Protein–RNA interactions for Protein: O43736

ITM2A, Integral membrane protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITM2AO43736 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ITM2AO43736 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ITM2AO43736 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ITM2AO43736 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ITM2AO43736 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ITM2AO43736 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ITM2AO43736 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ITM2AO43736 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ITM2AO43736 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ITM2AO43736 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ITM2AO43736 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ITM2AO43736 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ITM2AO43736 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ITM2AO43736 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ITM2AO43736 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ITM2AO43736 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ITM2AO43736 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ITM2AO43736 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ITM2AO43736 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ITM2AO43736 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ITM2AO43736 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ITM2AO43736 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ITM2AO43736 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ITM2AO43736 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ITM2AO43736 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ITM2AO43736 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ITM2AO43736 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ITM2AO43736 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ITM2AO43736 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ITM2AO43736 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ITM2AO43736 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ITM2AO43736 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ITM2AO43736 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ITM2AO43736 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ITM2AO43736 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ITM2AO43736 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ITM2AO43736 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ITM2AO43736 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ITM2AO43736 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ITM2AO43736 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ITM2AO43736 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ITM2AO43736 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ITM2AO43736 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ITM2AO43736 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ITM2AO43736 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ITM2AO43736 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ITM2AO43736 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ITM2AO43736 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ITM2AO43736 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ITM2AO43736 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ITM2AO43736 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ITM2AO43736 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ITM2AO43736 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ITM2AO43736 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ITM2AO43736 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
ITM2AO43736 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ITM2AO43736 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ITM2AO43736 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ITM2AO43736 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ITM2AO43736 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ITM2AO43736 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ITM2AO43736 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ITM2AO43736 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ITM2AO43736 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ITM2AO43736 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ITM2AO43736 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ITM2AO43736 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ITM2AO43736 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ITM2AO43736 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ITM2AO43736 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ITM2AO43736 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ITM2AO43736 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ITM2AO43736 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ITM2AO43736 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ITM2AO43736 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ITM2AO43736 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ITM2AO43736 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ITM2AO43736 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ITM2AO43736 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ITM2AO43736 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
ITM2AO43736 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ITM2AO43736 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ITM2AO43736 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ITM2AO43736 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ITM2AO43736 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ITM2AO43736 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ITM2AO43736 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ITM2AO43736 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ITM2AO43736 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ITM2AO43736 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ITM2AO43736 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ITM2AO43736 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ITM2AO43736 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
ITM2AO43736 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ITM2AO43736 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ITM2AO43736 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
ITM2AO43736 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ITM2AO43736 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ITM2AO43736 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
ITM2AO43736 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.2 ms