Protein–RNA interactions for Protein: B1ATG9

Trabd2b, Metalloprotease TIKI2, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trabd2bB1ATG9 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Trabd2bB1ATG9 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Trabd2bB1ATG9 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Trabd2bB1ATG9 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Trabd2bB1ATG9 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Trabd2bB1ATG9 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Trabd2bB1ATG9 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Trabd2bB1ATG9 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Trabd2bB1ATG9 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Trabd2bB1ATG9 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Trabd2bB1ATG9 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Trabd2bB1ATG9 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Trabd2bB1ATG9 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Trabd2bB1ATG9 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Trabd2bB1ATG9 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Trabd2bB1ATG9 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Trabd2bB1ATG9 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Trabd2bB1ATG9 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Trabd2bB1ATG9 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Trabd2bB1ATG9 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Trabd2bB1ATG9 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Trabd2bB1ATG9 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Trabd2bB1ATG9 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Trabd2bB1ATG9 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Trabd2bB1ATG9 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Trabd2bB1ATG9 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Trabd2bB1ATG9 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Trabd2bB1ATG9 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Trabd2bB1ATG9 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trabd2bB1ATG9 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trabd2bB1ATG9 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Trabd2bB1ATG9 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Trabd2bB1ATG9 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Trabd2bB1ATG9 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Trabd2bB1ATG9 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Trabd2bB1ATG9 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Trabd2bB1ATG9 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Trabd2bB1ATG9 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Trabd2bB1ATG9 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Trabd2bB1ATG9 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Trabd2bB1ATG9 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trabd2bB1ATG9 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trabd2bB1ATG9 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trabd2bB1ATG9 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Trabd2bB1ATG9 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Trabd2bB1ATG9 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Trabd2bB1ATG9 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Trabd2bB1ATG9 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Trabd2bB1ATG9 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Trabd2bB1ATG9 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trabd2bB1ATG9 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trabd2bB1ATG9 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trabd2bB1ATG9 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Trabd2bB1ATG9 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Trabd2bB1ATG9 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Trabd2bB1ATG9 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Trabd2bB1ATG9 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Trabd2bB1ATG9 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trabd2bB1ATG9 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trabd2bB1ATG9 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trabd2bB1ATG9 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Trabd2bB1ATG9 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trabd2bB1ATG9 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Trabd2bB1ATG9 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trabd2bB1ATG9 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Trabd2bB1ATG9 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Trabd2bB1ATG9 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Trabd2bB1ATG9 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trabd2bB1ATG9 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Trabd2bB1ATG9 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Trabd2bB1ATG9 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Trabd2bB1ATG9 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Trabd2bB1ATG9 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trabd2bB1ATG9 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Trabd2bB1ATG9 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Trabd2bB1ATG9 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Trabd2bB1ATG9 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Trabd2bB1ATG9 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trabd2bB1ATG9 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trabd2bB1ATG9 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Trabd2bB1ATG9 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trabd2bB1ATG9 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trabd2bB1ATG9 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trabd2bB1ATG9 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trabd2bB1ATG9 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trabd2bB1ATG9 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Trabd2bB1ATG9 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trabd2bB1ATG9 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trabd2bB1ATG9 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trabd2bB1ATG9 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trabd2bB1ATG9 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trabd2bB1ATG9 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trabd2bB1ATG9 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trabd2bB1ATG9 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trabd2bB1ATG9 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trabd2bB1ATG9 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trabd2bB1ATG9 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trabd2bB1ATG9 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trabd2bB1ATG9 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trabd2bB1ATG9 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
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