Protein–RNA interactions for Protein: Q6PB60

Bhlhb9, Protein BHLHb9, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhb9Q6PB60 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Bhlhb9Q6PB60 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Bhlhb9Q6PB60 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Bhlhb9Q6PB60 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Bhlhb9Q6PB60 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Bhlhb9Q6PB60 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Bhlhb9Q6PB60 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Bhlhb9Q6PB60 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Bhlhb9Q6PB60 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Bhlhb9Q6PB60 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Bhlhb9Q6PB60 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Bhlhb9Q6PB60 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Bhlhb9Q6PB60 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Bhlhb9Q6PB60 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Bhlhb9Q6PB60 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Bhlhb9Q6PB60 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Bhlhb9Q6PB60 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Bhlhb9Q6PB60 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Bhlhb9Q6PB60 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Bhlhb9Q6PB60 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Bhlhb9Q6PB60 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Bhlhb9Q6PB60 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Bhlhb9Q6PB60 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Bhlhb9Q6PB60 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Bhlhb9Q6PB60 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Bhlhb9Q6PB60 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Bhlhb9Q6PB60 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Bhlhb9Q6PB60 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Bhlhb9Q6PB60 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Bhlhb9Q6PB60 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Bhlhb9Q6PB60 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Bhlhb9Q6PB60 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Bhlhb9Q6PB60 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Bhlhb9Q6PB60 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Bhlhb9Q6PB60 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Bhlhb9Q6PB60 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Bhlhb9Q6PB60 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Bhlhb9Q6PB60 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Bhlhb9Q6PB60 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Bhlhb9Q6PB60 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Bhlhb9Q6PB60 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
Bhlhb9Q6PB60 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Bhlhb9Q6PB60 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Bhlhb9Q6PB60 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Bhlhb9Q6PB60 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Bhlhb9Q6PB60 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Bhlhb9Q6PB60 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Bhlhb9Q6PB60 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Bhlhb9Q6PB60 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Bhlhb9Q6PB60 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Bhlhb9Q6PB60 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Bhlhb9Q6PB60 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Bhlhb9Q6PB60 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Bhlhb9Q6PB60 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Bhlhb9Q6PB60 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Bhlhb9Q6PB60 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Bhlhb9Q6PB60 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Bhlhb9Q6PB60 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Bhlhb9Q6PB60 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Bhlhb9Q6PB60 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Bhlhb9Q6PB60 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Bhlhb9Q6PB60 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Bhlhb9Q6PB60 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Bhlhb9Q6PB60 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Bhlhb9Q6PB60 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Bhlhb9Q6PB60 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Bhlhb9Q6PB60 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Bhlhb9Q6PB60 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Bhlhb9Q6PB60 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Bhlhb9Q6PB60 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Bhlhb9Q6PB60 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Bhlhb9Q6PB60 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Bhlhb9Q6PB60 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Bhlhb9Q6PB60 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Bhlhb9Q6PB60 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Bhlhb9Q6PB60 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Bhlhb9Q6PB60 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Bhlhb9Q6PB60 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Bhlhb9Q6PB60 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Bhlhb9Q6PB60 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Bhlhb9Q6PB60 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Bhlhb9Q6PB60 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Bhlhb9Q6PB60 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Bhlhb9Q6PB60 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Bhlhb9Q6PB60 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Bhlhb9Q6PB60 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Bhlhb9Q6PB60 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Bhlhb9Q6PB60 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Bhlhb9Q6PB60 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Bhlhb9Q6PB60 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Bhlhb9Q6PB60 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Bhlhb9Q6PB60 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Bhlhb9Q6PB60 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Bhlhb9Q6PB60 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Bhlhb9Q6PB60 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Bhlhb9Q6PB60 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Bhlhb9Q6PB60 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Bhlhb9Q6PB60 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Bhlhb9Q6PB60 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Bhlhb9Q6PB60 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 170.2 ms