Protein–RNA interactions for Protein: Q12045

VIK1, Spindle pole body-associated protein VIK1, yeast

Predictions only

Length 647 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
VIK1	Q12045	BNA5	YLR231C	1362 nt		5.56	□□□□□ -1.52
VIK1	Q12045	TAX4	YJL083W	1815 nt		5.56	□□□□□ -1.52
VIK1	Q12045	MAK32	YCR019W	1092 nt		5.56	□□□□□ -1.52
VIK1	Q12045	BUD32	YGR262C	786 nt		5.56	□□□□□ -1.52
VIK1	Q12045	ARP1	YHR129C	1155 nt		5.56	□□□□□ -1.52
VIK1	Q12045	OCA5	YHL029C	2040 nt		5.56	□□□□□ -1.52
VIK1	Q12045	FRE3	YOR381W	2136 nt		5.56	□□□□□ -1.52
VIK1	Q12045	YDR015C	YDR015C	240 nt		5.55	□□□□□ -1.52
VIK1	Q12045	TFG2	YGR005C	1203 nt		5.55	□□□□□ -1.52
VIK1	Q12045	PHB1	YGR132C	864 nt		5.55	□□□□□ -1.52
VIK1	Q12045	SPG4	YMR107W	348 nt		5.55	□□□□□ -1.52
VIK1	Q12045	YMR122C	YMR122C	375 nt		5.55	□□□□□ -1.52
VIK1	Q12045	PDR16	YNL231C	1056 nt		5.55	□□□□□ -1.52
VIK1	Q12045	ENV9	YOR246C	993 nt		5.55	□□□□□ -1.52
VIK1	Q12045	ERG1	YGR175C	1491 nt		5.55	□□□□□ -1.52
VIK1	Q12045	VAN1	YML115C	1608 nt		5.55	□□□□□ -1.52
VIK1	Q12045	YME1	YPR024W	2244 nt		5.55	□□□□□ -1.52
VIK1	Q12045	PDH1	YPR002W	1551 nt		5.55	□□□□□ -1.52
VIK1	Q12045	YDL218W	YDL218W	954 nt		5.54	□□□□□ -1.52
VIK1	Q12045	FAF1	YIL019W	1041 nt		5.54	□□□□□ -1.52
VIK1	Q12045	DJP1	YIR004W	1299 nt		5.54	□□□□□ -1.52
VIK1	Q12045	GFD1	YMR255W	567 nt		5.54	□□□□□ -1.52
VIK1	Q12045	RBD2	YPL246C	789 nt		5.54	□□□□□ -1.52
VIK1	Q12045	UTP4	YDR324C	2331 nt		5.54	□□□□□ -1.52
VIK1	Q12045	DBF4	YDR052C	2115 nt		5.54	□□□□□ -1.52
VIK1	Q12045	YPL277C	YPL277C	1464 nt		5.53	□□□□□ -1.52
VIK1	Q12045	MRF1	YGL143C	1242 nt		5.53	□□□□□ -1.52
VIK1	Q12045	LYS12	YIL094C	1116 nt		5.53	□□□□□ -1.52
VIK1	Q12045	MRPL15	YLR312W-A	762 nt		5.53	□□□□□ -1.52
VIK1	Q12045	YMR252C	YMR252C	405 nt		5.53	□□□□□ -1.52
VIK1	Q12045	COX11	YPL132W	903 nt		5.53	□□□□□ -1.52
VIK1	Q12045	NSI1	YDR026C	1713 nt		5.52	□□□□□ -1.53
VIK1	Q12045	COG1	YGL223C	1254 nt		5.52	□□□□□ -1.53
VIK1	Q12045	PGA2	YNL149C	390 nt		5.52	□□□□□ -1.53
VIK1	Q12045	OSW2	YLR054C	2175 nt		5.52	□□□□□ -1.53
VIK1	Q12045	SSZ1	YHR064C	1617 nt		5.52	□□□□□ -1.53
VIK1	Q12045	CDC1	YDR182W	1476 nt		5.51	□□□□□ -1.53
VIK1	Q12045	SNU71	YGR013W	1863 nt		5.51	□□□□□ -1.53
VIK1	Q12045	SEC18	YBR080C	2277 nt		5.51	□□□□□ -1.53
VIK1	Q12045	HST2	YPL015C	1074 nt		5.51	□□□□□ -1.53
VIK1	Q12045	CTS2	YDR371W	1536 nt		5.51	□□□□□ -1.53
VIK1	Q12045	BUD14	YAR014C	2130 nt		5.51	□□□□□ -1.53
VIK1	Q12045	VNX1	YNL321W	2727 nt		5.51	□□□□□ -1.53
VIK1	Q12045	DEF1	YKL054C	2217 nt		5.51	□□□□□ -1.53
VIK1	Q12045	RPT4	YOR259C	1314 nt		5.5	□□□□□ -1.53
VIK1	Q12045	YDL121C	YDL121C	450 nt		5.5	□□□□□ -1.53
VIK1	Q12045	YDL129W	YDL129W	876 nt		5.5	□□□□□ -1.53
VIK1	Q12045	LEU5	YHR002W	1074 nt		5.5	□□□□□ -1.53
VIK1	Q12045	YHR218W-A	YHR218W-A	318 nt		5.5	□□□□□ -1.53
VIK1	Q12045	PHO86	YJL117W	936 nt		5.5	□□□□□ -1.53
VIK1	Q12045	TDH2	YJR009C	999 nt		5.5	□□□□□ -1.53
VIK1	Q12045	YKR041W	YKR041W	753 nt		5.5	□□□□□ -1.53
VIK1	Q12045	YMR295C	YMR295C	594 nt		5.5	□□□□□ -1.53
VIK1	Q12045	YNL285W	YNL285W	372 nt		5.5	□□□□□ -1.53
VIK1	Q12045	YBL112C	YBL112C	318 nt		5.5	□□□□□ -1.53
VIK1	Q12045	CAM1	YPL048W	1248 nt		5.5	□□□□□ -1.53
VIK1	Q12045	YTH1	YPR107C	627 nt		5.5	□□□□□ -1.53
VIK1	Q12045	MLC2	YPR188C	492 nt		5.5	□□□□□ -1.53
VIK1	Q12045	VRP1	YLR337C	2454 nt		5.5	□□□□□ -1.53
VIK1	Q12045	KDX1	YKL161C	1302 nt		5.49	□□□□□ -1.53
VIK1	Q12045	SEC12	YNR026C	1416 nt		5.49	□□□□□ -1.53
VIK1	Q12045	MET7	YOR241W	1647 nt		5.49	□□□□□ -1.53
VIK1	Q12045	HVG1	YER039C	750 nt		5.49	□□□□□ -1.53
VIK1	Q12045	YHR213W-A	YHR213W-A	234 nt		5.49	□□□□□ -1.53
VIK1	Q12045	AIM20	YIL158W	615 nt		5.49	□□□□□ -1.53
VIK1	Q12045	YNL042W-B	YNL042W-B	258 nt		5.49	□□□□□ -1.53
VIK1	Q12045	APE3	YBR286W	1614 nt		5.48	□□□□□ -1.53
VIK1	Q12045	YDR109C	YDR109C	2148 nt		5.48	□□□□□ -1.53
VIK1	Q12045	MSP1	YGR028W	1089 nt		5.48	□□□□□ -1.53
VIK1	Q12045	POR2	YIL114C	846 nt		5.48	□□□□□ -1.53
VIK1	Q12045	JNM1	YMR294W	1122 nt		5.48	□□□□□ -1.53
VIK1	Q12045	NRM1	YNR009W	750 nt		5.48	□□□□□ -1.53
VIK1	Q12045	snR32	snR32	188 nt		5.48	□□□□□ -1.53
VIK1	Q12045	SSY5	YJL156C	2100 nt		5.48	□□□□□ -1.53
VIK1	Q12045	MDY2	YOL111C	639 nt		5.47	□□□□□ -1.53
VIK1	Q12045	YML082W	YML082W	1950 nt		5.46	□□□□□ -1.54
VIK1	Q12045	DPH2	YKL191W	1605 nt		5.46	□□□□□ -1.54
VIK1	Q12045	RAD53	YPL153C	2466 nt		5.46	□□□□□ -1.54
VIK1	Q12045	ATG7	YHR171W	1893 nt		5.46	□□□□□ -1.54
VIK1	Q12045	PHM8	YER037W	966 nt		5.46	□□□□□ -1.54
VIK1	Q12045	BUB3	YOR026W	1026 nt		5.46	□□□□□ -1.54
VIK1	Q12045	HAP1	YLR256W	4509 nt		5.46	□□□□□ -1.54
VIK1	Q12045	DFG5	YMR238W	1377 nt		5.45	□□□□□ -1.54
VIK1	Q12045	ATE1	YGL017W	1512 nt		5.45	□□□□□ -1.54
VIK1	Q12045	AVO1	YOL078W	3531 nt		5.45	□□□□□ -1.54
VIK1	Q12045	NQM1	YGR043C	1002 nt		5.45	□□□□□ -1.54
VIK1	Q12045	SCS22	YBL091C-A	528 nt		5.45	□□□□□ -1.54
VIK1	Q12045	GRS1	YBR121C	2004 nt		5.45	□□□□□ -1.54
VIK1	Q12045	GLO2	YDR272W	825 nt		5.44	□□□□□ -1.54
VIK1	Q12045	YER010C	YER010C	705 nt		5.44	□□□□□ -1.54
VIK1	Q12045	CTR2	YHR175W	570 nt		5.44	□□□□□ -1.54
VIK1	Q12045	RPR2	YIR015W	435 nt		5.44	□□□□□ -1.54
VIK1	Q12045	RPS5	YJR123W	678 nt		5.44	□□□□□ -1.54
VIK1	Q12045	HXT5	YHR096C	1779 nt		5.44	□□□□□ -1.54
VIK1	Q12045	HES1	YOR237W	1305 nt		5.44	□□□□□ -1.54
VIK1	Q12045	ACS2	YLR153C	2052 nt		5.43	□□□□□ -1.54
VIK1	Q12045	FET3	YMR058W	1911 nt		5.43	□□□□□ -1.54
VIK1	Q12045	SEC20	YDR498C	1152 nt		5.43	□□□□□ -1.54
VIK1	Q12045	CIN4	YMR138W	576 nt		5.43	□□□□□ -1.54
VIK1	Q12045	YPL062W	YPL062W	405 nt		5.43	□□□□□ -1.54

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