Protein–RNA interactions for Protein: O35914

Bnc1, Zinc finger protein basonuclin-1, mousemouse

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bnc1O35914 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Bnc1O35914 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Bnc1O35914 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Bnc1O35914 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Bnc1O35914 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Bnc1O35914 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Bnc1O35914 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Bnc1O35914 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Bnc1O35914 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Bnc1O35914 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Bnc1O35914 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Bnc1O35914 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Bnc1O35914 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Bnc1O35914 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Bnc1O35914 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Bnc1O35914 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Bnc1O35914 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Bnc1O35914 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Bnc1O35914 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Bnc1O35914 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Bnc1O35914 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Bnc1O35914 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Bnc1O35914 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Bnc1O35914 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Bnc1O35914 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Bnc1O35914 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Bnc1O35914 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Bnc1O35914 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Bnc1O35914 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Bnc1O35914 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Bnc1O35914 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Bnc1O35914 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Bnc1O35914 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Bnc1O35914 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Bnc1O35914 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Bnc1O35914 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Bnc1O35914 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Bnc1O35914 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Bnc1O35914 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Bnc1O35914 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Bnc1O35914 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Bnc1O35914 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Bnc1O35914 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Bnc1O35914 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Bnc1O35914 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Bnc1O35914 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Bnc1O35914 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Bnc1O35914 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Bnc1O35914 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Bnc1O35914 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Bnc1O35914 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Bnc1O35914 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Bnc1O35914 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Bnc1O35914 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Bnc1O35914 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Bnc1O35914 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Bnc1O35914 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Bnc1O35914 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Bnc1O35914 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Bnc1O35914 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Bnc1O35914 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Bnc1O35914 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Bnc1O35914 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Bnc1O35914 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Bnc1O35914 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Bnc1O35914 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Bnc1O35914 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Bnc1O35914 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Bnc1O35914 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Bnc1O35914 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Bnc1O35914 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Bnc1O35914 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Bnc1O35914 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Bnc1O35914 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Bnc1O35914 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Bnc1O35914 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Bnc1O35914 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Bnc1O35914 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Bnc1O35914 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Bnc1O35914 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Bnc1O35914 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Bnc1O35914 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Bnc1O35914 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Bnc1O35914 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Bnc1O35914 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Bnc1O35914 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Bnc1O35914 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Bnc1O35914 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Bnc1O35914 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Bnc1O35914 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Bnc1O35914 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Bnc1O35914 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Bnc1O35914 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Bnc1O35914 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Bnc1O35914 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Bnc1O35914 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Bnc1O35914 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Bnc1O35914 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Bnc1O35914 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Bnc1O35914 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms