Protein–RNA interactions for Protein: Q1XH17

Trim72, Tripartite motif-containing protein 72, mousemouse

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim72Q1XH17 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim72Q1XH17 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim72Q1XH17 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim72Q1XH17 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim72Q1XH17 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim72Q1XH17 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim72Q1XH17 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim72Q1XH17 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim72Q1XH17 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim72Q1XH17 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim72Q1XH17 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim72Q1XH17 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim72Q1XH17 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim72Q1XH17 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim72Q1XH17 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim72Q1XH17 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim72Q1XH17 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim72Q1XH17 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim72Q1XH17 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim72Q1XH17 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim72Q1XH17 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim72Q1XH17 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim72Q1XH17 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim72Q1XH17 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim72Q1XH17 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim72Q1XH17 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim72Q1XH17 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim72Q1XH17 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim72Q1XH17 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Trim72Q1XH17 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim72Q1XH17 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim72Q1XH17 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim72Q1XH17 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim72Q1XH17 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim72Q1XH17 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim72Q1XH17 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim72Q1XH17 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim72Q1XH17 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim72Q1XH17 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim72Q1XH17 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim72Q1XH17 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim72Q1XH17 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim72Q1XH17 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim72Q1XH17 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim72Q1XH17 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim72Q1XH17 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim72Q1XH17 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim72Q1XH17 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim72Q1XH17 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim72Q1XH17 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim72Q1XH17 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim72Q1XH17 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim72Q1XH17 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim72Q1XH17 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim72Q1XH17 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim72Q1XH17 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim72Q1XH17 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim72Q1XH17 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim72Q1XH17 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim72Q1XH17 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim72Q1XH17 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim72Q1XH17 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim72Q1XH17 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim72Q1XH17 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim72Q1XH17 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim72Q1XH17 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim72Q1XH17 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim72Q1XH17 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim72Q1XH17 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim72Q1XH17 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim72Q1XH17 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim72Q1XH17 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim72Q1XH17 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim72Q1XH17 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim72Q1XH17 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim72Q1XH17 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim72Q1XH17 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim72Q1XH17 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim72Q1XH17 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim72Q1XH17 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim72Q1XH17 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim72Q1XH17 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim72Q1XH17 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim72Q1XH17 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim72Q1XH17 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim72Q1XH17 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim72Q1XH17 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim72Q1XH17 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim72Q1XH17 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim72Q1XH17 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim72Q1XH17 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim72Q1XH17 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim72Q1XH17 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim72Q1XH17 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim72Q1XH17 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim72Q1XH17 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trim72Q1XH17 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trim72Q1XH17 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Trim72Q1XH17 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trim72Q1XH17 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms