Protein–RNA interactions for Protein: P0CF17

YML002W, UPF0507 protein YML002W, yeastyeast

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Length 737 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YML002WP0CF17 ART5YGR068C 1761 nt12.76□□□□□ -0.37
YML002WP0CF17 SDH1YKL148C 1923 nt12.74□□□□□ -0.37
YML002WP0CF17 GFD2YCL036W 1701 nt12.72□□□□□ -0.37
YML002WP0CF17 IRC15YPL017C 1500 nt12.72□□□□□ -0.37
YML002WP0CF17 RTS2YOR077W 699 nt12.67□□□□□ -0.38
YML002WP0CF17 TAT1YBR069C 1860 nt12.66□□□□□ -0.38
YML002WP0CF17 GIS3YLR094C 1509 nt12.64□□□□□ -0.39
YML002WP0CF17 SCC4YER147C 1875 nt12.64□□□□□ -0.39
YML002WP0CF17 TIR4YOR009W 1464 nt12.64□□□□□ -0.39
YML002WP0CF17 PET9YBL030C 957 nt12.62□□□□□ -0.39
YML002WP0CF17 PAC11YDR488C 1602 nt12.62□□□□□ -0.39
YML002WP0CF17 YOL037CYOL037C 354 nt12.56□□□□□ -0.4
YML002WP0CF17 YMR057CYMR057C 372 nt12.55□□□□□ -0.4
YML002WP0CF17 YOR139CYOR139C 393 nt12.54□□□□□ -0.4
YML002WP0CF17 NPL3YDR432W 1245 nt12.53□□□□□ -0.4
YML002WP0CF17 YCH1YGR203W 447 nt12.53□□□□□ -0.4
YML002WP0CF17 YJL152WYJL152W 360 nt12.52□□□□□ -0.41
YML002WP0CF17 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt12.5□□□□□ -0.41
YML002WP0CF17 CUE1YMR264W 612 nt12.47□□□□□ -0.41
YML002WP0CF17 Q0182Q0182 405 nt12.45□□□□□ -0.42
YML002WP0CF17 NVJ2YPR091C 2313 nt12.44□□□□□ -0.42
YML002WP0CF17 FPS1YLL043W 2010 nt12.38□□□□□ -0.43
YML002WP0CF17 YSC84YHR016C 1407 nt12.38□□□□□ -0.43
YML002WP0CF17 SEC11YIR022W 504 nt12.35□□□□□ -0.43
YML002WP0CF17 WHI5YOR083W 888 nt12.35□□□□□ -0.43
YML002WP0CF17 PCH2YBR186W 1695 nt12.35□□□□□ -0.43
YML002WP0CF17 YIL100WYIL100W 354 nt12.34□□□□□ -0.43
YML002WP0CF17 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt12.33□□□□□ -0.44
YML002WP0CF17 RRT12YCR045C 1476 nt12.33□□□□□ -0.44
YML002WP0CF17 YLR281CYLR281C 468 nt12.31□□□□□ -0.44
YML002WP0CF17 YHL050CYHL050C 2094 nt12.3□□□□□ -0.44
YML002WP0CF17 YLR236CYLR236C 324 nt12.29□□□□□ -0.44
YML002WP0CF17 GUT2YIL155C 1950 nt12.28□□□□□ -0.44
YML002WP0CF17 YNL195CYNL195C 786 nt12.26□□□□□ -0.45
YML002WP0CF17 IDH1YNL037C 1083 nt12.15□□□□□ -0.46
YML002WP0CF17 PUS2YGL063W 1113 nt12.14□□□□□ -0.47
YML002WP0CF17 GBP2YCL011C 1284 nt12.12□□□□□ -0.47
YML002WP0CF17 PIB2YGL023C 1908 nt12.08□□□□□ -0.48
YML002WP0CF17 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt12.07□□□□□ -0.48
YML002WP0CF17 IMT4tM(CAU)E 72 nt12.07□□□□□ -0.48
YML002WP0CF17 IMT3tM(CAU)J3 72 nt12.07□□□□□ -0.48
YML002WP0CF17 IMT1tM(CAU)O1 72 nt12.07□□□□□ -0.48
YML002WP0CF17 IMT2tM(CAU)P 72 nt12.07□□□□□ -0.48
YML002WP0CF17 RRD1YIL153W 1182 nt12.06□□□□□ -0.48
YML002WP0CF17 RTF1YGL244W 1677 nt12.06□□□□□ -0.48
YML002WP0CF17 DSK2YMR276W 1122 nt12.04□□□□□ -0.48
YML002WP0CF17 YPR011CYPR011C 981 nt12.02□□□□□ -0.49
YML002WP0CF17 IMP2'YIL154C 1041 nt12□□□□□ -0.49
YML002WP0CF17 BOP3YNL042W 1191 nt12□□□□□ -0.49
YML002WP0CF17 TCD2YKL027W 1344 nt12□□□□□ -0.49
YML002WP0CF17 DED1YOR204W 1815 nt11.98□□□□□ -0.49
YML002WP0CF17 YDR433WYDR433W 441 nt11.97□□□□□ -0.49
YML002WP0CF17 MXR2YCL033C 507 nt11.93□□□□□ -0.5
YML002WP0CF17 FMT1YBL013W 1206 nt11.92□□□□□ -0.5
YML002WP0CF17 FMP45YDL222C 930 nt11.91□□□□□ -0.5
YML002WP0CF17 FMP52YER004W 696 nt11.89□□□□□ -0.51
YML002WP0CF17 NCP1YHR042W 2076 nt11.89□□□□□ -0.51
YML002WP0CF17 LCB1YMR296C 1677 nt11.88□□□□□ -0.51
YML002WP0CF17 PTK1YKL198C 1989 nt11.87□□□□□ -0.51
YML002WP0CF17 PCM1YEL058W 1674 nt11.87□□□□□ -0.51
YML002WP0CF17 LPX1YOR084W 1164 nt11.86□□□□□ -0.51
YML002WP0CF17 CWP1YKL096W 720 nt11.85□□□□□ -0.51
YML002WP0CF17 ADH2YMR303C 1047 nt11.84□□□□□ -0.51
YML002WP0CF17 SIM1YIL123W 1431 nt11.8□□□□□ -0.52
YML002WP0CF17 ERV46YAL042W 1248 nt11.8□□□□□ -0.52
YML002WP0CF17 SNF6YHL025W 999 nt11.77□□□□□ -0.53
YML002WP0CF17 YKR040CYKR040C 504 nt11.77□□□□□ -0.53
YML002WP0CF17 YCL042WYCL042W 360 nt11.76□□□□□ -0.53
YML002WP0CF17 SOR2YDL246C 1074 nt11.73□□□□□ -0.53
YML002WP0CF17 SOR1YJR159W 1074 nt11.73□□□□□ -0.53
YML002WP0CF17 BIO4YNR057C 714 nt11.7□□□□□ -0.54
YML002WP0CF17 YFL054CYFL054C 1941 nt11.7□□□□□ -0.54
YML002WP0CF17 FRD1YEL047C 1413 nt11.69□□□□□ -0.54
YML002WP0CF17 LYS4YDR234W 2082 nt11.6□□□□□ -0.55
YML002WP0CF17 MOT3YMR070W 1473 nt11.6□□□□□ -0.55
YML002WP0CF17 YIH1YCR059C 777 nt11.59□□□□□ -0.55
YML002WP0CF17 YLL053CYLL053C 459 nt11.56□□□□□ -0.56
YML002WP0CF17 RNQ1YCL028W 1218 nt11.56□□□□□ -0.56
YML002WP0CF17 SPT8YLR055C 1809 nt11.56□□□□□ -0.56
YML002WP0CF17 SPP1YPL138C 1062 nt11.55□□□□□ -0.56
YML002WP0CF17 ERF2YLR246W 1080 nt11.52□□□□□ -0.57
YML002WP0CF17 PTH1YHR189W 573 nt11.5□□□□□ -0.57
YML002WP0CF17 DIC1YLR348C 897 nt11.5□□□□□ -0.57
YML002WP0CF17 CRR1YLR213C 1269 nt11.49□□□□□ -0.57
YML002WP0CF17 UME6YDR207C 2511 nt11.48□□□□□ -0.57
YML002WP0CF17 ATF2YGR177C 1608 nt11.46□□□□□ -0.58
YML002WP0CF17 FTR1YER145C 1215 nt11.44□□□□□ -0.58
YML002WP0CF17 TRM5YHR070W 1500 nt11.42□□□□□ -0.58
YML002WP0CF17 MIC10YCL057C-A 294 nt11.42□□□□□ -0.58
YML002WP0CF17 GAL1YBR020W 1587 nt11.41□□□□□ -0.58
YML002WP0CF17 SWE1YJL187C 2460 nt11.4□□□□□ -0.58
YML002WP0CF17 HEM12YDR047W 1089 nt11.39□□□□□ -0.59
YML002WP0CF17 YFL067WYFL067W 528 nt11.37□□□□□ -0.59
YML002WP0CF17 DDR2YOL052C-A 186 nt11.37□□□□□ -0.59
YML002WP0CF17 SNG1YGR197C 1644 nt11.36□□□□□ -0.59
YML002WP0CF17 YLR235CYLR235C 399 nt11.36□□□□□ -0.59
YML002WP0CF17 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt11.35□□□□□ -0.59
YML002WP0CF17 TIM23YNR017W 669 nt11.33□□□□□ -0.6
YML002WP0CF17 YLR179CYLR179C 606 nt11.3□□□□□ -0.6
YML002WP0CF17 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt11.29□□□□□ -0.6
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