Protein–RNA interactions for Protein: P27344

DPB3, DNA polymerase epsilon subunit C, yeastyeast

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
DPB3P27344 ART5YGR068C 1761 nt13.18□□□□□ -0.3
DPB3P27344 GFD2YCL036W 1701 nt13.18□□□□□ -0.3
DPB3P27344 PCH2YBR186W 1695 nt13.18□□□□□ -0.3
DPB3P27344 SEC11YIR022W 504 nt13.16□□□□□ -0.3
DPB3P27344 YGR021WYGR021W 873 nt13.15□□□□□ -0.3
DPB3P27344 RTS2YOR077W 699 nt13.14□□□□□ -0.31
DPB3P27344 GUT2YIL155C 1950 nt13.11□□□□□ -0.31
DPB3P27344 PAC11YDR488C 1602 nt13.1□□□□□ -0.31
DPB3P27344 HOM6YJR139C 1080 nt13.08□□□□□ -0.32
DPB3P27344 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt13.07□□□□□ -0.32
DPB3P27344 SHU1YHL006C 453 nt13.06□□□□□ -0.32
DPB3P27344 YSC84YHR016C 1407 nt13.05□□□□□ -0.32
DPB3P27344 PET9YBL030C 957 nt13.05□□□□□ -0.32
DPB3P27344 MNP1YGL068W 585 nt12.97□□□□□ -0.33
DPB3P27344 CUE1YMR264W 612 nt12.96□□□□□ -0.33
DPB3P27344 TIR4YOR009W 1464 nt12.96□□□□□ -0.34
DPB3P27344 YCH1YGR203W 447 nt12.95□□□□□ -0.34
DPB3P27344 YHL050CYHL050C 2094 nt12.94□□□□□ -0.34
DPB3P27344 RRT12YCR045C 1476 nt12.91□□□□□ -0.34
DPB3P27344 RKM5YLR137W 1104 nt12.9□□□□□ -0.34
DPB3P27344 YMR057CYMR057C 372 nt12.9□□□□□ -0.34
DPB3P27344 PIB2YGL023C 1908 nt12.88□□□□□ -0.35
DPB3P27344 YNL195CYNL195C 786 nt12.84□□□□□ -0.35
DPB3P27344 YIL100WYIL100W 354 nt12.83□□□□□ -0.36
DPB3P27344 RTF1YGL244W 1677 nt12.83□□□□□ -0.36
DPB3P27344 FPS1YLL043W 2010 nt12.78□□□□□ -0.36
DPB3P27344 BOP3YNL042W 1191 nt12.74□□□□□ -0.37
DPB3P27344 YLR236CYLR236C 324 nt12.73□□□□□ -0.37
DPB3P27344 NPL3YDR432W 1245 nt12.71□□□□□ -0.37
DPB3P27344 YJL152WYJL152W 360 nt12.7□□□□□ -0.38
DPB3P27344 YKL097CYKL097C 411 nt12.66□□□□□ -0.38
DPB3P27344 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt12.64□□□□□ -0.39
DPB3P27344 PTK1YKL198C 1989 nt12.62□□□□□ -0.39
DPB3P27344 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt12.62□□□□□ -0.39
DPB3P27344 NCP1YHR042W 2076 nt12.52□□□□□ -0.4
DPB3P27344 NVJ2YPR091C 2313 nt12.51□□□□□ -0.41
DPB3P27344 YOL037CYOL037C 354 nt12.5□□□□□ -0.41
DPB3P27344 YFL054CYFL054C 1941 nt12.41□□□□□ -0.42
DPB3P27344 LCB1YMR296C 1677 nt12.4□□□□□ -0.42
DPB3P27344 YJL225CYJL225C 5277 nt12.33□□□□□ -0.44
DPB3P27344 RRD1YIL153W 1182 nt12.32□□□□□ -0.44
DPB3P27344 WHI5YOR083W 888 nt12.32□□□□□ -0.44
DPB3P27344 SPT8YLR055C 1809 nt12.3□□□□□ -0.44
DPB3P27344 IDH1YNL037C 1083 nt12.27□□□□□ -0.45
DPB3P27344 GBP2YCL011C 1284 nt12.26□□□□□ -0.45
DPB3P27344 RDN37-1RDN37-1 5354 nt12.25□□□□□ -0.45
DPB3P27344 RDN37-2RDN37-2 5354 nt12.25□□□□□ -0.45
DPB3P27344 YLR281CYLR281C 468 nt12.25□□□□□ -0.45
DPB3P27344 YOR139CYOR139C 393 nt12.25□□□□□ -0.45
DPB3P27344 SIM1YIL123W 1431 nt12.23□□□□□ -0.45
DPB3P27344 FMP52YER004W 696 nt12.23□□□□□ -0.45
DPB3P27344 PCM1YEL058W 1674 nt12.22□□□□□ -0.45
DPB3P27344 TCD2YKL027W 1344 nt12.19□□□□□ -0.46
DPB3P27344 DED1YOR204W 1815 nt12.19□□□□□ -0.46
DPB3P27344 FMT1YBL013W 1206 nt12.14□□□□□ -0.47
DPB3P27344 BOR1YNL275W 1731 nt12.14□□□□□ -0.47
DPB3P27344 LYS4YDR234W 2082 nt12.12□□□□□ -0.47
DPB3P27344 CWP1YKL096W 720 nt12.1□□□□□ -0.47
DPB3P27344 ADH2YMR303C 1047 nt12.1□□□□□ -0.47
DPB3P27344 SWE1YJL187C 2460 nt12.09□□□□□ -0.47
DPB3P27344 BIO4YNR057C 714 nt12.09□□□□□ -0.47
DPB3P27344 SNF6YHL025W 999 nt12.08□□□□□ -0.48
DPB3P27344 YDR433WYDR433W 441 nt12.02□□□□□ -0.49
DPB3P27344 IMP2'YIL154C 1041 nt12.02□□□□□ -0.49
DPB3P27344 PUS2YGL063W 1113 nt12□□□□□ -0.49
DPB3P27344 DSK2YMR276W 1122 nt12□□□□□ -0.49
DPB3P27344 MXR2YCL033C 507 nt12□□□□□ -0.49
DPB3P27344 ERF2YLR246W 1080 nt11.95□□□□□ -0.5
DPB3P27344 SOR2YDL246C 1074 nt11.94□□□□□ -0.5
DPB3P27344 SOR1YJR159W 1074 nt11.94□□□□□ -0.5
DPB3P27344 FMP45YDL222C 930 nt11.93□□□□□ -0.5
DPB3P27344 YCL042WYCL042W 360 nt11.93□□□□□ -0.5
DPB3P27344 HSP60YLR259C 1719 nt11.91□□□□□ -0.5
DPB3P27344 CRR1YLR213C 1269 nt11.91□□□□□ -0.5
DPB3P27344 YPR011CYPR011C 981 nt11.91□□□□□ -0.5
DPB3P27344 YIH1YCR059C 777 nt11.89□□□□□ -0.51
DPB3P27344 YLL053CYLL053C 459 nt11.87□□□□□ -0.51
DPB3P27344 RPM1RPM1 483 nt11.86□□□□□ -0.51
DPB3P27344 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt11.85□□□□□ -0.51
DPB3P27344 RNQ1YCL028W 1218 nt11.83□□□□□ -0.52
DPB3P27344 HEM12YDR047W 1089 nt11.82□□□□□ -0.52
DPB3P27344 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt11.82□□□□□ -0.52
DPB3P27344 IMT4tM(CAU)E 72 nt11.82□□□□□ -0.52
DPB3P27344 IMT3tM(CAU)J3 72 nt11.82□□□□□ -0.52
DPB3P27344 IMT1tM(CAU)O1 72 nt11.82□□□□□ -0.52
DPB3P27344 IMT2tM(CAU)P 72 nt11.82□□□□□ -0.52
DPB3P27344 LPX1YOR084W 1164 nt11.82□□□□□ -0.52
DPB3P27344 MIC10YCL057C-A 294 nt11.82□□□□□ -0.52
DPB3P27344 GLK1YCL040W 1503 nt11.81□□□□□ -0.52
DPB3P27344 FRD1YEL047C 1413 nt11.8□□□□□ -0.52
DPB3P27344 ATF2YGR177C 1608 nt11.8□□□□□ -0.52
DPB3P27344 ERV46YAL042W 1248 nt11.8□□□□□ -0.52
DPB3P27344 YKR040CYKR040C 504 nt11.79□□□□□ -0.52
DPB3P27344 FUR4YBR021W 1902 nt11.76□□□□□ -0.53
DPB3P27344 RAX1YOR301W 1308 nt11.76□□□□□ -0.53
DPB3P27344 CCA1YER168C 1641 nt11.75□□□□□ -0.53
DPB3P27344 SNG1YGR197C 1644 nt11.75□□□□□ -0.53
DPB3P27344 FTR1YER145C 1215 nt11.73□□□□□ -0.53
DPB3P27344 YFL067WYFL067W 528 nt11.73□□□□□ -0.53
DPB3P27344 TRM5YHR070W 1500 nt11.7□□□□□ -0.54
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