Protein–RNA interactions for Protein: P0CF16

YML003W, UPF0507 protein YML003W, yeastyeast

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Length 290 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YML003WP0CF16 ALF1YNL148C 765 nt10.66□□□□□ -0.7
YML003WP0CF16 CCT6YDR188W 1641 nt10.65□□□□□ -0.7
YML003WP0CF16 NVJ2YPR091C 2313 nt10.64□□□□□ -0.71
YML003WP0CF16 SUF2tP(AGG)C 72 nt10.63□□□□□ -0.71
YML003WP0CF16 SUF10tP(AGG)N 72 nt10.63□□□□□ -0.71
YML003WP0CF16 PCH2YBR186W 1695 nt10.61□□□□□ -0.71
YML003WP0CF16 GUT2YIL155C 1950 nt10.57□□□□□ -0.72
YML003WP0CF16 SEC11YIR022W 504 nt10.57□□□□□ -0.72
YML003WP0CF16 CAC2YML102W 1407 nt10.57□□□□□ -0.72
YML003WP0CF16 PTP1YDL230W 1008 nt10.53□□□□□ -0.72
YML003WP0CF16 RPP2AYOL039W 321 nt10.52□□□□□ -0.73
YML003WP0CF16 SCC4YER147C 1875 nt10.51□□□□□ -0.73
YML003WP0CF16 YLR281CYLR281C 468 nt10.47□□□□□ -0.73
YML003WP0CF16 WHI5YOR083W 888 nt10.44□□□□□ -0.74
YML003WP0CF16 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt10.42□□□□□ -0.74
YML003WP0CF16 IMT4tM(CAU)E 72 nt10.42□□□□□ -0.74
YML003WP0CF16 IMT3tM(CAU)J3 72 nt10.42□□□□□ -0.74
YML003WP0CF16 IMT1tM(CAU)O1 72 nt10.42□□□□□ -0.74
YML003WP0CF16 IMT2tM(CAU)P 72 nt10.42□□□□□ -0.74
YML003WP0CF16 SIS1YNL007C 1059 nt10.42□□□□□ -0.74
YML003WP0CF16 IRC15YPL017C 1500 nt10.41□□□□□ -0.74
YML003WP0CF16 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt10.4□□□□□ -0.74
YML003WP0CF16 PUS2YGL063W 1113 nt10.38□□□□□ -0.75
YML003WP0CF16 PIB2YGL023C 1908 nt10.38□□□□□ -0.75
YML003WP0CF16 GIS3YLR094C 1509 nt10.36□□□□□ -0.75
YML003WP0CF16 YSC84YHR016C 1407 nt10.33□□□□□ -0.76
YML003WP0CF16 IMP2'YIL154C 1041 nt10.31□□□□□ -0.76
YML003WP0CF16 YJL152WYJL152W 360 nt10.3□□□□□ -0.76
YML003WP0CF16 RTF1YGL244W 1677 nt10.29□□□□□ -0.76
YML003WP0CF16 YCH1YGR203W 447 nt10.28□□□□□ -0.76
YML003WP0CF16 DSK2YMR276W 1122 nt10.26□□□□□ -0.77
YML003WP0CF16 YHL050CYHL050C 2094 nt10.26□□□□□ -0.77
YML003WP0CF16 PET9YBL030C 957 nt10.23□□□□□ -0.77
YML003WP0CF16 TIR4YOR009W 1464 nt10.23□□□□□ -0.77
YML003WP0CF16 ART5YGR068C 1761 nt10.21□□□□□ -0.78
YML003WP0CF16 GFD2YCL036W 1701 nt10.2□□□□□ -0.78
YML003WP0CF16 IDH1YNL037C 1083 nt10.19□□□□□ -0.78
YML003WP0CF16 BOP3YNL042W 1191 nt10.19□□□□□ -0.78
YML003WP0CF16 YJL225CYJL225C 5277 nt10.18□□□□□ -0.78
YML003WP0CF16 RTS2YOR077W 699 nt10.15□□□□□ -0.78
YML003WP0CF16 RRT12YCR045C 1476 nt10.14□□□□□ -0.79
YML003WP0CF16 PTK1YKL198C 1989 nt10.14□□□□□ -0.79
YML003WP0CF16 FMP45YDL222C 930 nt10.13□□□□□ -0.79
YML003WP0CF16 YLR236CYLR236C 324 nt10.12□□□□□ -0.79
YML003WP0CF16 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt10.12□□□□□ -0.79
YML003WP0CF16 FPS1YLL043W 2010 nt10.11□□□□□ -0.79
YML003WP0CF16 YMR057CYMR057C 372 nt10.1□□□□□ -0.79
YML003WP0CF16 YNL195CYNL195C 786 nt10.1□□□□□ -0.79
YML003WP0CF16 CUE1YMR264W 612 nt10.08□□□□□ -0.8
YML003WP0CF16 YPR011CYPR011C 981 nt10.06□□□□□ -0.8
YML003WP0CF16 GBP2YCL011C 1284 nt10.05□□□□□ -0.8
YML003WP0CF16 YDR433WYDR433W 441 nt10.01□□□□□ -0.81
YML003WP0CF16 ERV46YAL042W 1248 nt10.01□□□□□ -0.81
YML003WP0CF16 BOR1YNL275W 1731 nt10.01□□□□□ -0.81
YML003WP0CF16 YIL100WYIL100W 354 nt9.98□□□□□ -0.81
YML003WP0CF16 LPX1YOR084W 1164 nt9.96□□□□□ -0.82
YML003WP0CF16 TCD2YKL027W 1344 nt9.96□□□□□ -0.82
YML003WP0CF16 NCP1YHR042W 2076 nt9.94□□□□□ -0.82
YML003WP0CF16 YKR040CYKR040C 504 nt9.93□□□□□ -0.82
YML003WP0CF16 YFL054CYFL054C 1941 nt9.92□□□□□ -0.82
YML003WP0CF16 UME6YDR207C 2511 nt9.89□□□□□ -0.83
YML003WP0CF16 SPT8YLR055C 1809 nt9.87□□□□□ -0.83
YML003WP0CF16 MXR2YCL033C 507 nt9.85□□□□□ -0.83
YML003WP0CF16 RRD1YIL153W 1182 nt9.82□□□□□ -0.84
YML003WP0CF16 FMP52YER004W 696 nt9.8□□□□□ -0.84
YML003WP0CF16 DED1YOR204W 1815 nt9.79□□□□□ -0.84
YML003WP0CF16 YCL042WYCL042W 360 nt9.78□□□□□ -0.84
YML003WP0CF16 MRPL8YJL063C 717 nt9.74□□□□□ -0.85
YML003WP0CF16 SOR2YDL246C 1074 nt9.73□□□□□ -0.85
YML003WP0CF16 SOR1YJR159W 1074 nt9.73□□□□□ -0.85
YML003WP0CF16 SPP1YPL138C 1062 nt9.73□□□□□ -0.85
YML003WP0CF16 RDN37-1RDN37-1 5354 nt9.71□□□□□ -0.86
YML003WP0CF16 RDN37-2RDN37-2 5354 nt9.71□□□□□ -0.86
YML003WP0CF16 FRD1YEL047C 1413 nt9.71□□□□□ -0.86
YML003WP0CF16 LCB1YMR296C 1677 nt9.7□□□□□ -0.86
YML003WP0CF16 HSP60YLR259C 1719 nt9.69□□□□□ -0.86
YML003WP0CF16 FMT1YBL013W 1206 nt9.67□□□□□ -0.86
YML003WP0CF16 ADO1YJR105W 1023 nt9.66□□□□□ -0.86
YML003WP0CF16 SWE1YJL187C 2460 nt9.65□□□□□ -0.86
YML003WP0CF16 CWP1YKL096W 720 nt9.65□□□□□ -0.86
YML003WP0CF16 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt9.63□□□□□ -0.87
YML003WP0CF16 YEL076CYEL076C 651 nt9.63□□□□□ -0.87
YML003WP0CF16 YLR464WYLR464W 651 nt9.63□□□□□ -0.87
YML003WP0CF16 MCH5YOR306C 1566 nt9.63□□□□□ -0.87
YML003WP0CF16 ALG12YNR030W 1656 nt9.62□□□□□ -0.87
YML003WP0CF16 YLR235CYLR235C 399 nt9.62□□□□□ -0.87
YML003WP0CF16 SNF6YHL025W 999 nt9.6□□□□□ -0.87
YML003WP0CF16 RTG1YOL067C 534 nt9.6□□□□□ -0.87
YML003WP0CF16 PCM1YEL058W 1674 nt9.6□□□□□ -0.87
YML003WP0CF16 ADH2YMR303C 1047 nt9.59□□□□□ -0.87
YML003WP0CF16 PTH1YHR189W 573 nt9.56□□□□□ -0.88
YML003WP0CF16 GLK1YCL040W 1503 nt9.56□□□□□ -0.88
YML003WP0CF16 HUA1YGR268C 597 nt9.54□□□□□ -0.88
YML003WP0CF16 YKL030WYKL030W 606 nt9.54□□□□□ -0.88
YML003WP0CF16 LYS4YDR234W 2082 nt9.51□□□□□ -0.89
YML003WP0CF16 DIC1YLR348C 897 nt9.5□□□□□ -0.89
YML003WP0CF16 RNQ1YCL028W 1218 nt9.49□□□□□ -0.89
YML003WP0CF16 YIH1YCR059C 777 nt9.48□□□□□ -0.89
YML003WP0CF16 SIM1YIL123W 1431 nt9.46□□□□□ -0.9
YML003WP0CF16 TIM23YNR017W 669 nt9.45□□□□□ -0.9
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