Protein–RNA interactions for Protein: O54951

Sema6b, Semaphorin-6B, mousemouse

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6bO54951 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC38.7■■■■□ 3.79
Sema6bO54951 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
Sema6bO54951 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC38.68■■■■□ 3.78
Sema6bO54951 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
Sema6bO54951 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC38.65■■■■□ 3.78
Sema6bO54951 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
Sema6bO54951 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
Sema6bO54951 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC38.4■■■■□ 3.74
Sema6bO54951 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38.39■■■■□ 3.74
Sema6bO54951 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
Sema6bO54951 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
Sema6bO54951 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
Sema6bO54951 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
Sema6bO54951 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
Sema6bO54951 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC38.22■■■■□ 3.71
Sema6bO54951 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
Sema6bO54951 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC38.19■■■■□ 3.7
Sema6bO54951 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC38.16■■■■□ 3.7
Sema6bO54951 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
Sema6bO54951 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC38.09■■■■□ 3.69
Sema6bO54951 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC38.08■■■■□ 3.69
Sema6bO54951 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC38.07■■■■□ 3.68
Sema6bO54951 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
Sema6bO54951 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
Sema6bO54951 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
Sema6bO54951 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
Sema6bO54951 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
Sema6bO54951 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.85■■■■□ 3.65
Sema6bO54951 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC37.77■■■■□ 3.64
Sema6bO54951 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC37.76■■■■□ 3.64
Sema6bO54951 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
Sema6bO54951 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.74■■■■□ 3.63
Sema6bO54951 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC37.73■■■■□ 3.63
Sema6bO54951 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
Sema6bO54951 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC37.7■■■■□ 3.63
Sema6bO54951 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC37.69■■■■□ 3.62
Sema6bO54951 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC37.68■■■■□ 3.62
Sema6bO54951 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.61■■■■□ 3.61
Sema6bO54951 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
Sema6bO54951 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC37.54■■■■□ 3.6
Sema6bO54951 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
Sema6bO54951 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
Sema6bO54951 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
Sema6bO54951 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
Sema6bO54951 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
Sema6bO54951 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
Sema6bO54951 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC37.45■■■■□ 3.59
Sema6bO54951 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC37.44■■■■□ 3.58
Sema6bO54951 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.44■■■■□ 3.58
Sema6bO54951 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC37.44■■■■□ 3.58
Sema6bO54951 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC37.43■■■■□ 3.58
Sema6bO54951 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC37.42■■■■□ 3.58
Sema6bO54951 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.41■■■■□ 3.58
Sema6bO54951 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
Sema6bO54951 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
Sema6bO54951 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC37.38■■■■□ 3.57
Sema6bO54951 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC37.37■■■■□ 3.57
Sema6bO54951 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
Sema6bO54951 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
Sema6bO54951 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
Sema6bO54951 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC37.27■■■■□ 3.56
Sema6bO54951 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
Sema6bO54951 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
Sema6bO54951 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
Sema6bO54951 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC37.2■■■■□ 3.55
Sema6bO54951 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC37.16■■■■□ 3.54
Sema6bO54951 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
Sema6bO54951 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
Sema6bO54951 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
Sema6bO54951 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
Sema6bO54951 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
Sema6bO54951 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
Sema6bO54951 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC37.07■■■■□ 3.52
Sema6bO54951 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC37.02■■■■□ 3.52
Sema6bO54951 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
Sema6bO54951 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
Sema6bO54951 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.97■■■■□ 3.51
Sema6bO54951 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
Sema6bO54951 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
Sema6bO54951 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
Sema6bO54951 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
Sema6bO54951 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
Sema6bO54951 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC36.84■■■■□ 3.49
Sema6bO54951 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.83■■■■□ 3.49
Sema6bO54951 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
Sema6bO54951 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
Sema6bO54951 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
Sema6bO54951 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC36.8■■■■□ 3.48
Sema6bO54951 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
Sema6bO54951 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
Sema6bO54951 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC36.78■■■■□ 3.48
Sema6bO54951 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
Sema6bO54951 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
Sema6bO54951 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
Sema6bO54951 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC36.69■■■■□ 3.46
Sema6bO54951 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC36.69■■■■□ 3.46
Sema6bO54951 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
Sema6bO54951 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
Sema6bO54951 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
Sema6bO54951 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 103.9 ms