Protein–RNA interactions for Protein: E9Q414

Apob, Apolipoprotein B-100, mousemouse

Predictions only

Length 4,505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobE9Q414 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ApobE9Q414 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ApobE9Q414 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ApobE9Q414 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ApobE9Q414 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ApobE9Q414 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ApobE9Q414 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ApobE9Q414 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ApobE9Q414 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ApobE9Q414 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ApobE9Q414 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ApobE9Q414 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ApobE9Q414 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ApobE9Q414 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ApobE9Q414 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ApobE9Q414 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
ApobE9Q414 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ApobE9Q414 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ApobE9Q414 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ApobE9Q414 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ApobE9Q414 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ApobE9Q414 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ApobE9Q414 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ApobE9Q414 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
ApobE9Q414 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ApobE9Q414 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ApobE9Q414 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ApobE9Q414 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ApobE9Q414 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
ApobE9Q414 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ApobE9Q414 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ApobE9Q414 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
ApobE9Q414 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ApobE9Q414 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ApobE9Q414 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ApobE9Q414 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ApobE9Q414 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ApobE9Q414 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ApobE9Q414 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ApobE9Q414 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ApobE9Q414 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ApobE9Q414 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ApobE9Q414 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ApobE9Q414 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ApobE9Q414 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ApobE9Q414 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ApobE9Q414 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ApobE9Q414 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ApobE9Q414 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ApobE9Q414 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ApobE9Q414 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ApobE9Q414 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ApobE9Q414 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ApobE9Q414 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ApobE9Q414 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ApobE9Q414 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ApobE9Q414 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ApobE9Q414 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ApobE9Q414 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ApobE9Q414 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ApobE9Q414 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ApobE9Q414 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ApobE9Q414 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ApobE9Q414 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ApobE9Q414 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ApobE9Q414 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ApobE9Q414 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ApobE9Q414 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ApobE9Q414 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ApobE9Q414 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ApobE9Q414 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ApobE9Q414 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ApobE9Q414 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ApobE9Q414 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ApobE9Q414 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ApobE9Q414 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ApobE9Q414 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ApobE9Q414 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ApobE9Q414 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ApobE9Q414 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ApobE9Q414 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ApobE9Q414 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ApobE9Q414 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ApobE9Q414 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ApobE9Q414 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ApobE9Q414 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ApobE9Q414 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
ApobE9Q414 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ApobE9Q414 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ApobE9Q414 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ApobE9Q414 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ApobE9Q414 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ApobE9Q414 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ApobE9Q414 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ApobE9Q414 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ApobE9Q414 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ApobE9Q414 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ApobE9Q414 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ApobE9Q414 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ApobE9Q414 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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