Protein–RNA interactions for Protein: P0DN89

Tmem254a, Transmembrane protein 254, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem254aP0DN89 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmem254aP0DN89 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmem254aP0DN89 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmem254aP0DN89 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmem254aP0DN89 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmem254aP0DN89 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmem254aP0DN89 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmem254aP0DN89 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmem254aP0DN89 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmem254aP0DN89 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmem254aP0DN89 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmem254aP0DN89 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmem254aP0DN89 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmem254aP0DN89 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tmem254aP0DN89 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmem254aP0DN89 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmem254aP0DN89 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmem254aP0DN89 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmem254aP0DN89 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tmem254aP0DN89 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tmem254aP0DN89 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmem254aP0DN89 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmem254aP0DN89 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Tmem254aP0DN89 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmem254aP0DN89 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmem254aP0DN89 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmem254aP0DN89 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tmem254aP0DN89 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tmem254aP0DN89 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tmem254aP0DN89 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tmem254aP0DN89 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Tmem254aP0DN89 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tmem254aP0DN89 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Tmem254aP0DN89 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Tmem254aP0DN89 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmem254aP0DN89 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmem254aP0DN89 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmem254aP0DN89 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmem254aP0DN89 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmem254aP0DN89 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmem254aP0DN89 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmem254aP0DN89 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmem254aP0DN89 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmem254aP0DN89 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmem254aP0DN89 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmem254aP0DN89 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem254aP0DN89 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmem254aP0DN89 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmem254aP0DN89 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tmem254aP0DN89 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tmem254aP0DN89 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmem254aP0DN89 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmem254aP0DN89 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmem254aP0DN89 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmem254aP0DN89 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmem254aP0DN89 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem254aP0DN89 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem254aP0DN89 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmem254aP0DN89 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmem254aP0DN89 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmem254aP0DN89 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmem254aP0DN89 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmem254aP0DN89 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmem254aP0DN89 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmem254aP0DN89 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmem254aP0DN89 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmem254aP0DN89 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmem254aP0DN89 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmem254aP0DN89 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmem254aP0DN89 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmem254aP0DN89 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmem254aP0DN89 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmem254aP0DN89 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmem254aP0DN89 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmem254aP0DN89 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmem254aP0DN89 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmem254aP0DN89 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmem254aP0DN89 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmem254aP0DN89 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmem254aP0DN89 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmem254aP0DN89 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmem254aP0DN89 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem254aP0DN89 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem254aP0DN89 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem254aP0DN89 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tmem254aP0DN89 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem254aP0DN89 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem254aP0DN89 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem254aP0DN89 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem254aP0DN89 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem254aP0DN89 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem254aP0DN89 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem254aP0DN89 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem254aP0DN89 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem254aP0DN89 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem254aP0DN89 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem254aP0DN89 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem254aP0DN89 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem254aP0DN89 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem254aP0DN89 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms