Protein–RNA interactions for Protein: P0CX21

YRF1-5, Y' element ATP-dependent helicase protein 1 copy 5, yeastyeast

Predictions only

Length 1,796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YRF1-5P0CX21 POA1YBR022W 534 nt19.01■□□□□ 0.63
YRF1-5P0CX21 ERV46YAL042W 1248 nt18.96■□□□□ 0.63
YRF1-5P0CX21 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt18.88■□□□□ 0.61
YRF1-5P0CX21 YDR094WYDR094W 336 nt18.86■□□□□ 0.61
YRF1-5P0CX21 FPR4YLR449W 1179 nt18.86■□□□□ 0.61
YRF1-5P0CX21 PHO4YFR034C 939 nt18.85■□□□□ 0.61
YRF1-5P0CX21 NAB2YGL122C 1578 nt18.82■□□□□ 0.6
YRF1-5P0CX21 TRM9YML014W 840 nt18.81■□□□□ 0.6
YRF1-5P0CX21 SIS1YNL007C 1059 nt18.79■□□□□ 0.6
YRF1-5P0CX21 YJL152WYJL152W 360 nt18.76■□□□□ 0.59
YRF1-5P0CX21 FUN26YAL022C 1554 nt18.76■□□□□ 0.59
YRF1-5P0CX21 INM2YDR287W 879 nt18.73■□□□□ 0.59
YRF1-5P0CX21 DAL1YIR027C 1383 nt18.72■□□□□ 0.59
YRF1-5P0CX21 MXR2YCL033C 507 nt18.7■□□□□ 0.58
YRF1-5P0CX21 CCT6YDR188W 1641 nt18.65■□□□□ 0.58
YRF1-5P0CX21 IDH1YNL037C 1083 nt18.62■□□□□ 0.57
YRF1-5P0CX21 YDR433WYDR433W 441 nt18.6■□□□□ 0.57
YRF1-5P0CX21 SBA1YKL117W 651 nt18.54■□□□□ 0.56
YRF1-5P0CX21 HUA1YGR268C 597 nt18.49■□□□□ 0.55
YRF1-5P0CX21 YKR040CYKR040C 504 nt18.48■□□□□ 0.55
YRF1-5P0CX21 GBP2YCL011C 1284 nt18.41■□□□□ 0.54
YRF1-5P0CX21 SUF2tP(AGG)C 72 nt18.35■□□□□ 0.53
YRF1-5P0CX21 SUF10tP(AGG)N 72 nt18.35■□□□□ 0.53
YRF1-5P0CX21 TIR4YOR009W 1464 nt18.35■□□□□ 0.53
YRF1-5P0CX21 PTH1YHR189W 573 nt18.32■□□□□ 0.52
YRF1-5P0CX21 ALF1YNL148C 765 nt18.31■□□□□ 0.52
YRF1-5P0CX21 YPS1YLR120C 1710 nt18.31■□□□□ 0.52
YRF1-5P0CX21 PAU16YKL224C 372 nt18.25■□□□□ 0.51
YRF1-5P0CX21 YDR095CYDR095C 411 nt18.11■□□□□ 0.49
YRF1-5P0CX21 PRE6YOL038W 765 nt18.07■□□□□ 0.48
YRF1-5P0CX21 FRD1YEL047C 1413 nt18.07■□□□□ 0.48
YRF1-5P0CX21 TCD2YKL027W 1344 nt17.99■□□□□ 0.47
YRF1-5P0CX21 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt17.98■□□□□ 0.47
YRF1-5P0CX21 CAC2YML102W 1407 nt17.91■□□□□ 0.46
YRF1-5P0CX21 DED1YOR204W 1815 nt17.89■□□□□ 0.45
YRF1-5P0CX21 LCB1YMR296C 1677 nt17.86■□□□□ 0.45
YRF1-5P0CX21 YFR018CYFR018C 1092 nt17.86■□□□□ 0.45
YRF1-5P0CX21 YMR057CYMR057C 372 nt17.85■□□□□ 0.45
YRF1-5P0CX21 YKL030WYKL030W 606 nt17.84■□□□□ 0.45
YRF1-5P0CX21 YLR235CYLR235C 399 nt17.83■□□□□ 0.44
YRF1-5P0CX21 ART5YGR068C 1761 nt17.81■□□□□ 0.44
YRF1-5P0CX21 SOR2YDL246C 1074 nt17.76■□□□□ 0.43
YRF1-5P0CX21 SOR1YJR159W 1074 nt17.76■□□□□ 0.43
YRF1-5P0CX21 GFD2YCL036W 1701 nt17.74■□□□□ 0.43
YRF1-5P0CX21 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt17.74■□□□□ 0.43
YRF1-5P0CX21 RRD1YIL153W 1182 nt17.74■□□□□ 0.43
YRF1-5P0CX21 YCL042WYCL042W 360 nt17.68■□□□□ 0.42
YRF1-5P0CX21 FMT1YBL013W 1206 nt17.66■□□□□ 0.42
YRF1-5P0CX21 RRT5YFR032C 870 nt17.61■□□□□ 0.41
YRF1-5P0CX21 SNF6YHL025W 999 nt17.61■□□□□ 0.41
YRF1-5P0CX21 RPP2AYOL039W 321 nt17.61■□□□□ 0.41
YRF1-5P0CX21 PTP1YDL230W 1008 nt17.59■□□□□ 0.41
YRF1-5P0CX21 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt17.58■□□□□ 0.41
YRF1-5P0CX21 RTS2YOR077W 699 nt17.58■□□□□ 0.4
YRF1-5P0CX21 PET9YBL030C 957 nt17.53■□□□□ 0.4
YRF1-5P0CX21 TIM23YNR017W 669 nt17.51■□□□□ 0.39
YRF1-5P0CX21 DIC1YLR348C 897 nt17.46■□□□□ 0.39
YRF1-5P0CX21 FPS1YLL043W 2010 nt17.45■□□□□ 0.38
YRF1-5P0CX21 YFL066CYFL066C 1179 nt17.35■□□□□ 0.37
YRF1-5P0CX21 YLR179CYLR179C 606 nt17.33■□□□□ 0.36
YRF1-5P0CX21 CWP1YKL096W 720 nt17.3■□□□□ 0.36
YRF1-5P0CX21 PEX25YPL112C 1185 nt17.24■□□□□ 0.35
YRF1-5P0CX21 ADH2YMR303C 1047 nt17.22■□□□□ 0.35
YRF1-5P0CX21 YPR064WYPR064W 420 nt17.2■□□□□ 0.34
YRF1-5P0CX21 NAT4YMR069W 858 nt17.19■□□□□ 0.34
YRF1-5P0CX21 WSC2YNL283C 1512 nt17.16■□□□□ 0.34
YRF1-5P0CX21 DCW1YKL046C 1350 nt17.15■□□□□ 0.34
YRF1-5P0CX21 FMP52YER004W 696 nt17.13■□□□□ 0.33
YRF1-5P0CX21 CUE1YMR264W 612 nt17.11■□□□□ 0.33
YRF1-5P0CX21 YMR244WYMR244W 1068 nt17.1■□□□□ 0.33
YRF1-5P0CX21 TAD3YLR316C 969 nt17.09■□□□□ 0.33
YRF1-5P0CX21 MEP2YNL142W 1500 nt17.09■□□□□ 0.33
YRF1-5P0CX21 GLK1YCL040W 1503 nt17.08■□□□□ 0.32
YRF1-5P0CX21 MSF1YPR047W 1410 nt17.06■□□□□ 0.32
YRF1-5P0CX21 IRC15YPL017C 1500 nt17.04■□□□□ 0.32
YRF1-5P0CX21 MIR1YJR077C 936 nt17■□□□□ 0.31
YRF1-5P0CX21 YNL115CYNL115C 1935 nt16.97■□□□□ 0.31
YRF1-5P0CX21 YSP3YOR003W 1437 nt16.93■□□□□ 0.3
YRF1-5P0CX21 AHT1YHR093W 549 nt16.89■□□□□ 0.29
YRF1-5P0CX21 GLR1YPL091W 1452 nt16.88■□□□□ 0.29
YRF1-5P0CX21 RBG2YGR173W 1107 nt16.86■□□□□ 0.29
YRF1-5P0CX21 YIH1YCR059C 777 nt16.85■□□□□ 0.29
YRF1-5P0CX21 BDH1YAL060W 1149 nt16.82■□□□□ 0.28
YRF1-5P0CX21 THI74YDR438W 1113 nt16.82■□□□□ 0.28
YRF1-5P0CX21 EMI2YDR516C 1503 nt16.81■□□□□ 0.28
YRF1-5P0CX21 YIL100WYIL100W 354 nt16.77■□□□□ 0.28
YRF1-5P0CX21 PCM1YEL058W 1674 nt16.77■□□□□ 0.28
YRF1-5P0CX21 YSC84YHR016C 1407 nt16.76■□□□□ 0.27
YRF1-5P0CX21 YLR415CYLR415C 339 nt16.72■□□□□ 0.27
YRF1-5P0CX21 RAD51YER095W 1203 nt16.72■□□□□ 0.27
YRF1-5P0CX21 RNQ1YCL028W 1218 nt16.71■□□□□ 0.27
YRF1-5P0CX21 GIS3YLR094C 1509 nt16.7■□□□□ 0.26
YRF1-5P0CX21 YLL053CYLL053C 459 nt16.69■□□□□ 0.26
YRF1-5P0CX21 YDL221WYDL221W 552 nt16.67■□□□□ 0.26
YRF1-5P0CX21 VPS75YNL246W 795 nt16.64■□□□□ 0.25
YRF1-5P0CX21 FTR1YER145C 1215 nt16.63■□□□□ 0.25
YRF1-5P0CX21 NDI1YML120C 1542 nt16.6■□□□□ 0.25
YRF1-5P0CX21 DAT1YML113W 747 nt16.59■□□□□ 0.25
YRF1-5P0CX21 SPT5YML010W 3192 nt16.58■□□□□ 0.25
YRF1-5P0CX21 BIO4YNR057C 714 nt16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 50.6 ms