Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP6

Gm5538, MCG67716, mousemouse

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Length 401 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5538W4VSP6 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm5538W4VSP6 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm5538W4VSP6 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm5538W4VSP6 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm5538W4VSP6 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm5538W4VSP6 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm5538W4VSP6 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm5538W4VSP6 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm5538W4VSP6 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm5538W4VSP6 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm5538W4VSP6 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm5538W4VSP6 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm5538W4VSP6 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm5538W4VSP6 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm5538W4VSP6 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm5538W4VSP6 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm5538W4VSP6 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm5538W4VSP6 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm5538W4VSP6 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm5538W4VSP6 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm5538W4VSP6 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm5538W4VSP6 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm5538W4VSP6 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm5538W4VSP6 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm5538W4VSP6 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm5538W4VSP6 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm5538W4VSP6 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm5538W4VSP6 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm5538W4VSP6 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm5538W4VSP6 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm5538W4VSP6 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm5538W4VSP6 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm5538W4VSP6 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm5538W4VSP6 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm5538W4VSP6 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm5538W4VSP6 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gm5538W4VSP6 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm5538W4VSP6 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm5538W4VSP6 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm5538W4VSP6 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm5538W4VSP6 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm5538W4VSP6 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm5538W4VSP6 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm5538W4VSP6 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm5538W4VSP6 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm5538W4VSP6 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm5538W4VSP6 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm5538W4VSP6 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm5538W4VSP6 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm5538W4VSP6 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm5538W4VSP6 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm5538W4VSP6 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm5538W4VSP6 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm5538W4VSP6 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm5538W4VSP6 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm5538W4VSP6 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm5538W4VSP6 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm5538W4VSP6 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm5538W4VSP6 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm5538W4VSP6 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm5538W4VSP6 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm5538W4VSP6 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm5538W4VSP6 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm5538W4VSP6 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm5538W4VSP6 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm5538W4VSP6 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm5538W4VSP6 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm5538W4VSP6 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm5538W4VSP6 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm5538W4VSP6 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm5538W4VSP6 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm5538W4VSP6 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm5538W4VSP6 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm5538W4VSP6 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm5538W4VSP6 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm5538W4VSP6 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm5538W4VSP6 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm5538W4VSP6 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm5538W4VSP6 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm5538W4VSP6 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm5538W4VSP6 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm5538W4VSP6 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm5538W4VSP6 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm5538W4VSP6 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm5538W4VSP6 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm5538W4VSP6 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm5538W4VSP6 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm5538W4VSP6 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm5538W4VSP6 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm5538W4VSP6 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm5538W4VSP6 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm5538W4VSP6 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm5538W4VSP6 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm5538W4VSP6 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm5538W4VSP6 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm5538W4VSP6 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm5538W4VSP6 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm5538W4VSP6 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm5538W4VSP6 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm5538W4VSP6 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
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