Protein–RNA interactions for Protein: O43172

PRPF4, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4O43172 CHRD-210ENST00000461684 677 ntTSL 415.12■□□□□ 0.011e-7■□□□□ 9
PRPF4O43172 CHRD-213ENST00000482014 560 ntTSL 414.98□□□□□ -0.011e-7■□□□□ 9
PRPF4O43172 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.229e-7■□□□□ 9
PRPF4O43172 EWSR1-217ENST00000483415 3231 ntTSL 1 (best)11.05□□□□□ -0.649e-7■□□□□ 9
PRPF4O43172 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.343e-24■□□□□ 9
PRPF4O43172 VIL1-203ENST00000419986 639 ntTSL 311.78□□□□□ -0.521e-12■□□□□ 9
PRPF4O43172 TM9SF3-202ENST00000443638 868 ntTSL 35.41□□□□□ -1.543e-24■□□□□ 9
PRPF4O43172 AHSA2-204ENST00000463681 453 ntTSL 522.28■■□□□ 1.167e-41■□□□□ 9
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PRPF4O43172 TCEA2-209ENST00000465111 2357 ntTSL 216.46■□□□□ 0.238e-7■□□□□ 9
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PRPF4O43172 FTX-211ENST00000603672 1077 ntTSL 511.97□□□□□ -0.498e-7■□□□□ 9
PRPF4O43172 EPS8L3-206ENST00000477568 493 ntTSL 411.41□□□□□ -0.588e-7■□□□□ 9
PRPF4O43172 FLNB-204ENST00000429972 9430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.531e-6■□□□□ 9
PRPF4O43172 FLNB-201ENST00000295956 9463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.531e-6■□□□□ 9
PRPF4O43172 FLNB-202ENST00000358537 9391 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.651e-6■□□□□ 9
PRPF4O43172 FLNB-212ENST00000490882 8079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.661e-6■□□□□ 9
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PRPF4O43172 RSPRY1-206ENST00000562959 548 ntTSL 418.57■□□□□ 0.564e-14■□□□□ 9
PRPF4O43172 RSPRY1-204ENST00000562439 692 ntTSL 518.11■□□□□ 0.494e-14■□□□□ 9
PRPF4O43172 RSPRY1-210ENST00000566352 1241 ntTSL 1 (best)16.77■□□□□ 0.284e-14■□□□□ 9
PRPF4O43172 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.094e-14■□□□□ 9
PRPF4O43172 RSPRY1-211ENST00000568505 654 ntTSL 515.62■□□□□ 0.094e-14■□□□□ 9
PRPF4O43172 RSPRY1-201ENST00000394420 3547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.884e-14■□□□□ 9
PRPF4O43172 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.525e-6■□□□□ 9
PRPF4O43172 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.215e-6■□□□□ 9
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PRPF4O43172 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.652e-8■□□□□ 9
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PRPF4O43172 MMAB-209ENST00000544051 1089 ntTSL 317■□□□□ 0.312e-8■□□□□ 9
PRPF4O43172 MMAB-210ENST00000545712 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.092e-8■□□□□ 9
PRPF4O43172 ERH-201ENST00000216520 668 ntTSL 313.95□□□□□ -0.182e-8■□□□□ 9
PRPF4O43172 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.232e-8■□□□□ 9
PRPF4O43172 PPP4C-211ENST00000567642 658 ntTSL 219.95■□□□□ 0.782e-6■□□□□ 9
PRPF4O43172 FARP1-219ENST00000596580 13532 ntTSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.083e-10■□□□□ 8.9
PRPF4O43172 HSP90B1-207ENST00000550595 694 ntTSL 25.29□□□□□ -1.569e-14■□□□□ 8.9
PRPF4O43172 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.883e-11■□□□□ 8.9
PRPF4O43172 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.733e-11■□□□□ 8.9
PRPF4O43172 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.683e-11■□□□□ 8.9
PRPF4O43172 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.643e-11■□□□□ 8.9
PRPF4O43172 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.633e-11■□□□□ 8.9
PRPF4O43172 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.573e-11■□□□□ 8.9
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PRPF4O43172 C19orf25-212ENST00000592605 357 ntTSL 316.79■□□□□ 0.283e-11■□□□□ 8.9
PRPF4O43172 C19orf25-208ENST00000589421 492 ntTSL 215.33■□□□□ 0.043e-11■□□□□ 8.9
PRPF4O43172 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.253e-11■□□□□ 8.9
PRPF4O43172 C19orf25-209ENST00000590621 885 ntTSL 312.99□□□□□ -0.333e-11■□□□□ 8.9
PRPF4O43172 SEMA6C-201ENST00000341697 5262 ntTSL 1 (best)20.25■□□□□ 0.831e-6■□□□□ 8.9
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PRPF4O43172 SEMA6C-202ENST00000368912 3697 ntTSL 1 (best)15.5■□□□□ 0.071e-6■□□□□ 8.9
PRPF4O43172 SEMA6C-204ENST00000368914 3892 ntTSL 1 (best)14.09□□□□□ -0.151e-6■□□□□ 8.9
PRPF4O43172 SEMA6C-203ENST00000368913 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best)12.3□□□□□ -0.441e-6■□□□□ 8.9
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PRPF4O43172 SEPT7-216ENST00000635172 509 ntTSL 221.29■■□□□ 12e-8■□□□□ 8.9
PRPF4O43172 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.722e-8■□□□□ 8.9
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PRPF4O43172 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.112e-8■□□□□ 8.9
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PRPF4O43172 ASXL1-205ENST00000497249 296 ntTSL 53.11□□□□□ -1.912e-8■□□□□ 8.9
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PRPF4O43172 NONO-203ENST00000373856 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.359e-8■□□□□ 8.9
PRPF4O43172 NONO-202ENST00000373841 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.489e-8■□□□□ 8.9
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PRPF4O43172 NONO-201ENST00000276079 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.769e-8■□□□□ 8.9
PRPF4O43172 NONO-205ENST00000418921 703 ntTSL 59□□□□□ -0.979e-8■□□□□ 8.9
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PRPF4O43172 NONO-210ENST00000472185 397 ntTSL 56.26□□□□□ -1.419e-8■□□□□ 8.9
PRPF4O43172 NXF1-212ENST00000531872 390 ntTSL 57.38□□□□□ -1.231e-8■□□□□ 8.9
PRPF4O43172 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.533e-6■□□□□ 8.9
PRPF4O43172 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.413e-6■□□□□ 8.9
PRPF4O43172 ENDOV-221ENST00000521830 580 ntTSL 417.61■□□□□ 0.413e-6■□□□□ 8.9
PRPF4O43172 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.333e-6■□□□□ 8.9
PRPF4O43172 ENDOV-211ENST00000520136 468 ntTSL 317.09■□□□□ 0.333e-6■□□□□ 8.9
PRPF4O43172 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.293e-6■□□□□ 8.9
PRPF4O43172 ENDOV-218ENST00000521330 556 ntTSL 416.59■□□□□ 0.253e-6■□□□□ 8.9
PRPF4O43172 ENDOV-224ENST00000522577 702 ntTSL 316.57■□□□□ 0.243e-6■□□□□ 8.9
PRPF4O43172 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.213e-6■□□□□ 8.9
PRPF4O43172 ENDOV-223ENST00000522200 855 ntTSL 316.24■□□□□ 0.193e-6■□□□□ 8.9
PRPF4O43172 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.163e-6■□□□□ 8.9
PRPF4O43172 ENDOV-208ENST00000519117 617 ntTSL 315.98■□□□□ 0.153e-6■□□□□ 8.9
PRPF4O43172 ENDOV-210ENST00000520118 533 ntTSL 415.98■□□□□ 0.153e-6■□□□□ 8.9
PRPF4O43172 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.033e-6■□□□□ 8.9
PRPF4O43172 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.023e-6■□□□□ 8.9
PRPF4O43172 ENDOV-214ENST00000520484 508 ntTSL 415.18■□□□□ 0.023e-6■□□□□ 8.9
PRPF4O43172 ENDOV-227ENST00000523228 545 ntTSL 414.81□□□□□ -0.043e-6■□□□□ 8.9
PRPF4O43172 ENDOV-228ENST00000523828 607 ntTSL 514.52□□□□□ -0.093e-6■□□□□ 8.9
PRPF4O43172 ENDOV-207ENST00000518907 2418 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.113e-6■□□□□ 8.9
PRPF4O43172 ENDOV-219ENST00000521565 547 ntTSL 414.05□□□□□ -0.163e-6■□□□□ 8.9
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