Protein–RNA interactions for Protein: P28272

URA1, Dihydroorotate dehydrogenase (fumarate), yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 314 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
URA1P28272 TIR4YOR009W 1464 nt13.78□□□□□ -0.2
URA1P28272 GFD2YCL036W 1701 nt13.76□□□□□ -0.21
URA1P28272 YDL221WYDL221W 552 nt13.75□□□□□ -0.21
URA1P28272 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt13.71□□□□□ -0.21
URA1P28272 IRC15YPL017C 1500 nt13.7□□□□□ -0.22
URA1P28272 YLR281CYLR281C 468 nt13.68□□□□□ -0.22
URA1P28272 WHI5YOR083W 888 nt13.68□□□□□ -0.22
URA1P28272 YMR090WYMR090W 684 nt13.67□□□□□ -0.22
URA1P28272 RTS2YOR077W 699 nt13.67□□□□□ -0.22
URA1P28272 YBR220CYBR220C 1683 nt13.66□□□□□ -0.22
URA1P28272 YJL152WYJL152W 360 nt13.65□□□□□ -0.22
URA1P28272 PET9YBL030C 957 nt13.65□□□□□ -0.22
URA1P28272 YCH1YGR203W 447 nt13.64□□□□□ -0.23
URA1P28272 YMR057CYMR057C 372 nt13.62□□□□□ -0.23
URA1P28272 SDH1YKL148C 1923 nt13.6□□□□□ -0.23
URA1P28272 GIS3YLR094C 1509 nt13.59□□□□□ -0.23
URA1P28272 BDF1YLR399C 2061 nt13.57□□□□□ -0.24
URA1P28272 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt13.56□□□□□ -0.24
URA1P28272 IMT4tM(CAU)E 72 nt13.56□□□□□ -0.24
URA1P28272 IMT3tM(CAU)J3 72 nt13.56□□□□□ -0.24
URA1P28272 IMT1tM(CAU)O1 72 nt13.56□□□□□ -0.24
URA1P28272 IMT2tM(CAU)P 72 nt13.56□□□□□ -0.24
URA1P28272 Q0182Q0182 405 nt13.54□□□□□ -0.24
URA1P28272 PUS2YGL063W 1113 nt13.53□□□□□ -0.24
URA1P28272 SCC4YER147C 1875 nt13.51□□□□□ -0.25
URA1P28272 FPS1YLL043W 2010 nt13.46□□□□□ -0.25
URA1P28272 CUE1YMR264W 612 nt13.44□□□□□ -0.26
URA1P28272 YLR236CYLR236C 324 nt13.42□□□□□ -0.26
URA1P28272 YPR011CYPR011C 981 nt13.42□□□□□ -0.26
URA1P28272 TAT1YBR069C 1860 nt13.38□□□□□ -0.27
URA1P28272 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt13.38□□□□□ -0.27
URA1P28272 DSK2YMR276W 1122 nt13.36□□□□□ -0.27
URA1P28272 IDH1YNL037C 1083 nt13.32□□□□□ -0.28
URA1P28272 GBP2YCL011C 1284 nt13.28□□□□□ -0.28
URA1P28272 YIL100WYIL100W 354 nt13.25□□□□□ -0.29
URA1P28272 IMP2'YIL154C 1041 nt13.25□□□□□ -0.29
URA1P28272 YSC84YHR016C 1407 nt13.23□□□□□ -0.29
URA1P28272 FMP45YDL222C 930 nt13.21□□□□□ -0.29
URA1P28272 RRT12YCR045C 1476 nt13.21□□□□□ -0.3
URA1P28272 RRD1YIL153W 1182 nt13.2□□□□□ -0.3
URA1P28272 LPX1YOR084W 1164 nt13.19□□□□□ -0.3
URA1P28272 YDR433WYDR433W 441 nt13.18□□□□□ -0.3
URA1P28272 MXR2YCL033C 507 nt13.18□□□□□ -0.3
URA1P28272 YHL050CYHL050C 2094 nt13.17□□□□□ -0.3
URA1P28272 DED1YOR204W 1815 nt13.16□□□□□ -0.3
URA1P28272 TCD2YKL027W 1344 nt13.12□□□□□ -0.31
URA1P28272 ERV46YAL042W 1248 nt13.11□□□□□ -0.31
URA1P28272 PCH2YBR186W 1695 nt13.08□□□□□ -0.31
URA1P28272 SEC11YIR022W 504 nt13.08□□□□□ -0.32
URA1P28272 FMT1YBL013W 1206 nt13.07□□□□□ -0.32
URA1P28272 YNL195CYNL195C 786 nt13.07□□□□□ -0.32
URA1P28272 GUT2YIL155C 1950 nt13.03□□□□□ -0.32
URA1P28272 YKR040CYKR040C 504 nt13□□□□□ -0.33
URA1P28272 MOT3YMR070W 1473 nt12.96□□□□□ -0.34
URA1P28272 FMP52YER004W 696 nt12.93□□□□□ -0.34
URA1P28272 SPP1YPL138C 1062 nt12.93□□□□□ -0.34
URA1P28272 FRD1YEL047C 1413 nt12.91□□□□□ -0.34
URA1P28272 CWP1YKL096W 720 nt12.91□□□□□ -0.34
URA1P28272 ADH2YMR303C 1047 nt12.91□□□□□ -0.34
URA1P28272 PIB2YGL023C 1908 nt12.89□□□□□ -0.35
URA1P28272 SOR2YDL246C 1074 nt12.88□□□□□ -0.35
URA1P28272 SOR1YJR159W 1074 nt12.88□□□□□ -0.35
URA1P28272 PCM1YEL058W 1674 nt12.88□□□□□ -0.35
URA1P28272 YCL042WYCL042W 360 nt12.84□□□□□ -0.35
URA1P28272 LCB1YMR296C 1677 nt12.81□□□□□ -0.36
URA1P28272 RTF1YGL244W 1677 nt12.8□□□□□ -0.36
URA1P28272 NCP1YHR042W 2076 nt12.78□□□□□ -0.36
URA1P28272 SNF6YHL025W 999 nt12.78□□□□□ -0.36
URA1P28272 BOP3YNL042W 1191 nt12.73□□□□□ -0.37
URA1P28272 SIM1YIL123W 1431 nt12.72□□□□□ -0.37
URA1P28272 PTH1YHR189W 573 nt12.7□□□□□ -0.38
URA1P28272 BIO4YNR057C 714 nt12.7□□□□□ -0.38
URA1P28272 PTK1YKL198C 1989 nt12.65□□□□□ -0.38
URA1P28272 YIH1YCR059C 777 nt12.64□□□□□ -0.39
URA1P28272 DIC1YLR348C 897 nt12.6□□□□□ -0.39
URA1P28272 RNQ1YCL028W 1218 nt12.6□□□□□ -0.39
URA1P28272 YLL053CYLL053C 459 nt12.58□□□□□ -0.4
URA1P28272 RTG1YOL067C 534 nt12.55□□□□□ -0.4
URA1P28272 LYS4YDR234W 2082 nt12.53□□□□□ -0.4
URA1P28272 YLR235CYLR235C 399 nt12.51□□□□□ -0.41
URA1P28272 PAC11YDR488C 1602 nt12.46□□□□□ -0.41
URA1P28272 ATF2YGR177C 1608 nt12.45□□□□□ -0.42
URA1P28272 FTR1YER145C 1215 nt12.45□□□□□ -0.42
URA1P28272 TIM23YNR017W 669 nt12.45□□□□□ -0.42
URA1P28272 YKL030WYKL030W 606 nt12.44□□□□□ -0.42
URA1P28272 CRR1YLR213C 1269 nt12.44□□□□□ -0.42
URA1P28272 ERF2YLR246W 1080 nt12.43□□□□□ -0.42
URA1P28272 GAL1YBR020W 1587 nt12.43□□□□□ -0.42
URA1P28272 TRM5YHR070W 1500 nt12.42□□□□□ -0.42
URA1P28272 YFL054CYFL054C 1941 nt12.41□□□□□ -0.42
URA1P28272 YLR179CYLR179C 606 nt12.4□□□□□ -0.42
URA1P28272 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt12.39□□□□□ -0.43
URA1P28272 YEL076CYEL076C 651 nt12.39□□□□□ -0.43
URA1P28272 YLR464WYLR464W 651 nt12.39□□□□□ -0.43
URA1P28272 MIC10YCL057C-A 294 nt12.37□□□□□ -0.43
URA1P28272 WSC2YNL283C 1512 nt12.33□□□□□ -0.44
URA1P28272 SNG1YGR197C 1644 nt12.32□□□□□ -0.44
URA1P28272 HEM12YDR047W 1089 nt12.3□□□□□ -0.44
URA1P28272 YFL067WYFL067W 528 nt12.3□□□□□ -0.44
URA1P28272 MRPL8YJL063C 717 nt12.3□□□□□ -0.44
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