Protein–RNA interactions for Protein: P13712

MSI1, Chromatin assembly factor 1 subunit p50, yeastyeast

Predictions only

Length 422 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
MSI1P13712 IMT4tM(CAU)E 72 nt10.51□□□□□ -0.73
MSI1P13712 IMT3tM(CAU)J3 72 nt10.51□□□□□ -0.73
MSI1P13712 IMT1tM(CAU)O1 72 nt10.51□□□□□ -0.73
MSI1P13712 IMT2tM(CAU)P 72 nt10.51□□□□□ -0.73
MSI1P13712 BDF1YLR399C 2061 nt10.51□□□□□ -0.73
MSI1P13712 YLR281CYLR281C 468 nt10.49□□□□□ -0.73
MSI1P13712 ART5YGR068C 1761 nt10.48□□□□□ -0.73
MSI1P13712 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt10.47□□□□□ -0.73
MSI1P13712 YMR090WYMR090W 684 nt10.47□□□□□ -0.73
MSI1P13712 WHI5YOR083W 888 nt10.46□□□□□ -0.73
MSI1P13712 YDL221WYDL221W 552 nt10.45□□□□□ -0.74
MSI1P13712 PET9YBL030C 957 nt10.44□□□□□ -0.74
MSI1P13712 GFD2YCL036W 1701 nt10.44□□□□□ -0.74
MSI1P13712 TIR4YOR009W 1464 nt10.43□□□□□ -0.74
MSI1P13712 YCH1YGR203W 447 nt10.42□□□□□ -0.74
MSI1P13712 PUS2YGL063W 1113 nt10.4□□□□□ -0.74
MSI1P13712 IRC15YPL017C 1500 nt10.39□□□□□ -0.75
MSI1P13712 TAT1YBR069C 1860 nt10.38□□□□□ -0.75
MSI1P13712 YJL152WYJL152W 360 nt10.37□□□□□ -0.75
MSI1P13712 YBR220CYBR220C 1683 nt10.37□□□□□ -0.75
MSI1P13712 YMR057CYMR057C 372 nt10.34□□□□□ -0.75
MSI1P13712 SDH1YKL148C 1923 nt10.34□□□□□ -0.75
MSI1P13712 GIS3YLR094C 1509 nt10.31□□□□□ -0.76
MSI1P13712 RTS2YOR077W 699 nt10.28□□□□□ -0.76
MSI1P13712 SCC4YER147C 1875 nt10.27□□□□□ -0.76
MSI1P13712 IMP2'YIL154C 1041 nt10.26□□□□□ -0.77
MSI1P13712 CUE1YMR264W 612 nt10.23□□□□□ -0.77
MSI1P13712 FPS1YLL043W 2010 nt10.23□□□□□ -0.77
MSI1P13712 DSK2YMR276W 1122 nt10.21□□□□□ -0.77
MSI1P13712 YPR011CYPR011C 981 nt10.2□□□□□ -0.78
MSI1P13712 IDH1YNL037C 1083 nt10.18□□□□□ -0.78
MSI1P13712 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt10.18□□□□□ -0.78
MSI1P13712 YLR236CYLR236C 324 nt10.16□□□□□ -0.78
MSI1P13712 MOT3YMR070W 1473 nt10.16□□□□□ -0.78
MSI1P13712 PAC11YDR488C 1602 nt10.14□□□□□ -0.79
MSI1P13712 FMP45YDL222C 930 nt10.12□□□□□ -0.79
MSI1P13712 GBP2YCL011C 1284 nt10.12□□□□□ -0.79
MSI1P13712 YIL100WYIL100W 354 nt10.08□□□□□ -0.8
MSI1P13712 YDR433WYDR433W 441 nt10.03□□□□□ -0.8
MSI1P13712 RRD1YIL153W 1182 nt10.03□□□□□ -0.8
MSI1P13712 ERV46YAL042W 1248 nt10.03□□□□□ -0.8
MSI1P13712 SEC11YIR022W 504 nt10.02□□□□□ -0.81
MSI1P13712 DED1YOR204W 1815 nt10.01□□□□□ -0.81
MSI1P13712 TCD2YKL027W 1344 nt10.01□□□□□ -0.81
MSI1P13712 YSC84YHR016C 1407 nt10□□□□□ -0.81
MSI1P13712 Q0182Q0182 405 nt10□□□□□ -0.81
MSI1P13712 LPX1YOR084W 1164 nt10□□□□□ -0.81
MSI1P13712 NVJ2YPR091C 2313 nt9.99□□□□□ -0.81
MSI1P13712 YHL050CYHL050C 2094 nt9.99□□□□□ -0.81
MSI1P13712 PCH2YBR186W 1695 nt9.99□□□□□ -0.81
MSI1P13712 RRT12YCR045C 1476 nt9.98□□□□□ -0.81
MSI1P13712 YKR040CYKR040C 504 nt9.98□□□□□ -0.81
MSI1P13712 YNL195CYNL195C 786 nt9.98□□□□□ -0.81
MSI1P13712 MXR2YCL033C 507 nt9.97□□□□□ -0.81
MSI1P13712 GUT2YIL155C 1950 nt9.94□□□□□ -0.82
MSI1P13712 FMP52YER004W 696 nt9.92□□□□□ -0.82
MSI1P13712 FMT1YBL013W 1206 nt9.92□□□□□ -0.82
MSI1P13712 YJL225CYJL225C 5277 nt9.91□□□□□ -0.82
MSI1P13712 MRPL8YJL063C 717 nt9.89□□□□□ -0.83
MSI1P13712 FRD1YEL047C 1413 nt9.83□□□□□ -0.84
MSI1P13712 SOR2YDL246C 1074 nt9.82□□□□□ -0.84
MSI1P13712 SOR1YJR159W 1074 nt9.82□□□□□ -0.84
MSI1P13712 PCM1YEL058W 1674 nt9.81□□□□□ -0.84
MSI1P13712 ADH2YMR303C 1047 nt9.81□□□□□ -0.84
MSI1P13712 CWP1YKL096W 720 nt9.8□□□□□ -0.84
MSI1P13712 YCL042WYCL042W 360 nt9.8□□□□□ -0.84
MSI1P13712 SPP1YPL138C 1062 nt9.79□□□□□ -0.84
MSI1P13712 PIB2YGL023C 1908 nt9.78□□□□□ -0.84
MSI1P13712 ADO1YJR105W 1023 nt9.78□□□□□ -0.84
MSI1P13712 NCP1YHR042W 2076 nt9.74□□□□□ -0.85
MSI1P13712 SNF6YHL025W 999 nt9.73□□□□□ -0.85
MSI1P13712 RTF1YGL244W 1677 nt9.72□□□□□ -0.85
MSI1P13712 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt9.72□□□□□ -0.85
MSI1P13712 YEL076CYEL076C 651 nt9.72□□□□□ -0.85
MSI1P13712 YLR464WYLR464W 651 nt9.72□□□□□ -0.85
MSI1P13712 LCB1YMR296C 1677 nt9.71□□□□□ -0.86
MSI1P13712 BOP3YNL042W 1191 nt9.7□□□□□ -0.86
MSI1P13712 RTG1YOL067C 534 nt9.69□□□□□ -0.86
MSI1P13712 SIM1YIL123W 1431 nt9.67□□□□□ -0.86
MSI1P13712 YIH1YCR059C 777 nt9.65□□□□□ -0.86
MSI1P13712 RNQ1YCL028W 1218 nt9.64□□□□□ -0.87
MSI1P13712 BIO4YNR057C 714 nt9.63□□□□□ -0.87
MSI1P13712 RDN37-1RDN37-1 5354 nt9.61□□□□□ -0.87
MSI1P13712 RDN37-2RDN37-2 5354 nt9.61□□□□□ -0.87
MSI1P13712 PTK1YKL198C 1989 nt9.61□□□□□ -0.87
MSI1P13712 PTH1YHR189W 573 nt9.6□□□□□ -0.87
MSI1P13712 YLR235CYLR235C 399 nt9.6□□□□□ -0.87
MSI1P13712 HUA1YGR268C 597 nt9.59□□□□□ -0.87
MSI1P13712 DIC1YLR348C 897 nt9.58□□□□□ -0.88
MSI1P13712 YLL053CYLL053C 459 nt9.57□□□□□ -0.88
MSI1P13712 LYS4YDR234W 2082 nt9.54□□□□□ -0.88
MSI1P13712 YKL030WYKL030W 606 nt9.54□□□□□ -0.88
MSI1P13712 FTR1YER145C 1215 nt9.5□□□□□ -0.89
MSI1P13712 TIM23YNR017W 669 nt9.5□□□□□ -0.89
MSI1P13712 ERF2YLR246W 1080 nt9.49□□□□□ -0.89
MSI1P13712 GAL1YBR020W 1587 nt9.46□□□□□ -0.89
MSI1P13712 ATF2YGR177C 1608 nt9.45□□□□□ -0.9
MSI1P13712 YLR179CYLR179C 606 nt9.45□□□□□ -0.9
MSI1P13712 CRR1YLR213C 1269 nt9.45□□□□□ -0.9
MSI1P13712 TRM5YHR070W 1500 nt9.43□□□□□ -0.9
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