Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ04

Gm21887, Predicted gene, 21887, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21887J3QQ04 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm21887J3QQ04 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm21887J3QQ04 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm21887J3QQ04 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm21887J3QQ04 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm21887J3QQ04 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm21887J3QQ04 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm21887J3QQ04 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm21887J3QQ04 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm21887J3QQ04 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm21887J3QQ04 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm21887J3QQ04 Gm11434-201ENSMUST00000122379 629 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm21887J3QQ04 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm21887J3QQ04 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Gm21887J3QQ04 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Gm21887J3QQ04 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Gm21887J3QQ04 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Gm21887J3QQ04 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm21887J3QQ04 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm21887J3QQ04 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm21887J3QQ04 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm21887J3QQ04 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm21887J3QQ04 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm21887J3QQ04 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm21887J3QQ04 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Gm21887J3QQ04 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm21887J3QQ04 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm21887J3QQ04 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm21887J3QQ04 Rpl7-201ENSMUST00000058437 1163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm21887J3QQ04 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm21887J3QQ04 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm21887J3QQ04 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm21887J3QQ04 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm21887J3QQ04 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm21887J3QQ04 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm21887J3QQ04 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm21887J3QQ04 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm21887J3QQ04 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm21887J3QQ04 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm21887J3QQ04 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm21887J3QQ04 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm21887J3QQ04 Gm29179-208ENSMUST00000190450 1137 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm21887J3QQ04 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm21887J3QQ04 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm21887J3QQ04 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm21887J3QQ04 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm21887J3QQ04 Gm28819-201ENSMUST00000186691 572 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm21887J3QQ04 Gm28840-208ENSMUST00000191514 738 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm21887J3QQ04 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm21887J3QQ04 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm21887J3QQ04 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm21887J3QQ04 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm21887J3QQ04 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm21887J3QQ04 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm21887J3QQ04 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm21887J3QQ04 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm21887J3QQ04 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm21887J3QQ04 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm21887J3QQ04 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm21887J3QQ04 Cisd3-201ENSMUST00000107583 737 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm21887J3QQ04 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm21887J3QQ04 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm21887J3QQ04 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm21887J3QQ04 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm21887J3QQ04 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm21887J3QQ04 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm21887J3QQ04 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm21887J3QQ04 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm21887J3QQ04 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm21887J3QQ04 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm21887J3QQ04 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm21887J3QQ04 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm21887J3QQ04 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm21887J3QQ04 Gm13857-203ENSMUST00000150561 2337 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm21887J3QQ04 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm21887J3QQ04 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm21887J3QQ04 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm21887J3QQ04 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm21887J3QQ04 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm21887J3QQ04 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm21887J3QQ04 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm21887J3QQ04 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm21887J3QQ04 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm21887J3QQ04 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm21887J3QQ04 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm21887J3QQ04 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm21887J3QQ04 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm21887J3QQ04 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm21887J3QQ04 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm21887J3QQ04 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm21887J3QQ04 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm21887J3QQ04 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm21887J3QQ04 Gm42790-201ENSMUST00000201268 969 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm21887J3QQ04 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm21887J3QQ04 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm21887J3QQ04 AC073947.1-201ENSMUST00000216991 649 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm21887J3QQ04 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm21887J3QQ04 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm21887J3QQ04 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm21887J3QQ04 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms