Protein–RNA interactions for Protein: P25587

LDB16, Protein LDB16, yeastyeast

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
LDB16P25587 CCT6YDR188W 1641 nt11.31□□□□□ -0.6
LDB16P25587 ADO1YJR105W 1023 nt11.25□□□□□ -0.61
LDB16P25587 SUF2tP(AGG)C 72 nt11.24□□□□□ -0.61
LDB16P25587 SUF10tP(AGG)N 72 nt11.24□□□□□ -0.61
LDB16P25587 ALF1YNL148C 765 nt11.19□□□□□ -0.62
LDB16P25587 YJL152WYJL152W 360 nt11.16□□□□□ -0.62
LDB16P25587 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt11.15□□□□□ -0.62
LDB16P25587 YEL076CYEL076C 651 nt11.15□□□□□ -0.62
LDB16P25587 YLR464WYLR464W 651 nt11.15□□□□□ -0.62
LDB16P25587 ERV46YAL042W 1248 nt11.14□□□□□ -0.63
LDB16P25587 LPX1YOR084W 1164 nt11.14□□□□□ -0.63
LDB16P25587 IDH1YNL037C 1083 nt11.13□□□□□ -0.63
LDB16P25587 UBX6YJL048C 1191 nt11.05□□□□□ -0.64
LDB16P25587 SPP1YPL138C 1062 nt11.05□□□□□ -0.64
LDB16P25587 YDR433WYDR433W 441 nt11.04□□□□□ -0.64
LDB16P25587 SIS1YNL007C 1059 nt11.03□□□□□ -0.64
LDB16P25587 RTG1YOL067C 534 nt11.03□□□□□ -0.64
LDB16P25587 YKR040CYKR040C 504 nt11.02□□□□□ -0.65
LDB16P25587 YDR095CYDR095C 411 nt10.98□□□□□ -0.65
LDB16P25587 YPS1YLR120C 1710 nt10.96□□□□□ -0.65
LDB16P25587 GBP2YCL011C 1284 nt10.95□□□□□ -0.66
LDB16P25587 HUA1YGR268C 597 nt10.91□□□□□ -0.66
LDB16P25587 TIR4YOR009W 1464 nt10.88□□□□□ -0.67
LDB16P25587 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt10.86□□□□□ -0.67
LDB16P25587 MXR2YCL033C 507 nt10.86□□□□□ -0.67
LDB16P25587 YDR094WYDR094W 336 nt10.83□□□□□ -0.68
LDB16P25587 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt10.81□□□□□ -0.68
LDB16P25587 CAC2YML102W 1407 nt10.8□□□□□ -0.68
LDB16P25587 RPP2AYOL039W 321 nt10.79□□□□□ -0.68
LDB16P25587 TCD2YKL027W 1344 nt10.78□□□□□ -0.68
LDB16P25587 PET9YBL030C 957 nt10.74□□□□□ -0.69
LDB16P25587 YMR057CYMR057C 372 nt10.72□□□□□ -0.69
LDB16P25587 ART5YGR068C 1761 nt10.71□□□□□ -0.69
LDB16P25587 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt10.69□□□□□ -0.7
LDB16P25587 FRD1YEL047C 1413 nt10.64□□□□□ -0.71
LDB16P25587 PTP1YDL230W 1008 nt10.63□□□□□ -0.71
LDB16P25587 GFD2YCL036W 1701 nt10.62□□□□□ -0.71
LDB16P25587 YKL030WYKL030W 606 nt10.62□□□□□ -0.71
LDB16P25587 YLR235CYLR235C 399 nt10.61□□□□□ -0.71
LDB16P25587 YCL042WYCL042W 360 nt10.6□□□□□ -0.71
LDB16P25587 PTH1YHR189W 573 nt10.59□□□□□ -0.71
LDB16P25587 DED1YOR204W 1815 nt10.56□□□□□ -0.72
LDB16P25587 MEP2YNL142W 1500 nt10.55□□□□□ -0.72
LDB16P25587 RRD1YIL153W 1182 nt10.55□□□□□ -0.72
LDB16P25587 SOR2YDL246C 1074 nt10.52□□□□□ -0.73
LDB16P25587 SOR1YJR159W 1074 nt10.52□□□□□ -0.73
LDB16P25587 LCB1YMR296C 1677 nt10.48□□□□□ -0.73
LDB16P25587 FPS1YLL043W 2010 nt10.48□□□□□ -0.73
LDB16P25587 FMT1YBL013W 1206 nt10.44□□□□□ -0.74
LDB16P25587 RTS2YOR077W 699 nt10.44□□□□□ -0.74
LDB16P25587 FMP52YER004W 696 nt10.41□□□□□ -0.74
LDB16P25587 PAU16YKL224C 372 nt10.41□□□□□ -0.74
LDB16P25587 RRT5YFR032C 870 nt10.4□□□□□ -0.74
LDB16P25587 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt10.4□□□□□ -0.74
LDB16P25587 YFR018CYFR018C 1092 nt10.39□□□□□ -0.75
LDB16P25587 SBA1YKL117W 651 nt10.38□□□□□ -0.75
LDB16P25587 CUE1YMR264W 612 nt10.38□□□□□ -0.75
LDB16P25587 DCW1YKL046C 1350 nt10.37□□□□□ -0.75
LDB16P25587 CWP1YKL096W 720 nt10.35□□□□□ -0.75
LDB16P25587 TIM23YNR017W 669 nt10.35□□□□□ -0.75
LDB16P25587 EMI2YDR516C 1503 nt10.31□□□□□ -0.76
LDB16P25587 IRC15YPL017C 1500 nt10.3□□□□□ -0.76
LDB16P25587 YIL100WYIL100W 354 nt10.29□□□□□ -0.76
LDB16P25587 SPT5YML010W 3192 nt10.28□□□□□ -0.76
LDB16P25587 DIC1YLR348C 897 nt10.28□□□□□ -0.76
LDB16P25587 ADH2YMR303C 1047 nt10.28□□□□□ -0.76
LDB16P25587 YDL221WYDL221W 552 nt10.27□□□□□ -0.77
LDB16P25587 YMR090WYMR090W 684 nt10.27□□□□□ -0.77
LDB16P25587 YPR064WYPR064W 420 nt10.27□□□□□ -0.77
LDB16P25587 YLR179CYLR179C 606 nt10.26□□□□□ -0.77
LDB16P25587 PRE6YOL038W 765 nt10.25□□□□□ -0.77
LDB16P25587 SNF6YHL025W 999 nt10.21□□□□□ -0.77
LDB16P25587 GIS3YLR094C 1509 nt10.21□□□□□ -0.78
LDB16P25587 TAD3YLR316C 969 nt10.2□□□□□ -0.78
LDB16P25587 PCM1YEL058W 1674 nt10.15□□□□□ -0.78
LDB16P25587 RNQ1YCL028W 1218 nt10.15□□□□□ -0.78
LDB16P25587 NAT4YMR069W 858 nt10.13□□□□□ -0.79
LDB16P25587 YIH1YCR059C 777 nt10.12□□□□□ -0.79
LDB16P25587 AHT1YHR093W 549 nt10.12□□□□□ -0.79
LDB16P25587 WSC2YNL283C 1512 nt10.11□□□□□ -0.79
LDB16P25587 PEX25YPL112C 1185 nt10.1□□□□□ -0.79
LDB16P25587 GLK1YCL040W 1503 nt10.07□□□□□ -0.8
LDB16P25587 SCC4YER147C 1875 nt10.06□□□□□ -0.8
LDB16P25587 YFL066CYFL066C 1179 nt10.06□□□□□ -0.8
LDB16P25587 AQY1YPR192W 918 nt10.05□□□□□ -0.8
LDB16P25587 SDH1YKL148C 1923 nt10.03□□□□□ -0.8
LDB16P25587 YNL195CYNL195C 786 nt10.02□□□□□ -0.81
LDB16P25587 YSC84YHR016C 1407 nt9.99□□□□□ -0.81
LDB16P25587 YSP3YOR003W 1437 nt9.99□□□□□ -0.81
LDB16P25587 YNL115CYNL115C 1935 nt9.98□□□□□ -0.81
LDB16P25587 YLR415CYLR415C 339 nt9.98□□□□□ -0.81
LDB16P25587 MSF1YPR047W 1410 nt9.98□□□□□ -0.81
LDB16P25587 YLL053CYLL053C 459 nt9.97□□□□□ -0.81
LDB16P25587 FTR1YER145C 1215 nt9.96□□□□□ -0.82
LDB16P25587 BDH1YAL060W 1149 nt9.96□□□□□ -0.82
LDB16P25587 SSA4YER103W 1929 nt9.93□□□□□ -0.82
LDB16P25587 THI74YDR438W 1113 nt9.92□□□□□ -0.82
LDB16P25587 BIO4YNR057C 714 nt9.91□□□□□ -0.82
LDB16P25587 GAL1YBR020W 1587 nt9.91□□□□□ -0.82
LDB16P25587 YBR220CYBR220C 1683 nt9.9□□□□□ -0.82
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