Protein–RNA interactions for Protein: P38316

ATG12, Ubiquitin-like protein ATG12, yeast

Predictions only

Length 186 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ATG12	P38316	MTC5	YDR128W	3447 nt		5.83	□□□□□ -1.48
ATG12	P38316	YDR109C	YDR109C	2148 nt		5.83	□□□□□ -1.48
ATG12	P38316	ARP2	YDL029W	1176 nt		5.83	□□□□□ -1.48
ATG12	P38316	YER186C	YER186C	921 nt		5.83	□□□□□ -1.48
ATG12	P38316	ARG1	YOL058W	1263 nt		5.83	□□□□□ -1.48
ATG12	P38316	ARR3	YPR201W	1215 nt		5.83	□□□□□ -1.48
ATG12	P38316	MRPL36	YBR122C	534 nt		5.83	□□□□□ -1.48
ATG12	P38316	YBR124W	YBR124W	360 nt		5.83	□□□□□ -1.48
ATG12	P38316	GFA1	YKL104C	2154 nt		5.82	□□□□□ -1.48
ATG12	P38316	DCN1	YLR128W	810 nt		5.82	□□□□□ -1.48
ATG12	P38316	YEH1	YLL012W	1722 nt		5.82	□□□□□ -1.48
ATG12	P38316	YGL036W	YGL036W	2730 nt		5.82	□□□□□ -1.48
ATG12	P38316	ACS1	YAL054C	2142 nt		5.81	□□□□□ -1.48
ATG12	P38316	HAS1	YMR290C	1518 nt		5.81	□□□□□ -1.48
ATG12	P38316	YDR154C	YDR154C	351 nt		5.81	□□□□□ -1.48
ATG12	P38316	SEC20	YDR498C	1152 nt		5.81	□□□□□ -1.48
ATG12	P38316	YEA6	YEL006W	1008 nt		5.81	□□□□□ -1.48
ATG12	P38316	SYN8	YAL014C	768 nt		5.81	□□□□□ -1.48
ATG12	P38316	LST8	YNL006W	912 nt		5.81	□□□□□ -1.48
ATG12	P38316	SHM1	YBR263W	1473 nt		5.81	□□□□□ -1.48
ATG12	P38316	LYS12	YIL094C	1116 nt		5.8	□□□□□ -1.48
ATG12	P38316	STM1	YLR150W	822 nt		5.8	□□□□□ -1.48
ATG12	P38316	SCO2	YBR024W	906 nt		5.8	□□□□□ -1.48
ATG12	P38316	SGE1	YPR198W	1632 nt		5.79	□□□□□ -1.48
ATG12	P38316	NPA3	YJR072C	1158 nt		5.79	□□□□□ -1.48
ATG12	P38316	CAR1	YPL111W	1002 nt		5.79	□□□□□ -1.48
ATG12	P38316	YRF1-4	YLR466W	4149 nt		5.79	□□□□□ -1.48
ATG12	P38316	YME1	YPR024W	2244 nt		5.79	□□□□□ -1.48
ATG12	P38316	ASN2	YGR124W	1719 nt		5.79	□□□□□ -1.48
ATG12	P38316	EHD3	YDR036C	1503 nt		5.79	□□□□□ -1.48
ATG12	P38316	YOS9	YDR057W	1629 nt		5.78	□□□□□ -1.48
ATG12	P38316	ATP1	YBL099W	1638 nt		5.78	□□□□□ -1.48
ATG12	P38316	YBR284W	YBR284W	2394 nt		5.78	□□□□□ -1.48
ATG12	P38316	YFL064C	YFL064C	525 nt		5.78	□□□□□ -1.48
ATG12	P38316	KSS1	YGR040W	1107 nt		5.78	□□□□□ -1.48
ATG12	P38316	APS3	YJL024C	585 nt		5.78	□□□□□ -1.48
ATG12	P38316	YOL131W	YOL131W	327 nt		5.78	□□□□□ -1.48
ATG12	P38316	YPR202W	YPR202W	717 nt		5.78	□□□□□ -1.48
ATG12	P38316	YML082W	YML082W	1950 nt		5.78	□□□□□ -1.48
ATG12	P38316	LAG2	YOL025W	1983 nt		5.78	□□□□□ -1.48
ATG12	P38316	NMD5	YJR132W	3147 nt		5.77	□□□□□ -1.49
ATG12	P38316	ATG22	YCL038C	1587 nt		5.77	□□□□□ -1.49
ATG12	P38316	EFT2	YDR385W	2529 nt		5.77	□□□□□ -1.49
ATG12	P38316	EFT1	YOR133W	2529 nt		5.77	□□□□□ -1.49
ATG12	P38316	ATO3	YDR384C	828 nt		5.77	□□□□□ -1.49
ATG12	P38316	MLC1	YGL106W	450 nt		5.77	□□□□□ -1.49
ATG12	P38316	PTK2	YJR059W	2457 nt		5.77	□□□□□ -1.49
ATG12	P38316	NUD1	YOR373W	2556 nt		5.76	□□□□□ -1.49
ATG12	P38316	ORC5	YNL261W	1440 nt		5.76	□□□□□ -1.49
ATG12	P38316	AMA1	YGR225W	1782 nt		5.76	□□□□□ -1.49
ATG12	P38316	YDL057W	YDL057W	987 nt		5.76	□□□□□ -1.49
ATG12	P38316	YER010C	YER010C	705 nt		5.76	□□□□□ -1.49
ATG12	P38316	PGU1	YJR153W	1086 nt		5.76	□□□□□ -1.49
ATG12	P38316	PRP46	YPL151C	1356 nt		5.76	□□□□□ -1.49
ATG12	P38316	DAL82	YNL314W	768 nt		5.75	□□□□□ -1.49
ATG12	P38316	CSG2	YBR036C	1233 nt		5.75	□□□□□ -1.49
ATG12	P38316	QNS1	YHR074W	2145 nt		5.75	□□□□□ -1.49
ATG12	P38316	KTR5	YNL029C	1569 nt		5.75	□□□□□ -1.49
ATG12	P38316	CYC8	YBR112C	2901 nt		5.75	□□□□□ -1.49
ATG12	P38316	YMR155W	YMR155W	1644 nt		5.74	□□□□□ -1.49
ATG12	P38316	CHO1	YER026C	831 nt		5.74	□□□□□ -1.49
ATG12	P38316	VMA16	YHR026W	642 nt		5.74	□□□□□ -1.49
ATG12	P38316	MRPL13	YKR006C	795 nt		5.74	□□□□□ -1.49
ATG12	P38316	CIT3	YPR001W	1461 nt		5.74	□□□□□ -1.49
ATG12	P38316	QDR3	YBR043C	2070 nt		5.74	□□□□□ -1.49
ATG12	P38316	TEA1	YOR337W	2280 nt		5.73	□□□□□ -1.49
ATG12	P38316	KNH1	YDL049C	807 nt		5.73	□□□□□ -1.49
ATG12	P38316	SHO1	YER118C	1104 nt		5.73	□□□□□ -1.49
ATG12	P38316	YGR176W	YGR176W	348 nt		5.73	□□□□□ -1.49
ATG12	P38316	GAT4	YIR013C	366 nt		5.73	□□□□□ -1.49
ATG12	P38316	PNP1	YLR209C	936 nt		5.73	□□□□□ -1.49
ATG12	P38316	GFD1	YMR255W	567 nt		5.73	□□□□□ -1.49
ATG12	P38316	RBD2	YPL246C	789 nt		5.73	□□□□□ -1.49
ATG12	P38316	MID1	YNL291C	1647 nt		5.73	□□□□□ -1.49
ATG12	P38316	YCR097W-A	YCR097W-A	267 nt		5.72	□□□□□ -1.49
ATG12	P38316	HSX1	tR(CCU)J	72 nt		5.72	□□□□□ -1.49
ATG12	P38316	HCR1	YLR192C	798 nt		5.72	□□□□□ -1.49
ATG12	P38316	PIN2	YOR104W	849 nt		5.72	□□□□□ -1.49
ATG12	P38316	HSP26	YBR072W	645 nt		5.72	□□□□□ -1.49
ATG12	P38316	VNX1	YNL321W	2727 nt		5.72	□□□□□ -1.49
ATG12	P38316	HIS7	YBR248C	1659 nt		5.72	□□□□□ -1.49
ATG12	P38316	IDP1	YDL066W	1287 nt		5.71	□□□□□ -1.5
ATG12	P38316	LDB18	YLL049W	540 nt		5.71	□□□□□ -1.5
ATG12	P38316	YLR118C	YLR118C	684 nt		5.71	□□□□□ -1.5
ATG12	P38316	PFA3	YNL326C	1011 nt		5.71	□□□□□ -1.5
ATG12	P38316	YBR230W-A	YBR230W-A	201 nt		5.71	□□□□□ -1.5
ATG12	P38316	SMF2	YHR050W	1650 nt		5.71	□□□□□ -1.5
ATG12	P38316	SOG2	YOR353C	2376 nt		5.71	□□□□□ -1.5
ATG12	P38316	YAP1801	YHR161C	1914 nt		5.7	□□□□□ -1.5
ATG12	P38316	GYP1	YOR070C	1914 nt		5.7	□□□□□ -1.5
ATG12	P38316	ALD6	YPL061W	1503 nt		5.7	□□□□□ -1.5
ATG12	P38316	HSF1	YGL073W	2502 nt		5.7	□□□□□ -1.5
ATG12	P38316	YBR226C	YBR226C	411 nt		5.7	□□□□□ -1.5
ATG12	P38316	CDC16	YKL022C	2523 nt		5.7	□□□□□ -1.5
ATG12	P38316	TIM54	YJL054W	1437 nt		5.69	□□□□□ -1.5
ATG12	P38316	ADE13	YLR359W	1449 nt		5.69	□□□□□ -1.5
ATG12	P38316	HGH1	YGR187C	1185 nt		5.69	□□□□□ -1.5
ATG12	P38316	YKL151C	YKL151C	1014 nt		5.69	□□□□□ -1.5
ATG12	P38316	IDP3	YNL009W	1263 nt		5.69	□□□□□ -1.5
ATG12	P38316	MLC2	YPR188C	492 nt		5.69	□□□□□ -1.5

Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 512.8 ms