Protein–RNA interactions for Protein: B2RQG2

Phf3, PHD finger protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,025 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf3B2RQG2 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Phf3B2RQG2 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Phf3B2RQG2 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Phf3B2RQG2 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Phf3B2RQG2 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Phf3B2RQG2 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Phf3B2RQG2 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Phf3B2RQG2 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Phf3B2RQG2 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Phf3B2RQG2 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Phf3B2RQG2 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Phf3B2RQG2 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Phf3B2RQG2 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Phf3B2RQG2 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Phf3B2RQG2 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Phf3B2RQG2 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Phf3B2RQG2 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Phf3B2RQG2 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Phf3B2RQG2 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Phf3B2RQG2 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Phf3B2RQG2 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Phf3B2RQG2 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Phf3B2RQG2 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Phf3B2RQG2 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Phf3B2RQG2 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Phf3B2RQG2 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Phf3B2RQG2 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Phf3B2RQG2 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Phf3B2RQG2 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Phf3B2RQG2 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Phf3B2RQG2 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Phf3B2RQG2 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Phf3B2RQG2 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Phf3B2RQG2 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Phf3B2RQG2 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Phf3B2RQG2 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Phf3B2RQG2 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Phf3B2RQG2 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Phf3B2RQG2 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Phf3B2RQG2 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Phf3B2RQG2 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Phf3B2RQG2 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Phf3B2RQG2 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Phf3B2RQG2 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Phf3B2RQG2 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Phf3B2RQG2 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Phf3B2RQG2 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Phf3B2RQG2 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Phf3B2RQG2 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Phf3B2RQG2 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Phf3B2RQG2 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Phf3B2RQG2 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Phf3B2RQG2 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Phf3B2RQG2 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Phf3B2RQG2 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Phf3B2RQG2 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Phf3B2RQG2 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Phf3B2RQG2 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Phf3B2RQG2 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Phf3B2RQG2 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Phf3B2RQG2 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Phf3B2RQG2 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Phf3B2RQG2 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Phf3B2RQG2 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Phf3B2RQG2 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Phf3B2RQG2 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Phf3B2RQG2 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Phf3B2RQG2 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Phf3B2RQG2 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Phf3B2RQG2 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Phf3B2RQG2 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Phf3B2RQG2 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Phf3B2RQG2 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Phf3B2RQG2 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Phf3B2RQG2 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Phf3B2RQG2 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Phf3B2RQG2 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Phf3B2RQG2 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Phf3B2RQG2 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Phf3B2RQG2 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Phf3B2RQG2 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Phf3B2RQG2 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Phf3B2RQG2 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Phf3B2RQG2 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Phf3B2RQG2 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Phf3B2RQG2 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Phf3B2RQG2 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Phf3B2RQG2 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Phf3B2RQG2 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Phf3B2RQG2 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Phf3B2RQG2 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Phf3B2RQG2 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Phf3B2RQG2 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Phf3B2RQG2 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Phf3B2RQG2 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Phf3B2RQG2 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Phf3B2RQG2 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Phf3B2RQG2 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Phf3B2RQG2 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Phf3B2RQG2 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 969.8 ms