Protein–RNA interactions for Protein: O13539

THP2, THO complex subunit THP2, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
THP2O13539 IRC15YPL017C 1500 nt11.86□□□□□ -0.51
THP2O13539 SCC4YER147C 1875 nt11.85□□□□□ -0.51
THP2O13539 ART5YGR068C 1761 nt11.83□□□□□ -0.52
THP2O13539 YKL097CYKL097C 411 nt11.83□□□□□ -0.52
THP2O13539 RKM5YLR137W 1104 nt11.83□□□□□ -0.52
THP2O13539 GFD2YCL036W 1701 nt11.83□□□□□ -0.52
THP2O13539 GIS3YLR094C 1509 nt11.79□□□□□ -0.52
THP2O13539 PET9YBL030C 957 nt11.77□□□□□ -0.53
THP2O13539 YCH1YGR203W 447 nt11.74□□□□□ -0.53
THP2O13539 RTS2YOR077W 699 nt11.72□□□□□ -0.53
THP2O13539 SEC11YIR022W 504 nt11.7□□□□□ -0.54
THP2O13539 TIR4YOR009W 1464 nt11.7□□□□□ -0.54
THP2O13539 PCH2YBR186W 1695 nt11.66□□□□□ -0.54
THP2O13539 CUE1YMR264W 612 nt11.65□□□□□ -0.54
THP2O13539 YOL037CYOL037C 354 nt11.6□□□□□ -0.55
THP2O13539 GUT2YIL155C 1950 nt11.59□□□□□ -0.55
THP2O13539 YSC84YHR016C 1407 nt11.59□□□□□ -0.55
THP2O13539 NPL3YDR432W 1245 nt11.58□□□□□ -0.56
THP2O13539 YMR057CYMR057C 372 nt11.57□□□□□ -0.56
THP2O13539 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt11.52□□□□□ -0.57
THP2O13539 YHL050CYHL050C 2094 nt11.51□□□□□ -0.57
THP2O13539 YIL100WYIL100W 354 nt11.51□□□□□ -0.57
THP2O13539 FPS1YLL043W 2010 nt11.5□□□□□ -0.57
THP2O13539 YJL152WYJL152W 360 nt11.49□□□□□ -0.57
THP2O13539 YNL195CYNL195C 786 nt11.48□□□□□ -0.57
THP2O13539 YLR236CYLR236C 324 nt11.45□□□□□ -0.58
THP2O13539 RRT12YCR045C 1476 nt11.44□□□□□ -0.58
THP2O13539 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt11.42□□□□□ -0.58
THP2O13539 PIB2YGL023C 1908 nt11.41□□□□□ -0.58
THP2O13539 YJL225CYJL225C 5277 nt11.39□□□□□ -0.59
THP2O13539 YOR139CYOR139C 393 nt11.39□□□□□ -0.59
THP2O13539 RTF1YGL244W 1677 nt11.36□□□□□ -0.59
THP2O13539 PAC11YDR488C 1602 nt11.33□□□□□ -0.6
THP2O13539 BOP3YNL042W 1191 nt11.31□□□□□ -0.6
THP2O13539 WHI5YOR083W 888 nt11.31□□□□□ -0.6
THP2O13539 YLR281CYLR281C 468 nt11.3□□□□□ -0.6
THP2O13539 IDH1YNL037C 1083 nt11.22□□□□□ -0.61
THP2O13539 NCP1YHR042W 2076 nt11.18□□□□□ -0.62
THP2O13539 PTK1YKL198C 1989 nt11.17□□□□□ -0.62
THP2O13539 RRD1YIL153W 1182 nt11.15□□□□□ -0.62
THP2O13539 GBP2YCL011C 1284 nt11.15□□□□□ -0.62
THP2O13539 IMP2'YIL154C 1041 nt11.13□□□□□ -0.63
THP2O13539 FMP52YER004W 696 nt11.12□□□□□ -0.63
THP2O13539 TCD2YKL027W 1344 nt11.09□□□□□ -0.63
THP2O13539 LCB1YMR296C 1677 nt11.08□□□□□ -0.64
THP2O13539 DSK2YMR276W 1122 nt11.07□□□□□ -0.64
THP2O13539 DED1YOR204W 1815 nt11.07□□□□□ -0.64
THP2O13539 PUS2YGL063W 1113 nt11.05□□□□□ -0.64
THP2O13539 RDN37-1RDN37-1 5354 nt11.05□□□□□ -0.64
THP2O13539 RDN37-2RDN37-2 5354 nt11.05□□□□□ -0.64
THP2O13539 PCM1YEL058W 1674 nt11□□□□□ -0.65
THP2O13539 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt10.98□□□□□ -0.65
THP2O13539 IMT4tM(CAU)E 72 nt10.98□□□□□ -0.65
THP2O13539 IMT3tM(CAU)J3 72 nt10.98□□□□□ -0.65
THP2O13539 IMT1tM(CAU)O1 72 nt10.98□□□□□ -0.65
THP2O13539 IMT2tM(CAU)P 72 nt10.98□□□□□ -0.65
THP2O13539 FMT1YBL013W 1206 nt10.98□□□□□ -0.65
THP2O13539 YFL054CYFL054C 1941 nt10.96□□□□□ -0.65
THP2O13539 YDR433WYDR433W 441 nt10.96□□□□□ -0.65
THP2O13539 SIM1YIL123W 1431 nt10.95□□□□□ -0.66
THP2O13539 FMP45YDL222C 930 nt10.92□□□□□ -0.66
THP2O13539 SOR2YDL246C 1074 nt10.92□□□□□ -0.66
THP2O13539 SNF6YHL025W 999 nt10.92□□□□□ -0.66
THP2O13539 SOR1YJR159W 1074 nt10.92□□□□□ -0.66
THP2O13539 CWP1YKL096W 720 nt10.91□□□□□ -0.66
THP2O13539 ADH2YMR303C 1047 nt10.9□□□□□ -0.66
THP2O13539 YPR011CYPR011C 981 nt10.9□□□□□ -0.66
THP2O13539 MXR2YCL033C 507 nt10.9□□□□□ -0.66
THP2O13539 SPT8YLR055C 1809 nt10.9□□□□□ -0.66
THP2O13539 ERV46YAL042W 1248 nt10.89□□□□□ -0.67
THP2O13539 BIO4YNR057C 714 nt10.88□□□□□ -0.67
THP2O13539 Q0182Q0182 405 nt10.86□□□□□ -0.67
THP2O13539 YCL042WYCL042W 360 nt10.86□□□□□ -0.67
THP2O13539 LYS4YDR234W 2082 nt10.86□□□□□ -0.67
THP2O13539 LPX1YOR084W 1164 nt10.83□□□□□ -0.68
THP2O13539 YKR040CYKR040C 504 nt10.82□□□□□ -0.68
THP2O13539 NVJ2YPR091C 2313 nt10.81□□□□□ -0.68
THP2O13539 YIH1YCR059C 777 nt10.78□□□□□ -0.68
THP2O13539 ERF2YLR246W 1080 nt10.78□□□□□ -0.68
THP2O13539 FRD1YEL047C 1413 nt10.77□□□□□ -0.68
THP2O13539 CRR1YLR213C 1269 nt10.75□□□□□ -0.69
THP2O13539 RNQ1YCL028W 1218 nt10.73□□□□□ -0.69
THP2O13539 SWE1YJL187C 2460 nt10.72□□□□□ -0.69
THP2O13539 YLL053CYLL053C 459 nt10.7□□□□□ -0.7
THP2O13539 DIC1YLR348C 897 nt10.64□□□□□ -0.71
THP2O13539 HEM12YDR047W 1089 nt10.63□□□□□ -0.71
THP2O13539 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt10.63□□□□□ -0.71
THP2O13539 YFL067WYFL067W 528 nt10.62□□□□□ -0.71
THP2O13539 ATF2YGR177C 1608 nt10.62□□□□□ -0.71
THP2O13539 BOR1YNL275W 1731 nt10.61□□□□□ -0.71
THP2O13539 FTR1YER145C 1215 nt10.61□□□□□ -0.71
THP2O13539 SNG1YGR197C 1644 nt10.58□□□□□ -0.72
THP2O13539 GAL1YBR020W 1587 nt10.57□□□□□ -0.72
THP2O13539 MIC10YCL057C-A 294 nt10.57□□□□□ -0.72
THP2O13539 TRM5YHR070W 1500 nt10.56□□□□□ -0.72
THP2O13539 DDR2YOL052C-A 186 nt10.53□□□□□ -0.72
THP2O13539 RAX1YOR301W 1308 nt10.53□□□□□ -0.72
THP2O13539 AQY1YPR192W 918 nt10.52□□□□□ -0.73
THP2O13539 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt10.49□□□□□ -0.73
THP2O13539 YLR235CYLR235C 399 nt10.49□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 10.9 ms