Protein–RNA interactions for Protein: A6NAS3

Gm3173, Alpha6-takusan, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3173A6NAS3 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Gm3173A6NAS3 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Gm3173A6NAS3 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Gm3173A6NAS3 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Gm3173A6NAS3 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC27.83■■■□□ 2.04
Gm3173A6NAS3 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Gm3173A6NAS3 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Gm3173A6NAS3 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Gm3173A6NAS3 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Gm3173A6NAS3 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Gm3173A6NAS3 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Gm3173A6NAS3 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Gm3173A6NAS3 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Gm3173A6NAS3 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Gm3173A6NAS3 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Gm3173A6NAS3 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Gm3173A6NAS3 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Gm3173A6NAS3 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Gm3173A6NAS3 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Gm3173A6NAS3 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Gm3173A6NAS3 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Gm3173A6NAS3 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Gm3173A6NAS3 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Gm3173A6NAS3 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Gm3173A6NAS3 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Gm3173A6NAS3 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Gm3173A6NAS3 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Gm3173A6NAS3 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Gm3173A6NAS3 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Gm3173A6NAS3 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Gm3173A6NAS3 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Gm3173A6NAS3 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Gm3173A6NAS3 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Gm3173A6NAS3 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Gm3173A6NAS3 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Gm3173A6NAS3 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Gm3173A6NAS3 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Gm3173A6NAS3 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Gm3173A6NAS3 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Gm3173A6NAS3 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Gm3173A6NAS3 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Gm3173A6NAS3 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Gm3173A6NAS3 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Gm3173A6NAS3 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Gm3173A6NAS3 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Gm3173A6NAS3 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Gm3173A6NAS3 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
Gm3173A6NAS3 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Gm3173A6NAS3 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Gm3173A6NAS3 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Gm3173A6NAS3 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Gm3173A6NAS3 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Gm3173A6NAS3 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Gm3173A6NAS3 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Gm3173A6NAS3 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Gm3173A6NAS3 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Gm3173A6NAS3 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Gm3173A6NAS3 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Gm3173A6NAS3 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Gm3173A6NAS3 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Gm3173A6NAS3 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Gm3173A6NAS3 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Gm3173A6NAS3 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Gm3173A6NAS3 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Gm3173A6NAS3 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Gm3173A6NAS3 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Gm3173A6NAS3 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Gm3173A6NAS3 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Gm3173A6NAS3 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Gm3173A6NAS3 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Gm3173A6NAS3 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Gm3173A6NAS3 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Gm3173A6NAS3 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Gm3173A6NAS3 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Gm3173A6NAS3 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Gm3173A6NAS3 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Gm3173A6NAS3 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Gm3173A6NAS3 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Gm3173A6NAS3 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Gm3173A6NAS3 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Gm3173A6NAS3 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Gm3173A6NAS3 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Gm3173A6NAS3 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Gm3173A6NAS3 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Gm3173A6NAS3 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Gm3173A6NAS3 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Gm3173A6NAS3 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Gm3173A6NAS3 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Gm3173A6NAS3 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Gm3173A6NAS3 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Gm3173A6NAS3 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Gm3173A6NAS3 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Gm3173A6NAS3 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Gm3173A6NAS3 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Gm3173A6NAS3 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Gm3173A6NAS3 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Gm3173A6NAS3 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Gm3173A6NAS3 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Gm3173A6NAS3 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Gm3173A6NAS3 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.7 ms