Protein–RNA interactions for Protein: P08122

Col4a2, Collagen alpha-2(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a2P08122 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Col4a2P08122 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Col4a2P08122 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Col4a2P08122 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Col4a2P08122 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Col4a2P08122 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Col4a2P08122 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Col4a2P08122 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Col4a2P08122 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Col4a2P08122 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Col4a2P08122 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Col4a2P08122 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Col4a2P08122 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Col4a2P08122 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Col4a2P08122 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Col4a2P08122 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Col4a2P08122 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Col4a2P08122 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Col4a2P08122 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Col4a2P08122 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Col4a2P08122 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Col4a2P08122 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Col4a2P08122 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Col4a2P08122 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Col4a2P08122 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Col4a2P08122 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Col4a2P08122 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Col4a2P08122 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Col4a2P08122 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Col4a2P08122 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Col4a2P08122 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Col4a2P08122 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Col4a2P08122 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Col4a2P08122 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Col4a2P08122 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Col4a2P08122 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Col4a2P08122 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Col4a2P08122 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Col4a2P08122 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Col4a2P08122 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Col4a2P08122 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Col4a2P08122 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Col4a2P08122 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Col4a2P08122 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Col4a2P08122 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Col4a2P08122 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Col4a2P08122 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Col4a2P08122 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Col4a2P08122 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Col4a2P08122 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Col4a2P08122 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Col4a2P08122 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Col4a2P08122 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Col4a2P08122 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Col4a2P08122 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Col4a2P08122 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Col4a2P08122 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Col4a2P08122 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Col4a2P08122 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Col4a2P08122 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Col4a2P08122 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Col4a2P08122 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Col4a2P08122 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Col4a2P08122 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Col4a2P08122 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Col4a2P08122 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Col4a2P08122 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Col4a2P08122 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Col4a2P08122 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Col4a2P08122 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Col4a2P08122 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Col4a2P08122 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Col4a2P08122 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Col4a2P08122 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Col4a2P08122 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Col4a2P08122 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Col4a2P08122 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Col4a2P08122 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Col4a2P08122 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Col4a2P08122 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Col4a2P08122 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Col4a2P08122 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Col4a2P08122 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Col4a2P08122 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Col4a2P08122 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Col4a2P08122 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Col4a2P08122 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Col4a2P08122 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Col4a2P08122 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Col4a2P08122 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Col4a2P08122 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Col4a2P08122 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Col4a2P08122 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Col4a2P08122 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Col4a2P08122 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Col4a2P08122 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Col4a2P08122 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Col4a2P08122 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Col4a2P08122 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Col4a2P08122 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.4 ms