Protein–RNA interactions for Protein: O08542

Efna4, Ephrin-A4, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efna4O08542 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Efna4O08542 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Efna4O08542 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Efna4O08542 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Efna4O08542 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Efna4O08542 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Efna4O08542 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Efna4O08542 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Efna4O08542 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Efna4O08542 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Efna4O08542 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Efna4O08542 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Efna4O08542 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Efna4O08542 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Efna4O08542 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Efna4O08542 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Efna4O08542 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Efna4O08542 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Efna4O08542 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Efna4O08542 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Efna4O08542 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Efna4O08542 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Efna4O08542 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Efna4O08542 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Efna4O08542 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Efna4O08542 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Efna4O08542 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Efna4O08542 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Efna4O08542 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Efna4O08542 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Efna4O08542 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Efna4O08542 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Efna4O08542 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Efna4O08542 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Efna4O08542 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Efna4O08542 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Efna4O08542 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Efna4O08542 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Efna4O08542 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Efna4O08542 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Efna4O08542 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Efna4O08542 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Efna4O08542 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Efna4O08542 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Efna4O08542 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Efna4O08542 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Efna4O08542 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Efna4O08542 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Efna4O08542 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Efna4O08542 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Efna4O08542 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Efna4O08542 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Efna4O08542 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Efna4O08542 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Efna4O08542 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Efna4O08542 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Efna4O08542 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Efna4O08542 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Efna4O08542 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Efna4O08542 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Efna4O08542 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Efna4O08542 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Efna4O08542 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Efna4O08542 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Efna4O08542 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Efna4O08542 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Efna4O08542 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Efna4O08542 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Efna4O08542 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Efna4O08542 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Efna4O08542 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Efna4O08542 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Efna4O08542 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Efna4O08542 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Efna4O08542 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Efna4O08542 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Efna4O08542 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Efna4O08542 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Efna4O08542 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Efna4O08542 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Efna4O08542 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Efna4O08542 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Efna4O08542 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Efna4O08542 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Efna4O08542 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Efna4O08542 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Efna4O08542 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Efna4O08542 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Efna4O08542 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Efna4O08542 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Efna4O08542 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Efna4O08542 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Efna4O08542 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Efna4O08542 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Efna4O08542 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Efna4O08542 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Efna4O08542 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Efna4O08542 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Efna4O08542 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Efna4O08542 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms