Protein–RNA interactions for Protein: O08542

Efna4, Ephrin-A4, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efna4O08542 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC35.22■■■■□ 3.23
Efna4O08542 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Efna4O08542 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Efna4O08542 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC30.67■■■□□ 2.5
Efna4O08542 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
Efna4O08542 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Efna4O08542 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Efna4O08542 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Efna4O08542 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
Efna4O08542 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
Efna4O08542 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Efna4O08542 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Efna4O08542 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
Efna4O08542 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Efna4O08542 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Efna4O08542 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Efna4O08542 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Efna4O08542 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.12
Efna4O08542 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Efna4O08542 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Efna4O08542 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Efna4O08542 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Efna4O08542 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Efna4O08542 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Efna4O08542 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Efna4O08542 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Efna4O08542 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Efna4O08542 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Efna4O08542 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Efna4O08542 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Efna4O08542 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Efna4O08542 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Efna4O08542 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Efna4O08542 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Efna4O08542 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Efna4O08542 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Efna4O08542 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Efna4O08542 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Efna4O08542 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Efna4O08542 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Efna4O08542 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
Efna4O08542 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Efna4O08542 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Efna4O08542 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Efna4O08542 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Efna4O08542 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Efna4O08542 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Efna4O08542 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Efna4O08542 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Efna4O08542 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Efna4O08542 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Efna4O08542 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Efna4O08542 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Efna4O08542 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Efna4O08542 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Efna4O08542 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Efna4O08542 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Efna4O08542 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Efna4O08542 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Efna4O08542 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Efna4O08542 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Efna4O08542 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Efna4O08542 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Efna4O08542 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Efna4O08542 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Efna4O08542 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Efna4O08542 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Efna4O08542 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Efna4O08542 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Efna4O08542 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Efna4O08542 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Efna4O08542 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Efna4O08542 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Efna4O08542 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Efna4O08542 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Efna4O08542 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Efna4O08542 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Efna4O08542 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Efna4O08542 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Efna4O08542 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Efna4O08542 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Efna4O08542 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Efna4O08542 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Efna4O08542 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Efna4O08542 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Efna4O08542 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Efna4O08542 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Efna4O08542 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Efna4O08542 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Efna4O08542 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Efna4O08542 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Efna4O08542 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Efna4O08542 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Efna4O08542 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Efna4O08542 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Efna4O08542 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Efna4O08542 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Efna4O08542 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Efna4O08542 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Efna4O08542 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms