Protein–RNA interactions for Protein: P34228

SEF1, Putative transcription factor SEF1, yeastyeast

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Length 1,148 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SEF1P34228 YCR006CYCR006C 474 nt5.55□□□□□ -1.52
SEF1P34228 SSP120YLR250W 705 nt5.55□□□□□ -1.52
SEF1P34228 YPL071CYPL071C 471 nt5.55□□□□□ -1.52
SEF1P34228 MET7YOR241W 1647 nt5.55□□□□□ -1.52
SEF1P34228 WHI4YDL224C 1950 nt5.55□□□□□ -1.52
SEF1P34228 EXG1YLR300W 1347 nt5.54□□□□□ -1.52
SEF1P34228 CRZ1YNL027W 2037 nt5.54□□□□□ -1.52
SEF1P34228 GEX1YCL073C 1848 nt5.54□□□□□ -1.52
SEF1P34228 UGX2YDL169C 672 nt5.54□□□□□ -1.52
SEF1P34228 RPE1YJL121C 717 nt5.54□□□□□ -1.52
SEF1P34228 MTF1YMR228W 1026 nt5.54□□□□□ -1.52
SEF1P34228 NPT1YOR209C 1290 nt5.54□□□□□ -1.52
SEF1P34228 YMC1YPR058W 924 nt5.54□□□□□ -1.52
SEF1P34228 SCT1YBL011W 2280 nt5.54□□□□□ -1.52
SEF1P34228 ISN1YOR155C 1353 nt5.54□□□□□ -1.52
SEF1P34228 RHB1YCR027C 630 nt5.53□□□□□ -1.52
SEF1P34228 MPM1YJL066C 759 nt5.53□□□□□ -1.52
SEF1P34228 APN1YKL114C 1104 nt5.53□□□□□ -1.52
SEF1P34228 DUS4YLR405W 1104 nt5.53□□□□□ -1.52
SEF1P34228 NSI1YDR026C 1713 nt5.53□□□□□ -1.52
SEF1P34228 NOP2YNL061W 1857 nt5.53□□□□□ -1.52
SEF1P34228 YPL245WYPL245W 1365 nt5.53□□□□□ -1.52
SEF1P34228 ARH1YDR376W 1482 nt5.52□□□□□ -1.53
SEF1P34228 ADE12YNL220W 1302 nt5.52□□□□□ -1.53
SEF1P34228 UTP4YDR324C 2331 nt5.52□□□□□ -1.53
SEF1P34228 YDR396WYDR396W 501 nt5.52□□□□□ -1.53
SEF1P34228 PYC2YBR218C 3543 nt5.52□□□□□ -1.53
SEF1P34228 GUP2YPL189W 1830 nt5.52□□□□□ -1.53
SEF1P34228 YDR514CYDR514C 1452 nt5.51□□□□□ -1.53
SEF1P34228 PGM1YKL127W 1713 nt5.51□□□□□ -1.53
SEF1P34228 STB5YHR178W 2232 nt5.51□□□□□ -1.53
SEF1P34228 MCM6YGL201C 3054 nt5.51□□□□□ -1.53
SEF1P34228 SPC42YKL042W 1092 nt5.51□□□□□ -1.53
SEF1P34228 RPL21AYBR191W 483 nt5.51□□□□□ -1.53
SEF1P34228 CRP1YHR146W 1398 nt5.51□□□□□ -1.53
SEF1P34228 CCZ1YBR131W 2115 nt5.51□□□□□ -1.53
SEF1P34228 HSP104YLL026W 2727 nt5.5□□□□□ -1.53
SEF1P34228 MRC1YCL061C 3291 nt5.5□□□□□ -1.53
SEF1P34228 YCK1YHR135C 1617 nt5.5□□□□□ -1.53
SEF1P34228 COX9YDL067C 180 nt5.5□□□□□ -1.53
SEF1P34228 TMT1YER175C 900 nt5.5□□□□□ -1.53
SEF1P34228 LDS1YAL018C 978 nt5.5□□□□□ -1.53
SEF1P34228 SRV2YNL138W 1581 nt5.5□□□□□ -1.53
SEF1P34228 FAT3YKL187C 2253 nt5.49□□□□□ -1.53
SEF1P34228 MMS21YEL019C 804 nt5.49□□□□□ -1.53
SEF1P34228 YHR070C-AYHR070C-A 411 nt5.49□□□□□ -1.53
SEF1P34228 YDR132CYDR132C 1488 nt5.49□□□□□ -1.53
SEF1P34228 MMR1YLR190W 1476 nt5.49□□□□□ -1.53
SEF1P34228 SPC97YHR172W 2472 nt5.49□□□□□ -1.53
SEF1P34228 NHA1YLR138W 2958 nt5.49□□□□□ -1.53
SEF1P34228 BRL1YHR036W 1416 nt5.48□□□□□ -1.53
SEF1P34228 PPR1YLR014C 2715 nt5.48□□□□□ -1.53
SEF1P34228 VNX1YNL321W 2727 nt5.48□□□□□ -1.53
SEF1P34228 HRQ1YDR291W 3234 nt5.48□□□□□ -1.53
SEF1P34228 YDL119CYDL119C 924 nt5.48□□□□□ -1.53
SEF1P34228 YDL129WYDL129W 876 nt5.48□□□□□ -1.53
SEF1P34228 COX20YDR231C 618 nt5.48□□□□□ -1.53
SEF1P34228 IPK1YDR315C 846 nt5.48□□□□□ -1.53
SEF1P34228 YHR095WYHR095W 495 nt5.48□□□□□ -1.53
SEF1P34228 GAT4YIR013C 366 nt5.48□□□□□ -1.53
SEF1P34228 PML1YLR016C 615 nt5.48□□□□□ -1.53
SEF1P34228 SNO4YMR322C 714 nt5.48□□□□□ -1.53
SEF1P34228 BSC4YNL269W 396 nt5.48□□□□□ -1.53
SEF1P34228 RRS1YOR294W 612 nt5.48□□□□□ -1.53
SEF1P34228 HSP33YOR391C 714 nt5.48□□□□□ -1.53
SEF1P34228 HSP32YPL280W 714 nt5.48□□□□□ -1.53
SEF1P34228 MUM3YOR298W 1440 nt5.48□□□□□ -1.53
SEF1P34228 WTM1YOR230W 1314 nt5.48□□□□□ -1.53
SEF1P34228 YDL022C-AYDL022C-A 249 nt5.47□□□□□ -1.53
SEF1P34228 RAM1YDL090C 1296 nt5.47□□□□□ -1.53
SEF1P34228 PCL6YER059W 1263 nt5.47□□□□□ -1.53
SEF1P34228 GTO1YGR154C 1071 nt5.47□□□□□ -1.53
SEF1P34228 ISY1YJR050W 708 nt5.47□□□□□ -1.53
SEF1P34228 YNL042W-BYNL042W-B 258 nt5.47□□□□□ -1.53
SEF1P34228 CPA1YOR303W 1236 nt5.47□□□□□ -1.53
SEF1P34228 AAP1YHR047C 2571 nt5.47□□□□□ -1.53
SEF1P34228 ALT1YLR089C 1779 nt5.47□□□□□ -1.53
SEF1P34228 YIR007WYIR007W 2295 nt5.46□□□□□ -1.53
SEF1P34228 PMT2YAL023C 2280 nt5.46□□□□□ -1.53
SEF1P34228 PFK2YMR205C 2880 nt5.46□□□□□ -1.53
SEF1P34228 WHI2YOR043W 1461 nt5.46□□□□□ -1.53
SEF1P34228 COR1YBL045C 1374 nt5.46□□□□□ -1.54
SEF1P34228 YTP1YNL237W 1380 nt5.46□□□□□ -1.54
SEF1P34228 LPL1YOR059C 1353 nt5.46□□□□□ -1.54
SEF1P34228 YDR034W-BYDR034W-B 156 nt5.46□□□□□ -1.54
SEF1P34228 VPS61YDR136C 573 nt5.46□□□□□ -1.54
SEF1P34228 GPI11YDR302W 660 nt5.46□□□□□ -1.54
SEF1P34228 YEL068CYEL068C 333 nt5.46□□□□□ -1.54
SEF1P34228 YJL171CYJL171C 1191 nt5.46□□□□□ -1.54
SEF1P34228 MRPS16YPL013C 366 nt5.46□□□□□ -1.54
SEF1P34228 UGO1YDR470C 1509 nt5.46□□□□□ -1.54
SEF1P34228 MDM31YHR194W 1740 nt5.45□□□□□ -1.54
SEF1P34228 YDR278CYDR278C 318 nt5.45□□□□□ -1.54
SEF1P34228 MRPL25YGR076C 474 nt5.45□□□□□ -1.54
SEF1P34228 YML012C-AYML012C-A 378 nt5.45□□□□□ -1.54
SEF1P34228 TSA1YML028W 591 nt5.45□□□□□ -1.54
SEF1P34228 FHL1YPR104C 2811 nt5.45□□□□□ -1.54
SEF1P34228 PYK2YOR347C 1521 nt5.44□□□□□ -1.54
SEF1P34228 SPO12YHR152W 522 nt5.44□□□□□ -1.54
SEF1P34228 COA1YIL157C 594 nt5.44□□□□□ -1.54
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