME1P32338 RNQ1YCL028W 1218 nt12.22□□□□□ -0.45
RME1P32338 RRT12YCR045C 1476 nt12.17□□□□□ -0.46
RME1P32338 YIH1YCR059C 777 nt12.17□□□□□ -0.46
RME1P32338 RRT5YFR032C 870 nt12.16□□□□□ -0.46
RME1P32338 PAU16YKL224C 372 nt12.15□□□□□ -0.46
RME1P32338 TAD3YLR316C 969 nt12.14□□□□□ -0.47
RME1P32338 YFR018CYFR018C 1092 nt12.12□□□□□ -0.47
RME1P32338 YLL053CYLL053C 459 nt12.09□□□□□ -0.47
RME1P32338 YSC84YHR016C 1407 nt12.09□□□□□ -0.47
RME1P32338 PRE6YOL038W 765 nt12.08□□□□□ -0.48
RME1P32338 SIM1YIL123W 1431 nt12.08□□□□□ -0.48
RME1P32338 AHT1YHR093W 549 nt12.06□□□□□ -0.48
RME1P32338 WSC2YNL283C 1512 nt12.06□□□□□ -0.48
RME1P32338 BIO4YNR057C 714 nt12.03□□□□□ -0.48
RME1P32338 FTR1YER145C 1215 nt12.01□□□□□ -0.49
RME1P32338 AQY1YPR192W 918 nt12□□□□□ -0.49
RME1P32338 YFL066CYFL066C 1179 nt11.99□□□□□ -0.49
RME1P32338 GAL1YBR020W 1587 nt11.98□□□□□ -0.49
RME1P32338 YHL050CYHL050C 2094 nt11.98□□□□□ -0.49
RME1P32338 TRM5YHR070W 1500 nt11.96□□□□□ -0.49
RME1P32338 UME6YDR207C 2511 nt11.96□□□□□ -0.5
RME1P32338 SBA1YKL117W 651 nt11.93□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 16.1 ms