Protein–RNA interactions for Protein: B1ARD6

Slfn9, Schlafen 9, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn9B1ARD6 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Slfn9B1ARD6 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Slfn9B1ARD6 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Slfn9B1ARD6 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Slfn9B1ARD6 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Slfn9B1ARD6 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Slfn9B1ARD6 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Slfn9B1ARD6 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Slfn9B1ARD6 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Slfn9B1ARD6 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Slfn9B1ARD6 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Slfn9B1ARD6 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Slfn9B1ARD6 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Slfn9B1ARD6 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Slfn9B1ARD6 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Slfn9B1ARD6 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Slfn9B1ARD6 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Slfn9B1ARD6 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Slfn9B1ARD6 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Slfn9B1ARD6 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Slfn9B1ARD6 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Slfn9B1ARD6 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Slfn9B1ARD6 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Slfn9B1ARD6 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Slfn9B1ARD6 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Slfn9B1ARD6 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Slfn9B1ARD6 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Slfn9B1ARD6 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Slfn9B1ARD6 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Slfn9B1ARD6 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Slfn9B1ARD6 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Slfn9B1ARD6 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Slfn9B1ARD6 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Slfn9B1ARD6 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Slfn9B1ARD6 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Slfn9B1ARD6 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Slfn9B1ARD6 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Slfn9B1ARD6 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Slfn9B1ARD6 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Slfn9B1ARD6 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Slfn9B1ARD6 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Slfn9B1ARD6 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Slfn9B1ARD6 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Slfn9B1ARD6 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Slfn9B1ARD6 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Slfn9B1ARD6 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Slfn9B1ARD6 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Slfn9B1ARD6 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Slfn9B1ARD6 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Slfn9B1ARD6 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Slfn9B1ARD6 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Slfn9B1ARD6 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Slfn9B1ARD6 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Slfn9B1ARD6 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Slfn9B1ARD6 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Slfn9B1ARD6 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Slfn9B1ARD6 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Slfn9B1ARD6 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Slfn9B1ARD6 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Slfn9B1ARD6 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Slfn9B1ARD6 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Slfn9B1ARD6 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Slfn9B1ARD6 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Slfn9B1ARD6 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Slfn9B1ARD6 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Slfn9B1ARD6 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Slfn9B1ARD6 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Slfn9B1ARD6 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Slfn9B1ARD6 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Slfn9B1ARD6 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Slfn9B1ARD6 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Slfn9B1ARD6 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Slfn9B1ARD6 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Slfn9B1ARD6 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Slfn9B1ARD6 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Slfn9B1ARD6 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Slfn9B1ARD6 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Slfn9B1ARD6 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Slfn9B1ARD6 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.72
Slfn9B1ARD6 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Slfn9B1ARD6 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Slfn9B1ARD6 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Slfn9B1ARD6 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Slfn9B1ARD6 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Slfn9B1ARD6 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Slfn9B1ARD6 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Slfn9B1ARD6 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Slfn9B1ARD6 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Slfn9B1ARD6 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Slfn9B1ARD6 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Slfn9B1ARD6 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Slfn9B1ARD6 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Slfn9B1ARD6 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Slfn9B1ARD6 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Slfn9B1ARD6 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Slfn9B1ARD6 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Slfn9B1ARD6 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Slfn9B1ARD6 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Slfn9B1ARD6 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Slfn9B1ARD6 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 146.5 ms