Protein–RNA interactions for Protein: Q05948

YLR225C, Uncharacterized SVF1-like protein YLR225C, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YLR225CQ05948 ATF1YOR377W 1578 nt6.86□□□□□ -1.31
YLR225CQ05948 FRE5YOR384W 2085 nt6.85□□□□□ -1.31
YLR225CQ05948 ERV14YGL054C 417 nt6.85□□□□□ -1.31
YLR225CQ05948 SAY1YGR263C 1275 nt6.85□□□□□ -1.31
YLR225CQ05948 PAC2YER007W 1557 nt6.85□□□□□ -1.31
YLR225CQ05948 FLC2YAL053W 2352 nt6.84□□□□□ -1.31
YLR225CQ05948 ADY2YCR010C 852 nt6.84□□□□□ -1.31
YLR225CQ05948 YDL085C-AYDL085C-A 207 nt6.84□□□□□ -1.31
YLR225CQ05948 YUR1YJL139C 1287 nt6.84□□□□□ -1.31
YLR225CQ05948 MEH1YKR007W 555 nt6.84□□□□□ -1.31
YLR225CQ05948 PXL1YKR090W 2121 nt6.84□□□□□ -1.31
YLR225CQ05948 MRPL22YNL177C 930 nt6.84□□□□□ -1.31
YLR225CQ05948 HRT1YOL133W 366 nt6.84□□□□□ -1.31
YLR225CQ05948 YPL250W-AYPL250W-A 288 nt6.84□□□□□ -1.31
YLR225CQ05948 UBA3YPR066W 900 nt6.84□□□□□ -1.31
YLR225CQ05948 RIX7YLL034C 2514 nt6.84□□□□□ -1.31
YLR225CQ05948 CAN1YEL063C 1773 nt6.83□□□□□ -1.32
YLR225CQ05948 FZF1YGL254W 900 nt6.83□□□□□ -1.32
YLR225CQ05948 YNG2YHR090C 849 nt6.83□□□□□ -1.32
YLR225CQ05948 YIR020W-AYIR020W-A 243 nt6.83□□□□□ -1.32
YLR225CQ05948 LCB3YJL134W 1230 nt6.83□□□□□ -1.32
YLR225CQ05948 CDC11YJR076C 1248 nt6.83□□□□□ -1.32
YLR225CQ05948 PUF3YLL013C 2640 nt6.82□□□□□ -1.32
YLR225CQ05948 YDR541CYDR541C 1035 nt6.82□□□□□ -1.32
YLR225CQ05948 DUO1YGL061C 744 nt6.82□□□□□ -1.32
YLR225CQ05948 SKI8YGL213C 1194 nt6.82□□□□□ -1.32
YLR225CQ05948 EFM3YJR129C 1020 nt6.82□□□□□ -1.32
YLR225CQ05948 SPE4YLR146C 903 nt6.82□□□□□ -1.32
YLR225CQ05948 NOP7YGR103W 1818 nt6.82□□□□□ -1.32
YLR225CQ05948 VHS1YDR247W 1386 nt6.82□□□□□ -1.32
YLR225CQ05948 YIL108WYIL108W 2091 nt6.81□□□□□ -1.32
YLR225CQ05948 RTG3YBL103C 1461 nt6.81□□□□□ -1.32
YLR225CQ05948 tG(GCC)BtG(GCC)B 71 nt6.81□□□□□ -1.32
YLR225CQ05948 SUF16tG(GCC)C 71 nt6.81□□□□□ -1.32
YLR225CQ05948 tG(GCC)D1tG(GCC)D1 71 nt6.81□□□□□ -1.32
YLR225CQ05948 tG(GCC)D2tG(GCC)D2 71 nt6.81□□□□□ -1.32
YLR225CQ05948 tG(GCC)EtG(GCC)E 71 nt6.81□□□□□ -1.32
YLR225CQ05948 SUF20tG(GCC)F1 71 nt6.81□□□□□ -1.32
YLR225CQ05948 tG(GCC)F2tG(GCC)F2 71 nt6.81□□□□□ -1.32
YLR225CQ05948 tG(GCC)G1tG(GCC)G1 71 nt6.81□□□□□ -1.32
YLR225CQ05948 tG(GCC)G2tG(GCC)G2 71 nt6.81□□□□□ -1.32
YLR225CQ05948 tG(GCC)J1tG(GCC)J1 71 nt6.81□□□□□ -1.32
YLR225CQ05948 SUF23tG(GCC)J2 71 nt6.81□□□□□ -1.32
YLR225CQ05948 tG(GCC)MtG(GCC)M 71 nt6.81□□□□□ -1.32
YLR225CQ05948 tG(GCC)O1tG(GCC)O1 71 nt6.81□□□□□ -1.32
YLR225CQ05948 SUF17tG(GCC)O2 71 nt6.81□□□□□ -1.32
YLR225CQ05948 tG(GCC)P1tG(GCC)P1 71 nt6.81□□□□□ -1.32
YLR225CQ05948 tG(GCC)P2tG(GCC)P2 71 nt6.81□□□□□ -1.32
YLR225CQ05948 OKP1YGR179C 1221 nt6.81□□□□□ -1.32
YLR225CQ05948 EFM4YIL064W 774 nt6.81□□□□□ -1.32
YLR225CQ05948 ERP2YAL007C 648 nt6.81□□□□□ -1.32
YLR225CQ05948 SYN8YAL014C 768 nt6.81□□□□□ -1.32
YLR225CQ05948 YLR198CYLR198C 360 nt6.81□□□□□ -1.32
YLR225CQ05948 YNL319WYNL319W 441 nt6.81□□□□□ -1.32
YLR225CQ05948 VPS28YPL065W 729 nt6.81□□□□□ -1.32
YLR225CQ05948 COR1YBL045C 1374 nt6.81□□□□□ -1.32
YLR225CQ05948 YDR514CYDR514C 1452 nt6.8□□□□□ -1.32
YLR225CQ05948 HMLALPHA1YCL066W 528 nt6.8□□□□□ -1.32
YLR225CQ05948 MATALPHA1YCR040W 528 nt6.8□□□□□ -1.32
YLR225CQ05948 YDL022C-AYDL022C-A 249 nt6.8□□□□□ -1.32
YLR225CQ05948 YDL023CYDL023C 321 nt6.8□□□□□ -1.32
YLR225CQ05948 ADH4YGL256W 1149 nt6.8□□□□□ -1.32
YLR225CQ05948 PRI2YKL045W 1587 nt6.8□□□□□ -1.32
YLR225CQ05948 MIA40YKL195W 1212 nt6.8□□□□□ -1.32
YLR225CQ05948 MRPL4YLR439W 960 nt6.8□□□□□ -1.32
YLR225CQ05948 NTE1YML059C 5040 nt6.8□□□□□ -1.32
YLR225CQ05948 YOL038C-AYOL038C-A 96 nt6.8□□□□□ -1.32
YLR225CQ05948 ATG12YBR217W 561 nt6.8□□□□□ -1.32
YLR225CQ05948 GUF1YLR289W 1938 nt6.8□□□□□ -1.32
YLR225CQ05948 EDE1YBL047C 4146 nt6.79□□□□□ -1.32
YLR225CQ05948 STD1YOR047C 1335 nt6.79□□□□□ -1.32
YLR225CQ05948 SMF3YLR034C 1422 nt6.79□□□□□ -1.32
YLR225CQ05948 ARP2YDL029W 1176 nt6.79□□□□□ -1.32
YLR225CQ05948 YDR161WYDR161W 1164 nt6.79□□□□□ -1.32
YLR225CQ05948 SFC1YJR095W 969 nt6.79□□□□□ -1.32
YLR225CQ05948 YLR169WYLR169W 354 nt6.79□□□□□ -1.32
YLR225CQ05948 YML012C-AYML012C-A 378 nt6.79□□□□□ -1.32
YLR225CQ05948 AIM33YML087C 939 nt6.79□□□□□ -1.32
YLR225CQ05948 CIN4YMR138W 576 nt6.79□□□□□ -1.32
YLR225CQ05948 YNR075C-AYNR075C-A 93 nt6.79□□□□□ -1.32
YLR225CQ05948 MRK1YDL079C 1506 nt6.79□□□□□ -1.32
YLR225CQ05948 AMD2YDR242W 1650 nt6.78□□□□□ -1.32
YLR225CQ05948 GET3YDL100C 1065 nt6.78□□□□□ -1.32
YLR225CQ05948 YFL013W-AYFL013W-A 804 nt6.78□□□□□ -1.32
YLR225CQ05948 FSH1YHR049W 732 nt6.78□□□□□ -1.32
YLR225CQ05948 MRP17YKL003C 396 nt6.78□□□□□ -1.32
YLR225CQ05948 SFT2YBL102W 648 nt6.78□□□□□ -1.32
YLR225CQ05948 ARG1YOL058W 1263 nt6.78□□□□□ -1.32
YLR225CQ05948 BAG7YOR134W 1230 nt6.78□□□□□ -1.32
YLR225CQ05948 MRPS5YBR251W 924 nt6.78□□□□□ -1.32
YLR225CQ05948 HEM1YDR232W 1647 nt6.77□□□□□ -1.33
YLR225CQ05948 YMR155WYMR155W 1644 nt6.77□□□□□ -1.33
YLR225CQ05948 RRP45YDR280W 918 nt6.77□□□□□ -1.33
YLR225CQ05948 MRPL28YDR462W 444 nt6.77□□□□□ -1.33
YLR225CQ05948 YGR011WYGR011W 327 nt6.77□□□□□ -1.33
YLR225CQ05948 YGR022CYGR022C 330 nt6.77□□□□□ -1.33
YLR225CQ05948 HGH1YGR187C 1185 nt6.77□□□□□ -1.33
YLR225CQ05948 LDS1YAL018C 978 nt6.77□□□□□ -1.33
YLR225CQ05948 YMR253CYMR253C 1245 nt6.77□□□□□ -1.33
YLR225CQ05948 YNL042W-BYNL042W-B 258 nt6.77□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 74.5 ms