Protein–RNA interactions for Protein: Q5XF90

Atp13a4, Probable cation-transporting ATPase 13A4, mousemouse

Predictions only

Length 1,193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp13a4Q5XF90 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Atp13a4Q5XF90 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atp13a4Q5XF90 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atp13a4Q5XF90 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atp13a4Q5XF90 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Atp13a4Q5XF90 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atp13a4Q5XF90 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Atp13a4Q5XF90 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Atp13a4Q5XF90 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Atp13a4Q5XF90 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Atp13a4Q5XF90 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Atp13a4Q5XF90 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Atp13a4Q5XF90 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Atp13a4Q5XF90 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Atp13a4Q5XF90 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atp13a4Q5XF90 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atp13a4Q5XF90 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atp13a4Q5XF90 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atp13a4Q5XF90 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atp13a4Q5XF90 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atp13a4Q5XF90 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Atp13a4Q5XF90 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Atp13a4Q5XF90 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Atp13a4Q5XF90 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Atp13a4Q5XF90 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atp13a4Q5XF90 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atp13a4Q5XF90 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atp13a4Q5XF90 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atp13a4Q5XF90 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atp13a4Q5XF90 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atp13a4Q5XF90 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atp13a4Q5XF90 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atp13a4Q5XF90 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atp13a4Q5XF90 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atp13a4Q5XF90 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Atp13a4Q5XF90 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atp13a4Q5XF90 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atp13a4Q5XF90 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atp13a4Q5XF90 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atp13a4Q5XF90 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atp13a4Q5XF90 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atp13a4Q5XF90 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atp13a4Q5XF90 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atp13a4Q5XF90 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atp13a4Q5XF90 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atp13a4Q5XF90 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atp13a4Q5XF90 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Atp13a4Q5XF90 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Atp13a4Q5XF90 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Atp13a4Q5XF90 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Atp13a4Q5XF90 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Atp13a4Q5XF90 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Atp13a4Q5XF90 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Atp13a4Q5XF90 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atp13a4Q5XF90 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atp13a4Q5XF90 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atp13a4Q5XF90 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atp13a4Q5XF90 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Atp13a4Q5XF90 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Atp13a4Q5XF90 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Atp13a4Q5XF90 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Atp13a4Q5XF90 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Atp13a4Q5XF90 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Atp13a4Q5XF90 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Atp13a4Q5XF90 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Atp13a4Q5XF90 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Atp13a4Q5XF90 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Atp13a4Q5XF90 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Atp13a4Q5XF90 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Atp13a4Q5XF90 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atp13a4Q5XF90 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atp13a4Q5XF90 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Atp13a4Q5XF90 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atp13a4Q5XF90 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atp13a4Q5XF90 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atp13a4Q5XF90 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atp13a4Q5XF90 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atp13a4Q5XF90 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atp13a4Q5XF90 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atp13a4Q5XF90 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atp13a4Q5XF90 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Atp13a4Q5XF90 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Atp13a4Q5XF90 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Atp13a4Q5XF90 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Atp13a4Q5XF90 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Atp13a4Q5XF90 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Atp13a4Q5XF90 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Atp13a4Q5XF90 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Atp13a4Q5XF90 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Atp13a4Q5XF90 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Atp13a4Q5XF90 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Atp13a4Q5XF90 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Atp13a4Q5XF90 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Atp13a4Q5XF90 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atp13a4Q5XF90 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atp13a4Q5XF90 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atp13a4Q5XF90 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atp13a4Q5XF90 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atp13a4Q5XF90 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atp13a4Q5XF90 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms