Protein–RNA interactions for Protein: Q5EG47

Prkaa1, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkaa1Q5EG47 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prkaa1Q5EG47 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prkaa1Q5EG47 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prkaa1Q5EG47 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Prkaa1Q5EG47 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Prkaa1Q5EG47 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Prkaa1Q5EG47 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Prkaa1Q5EG47 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Prkaa1Q5EG47 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Prkaa1Q5EG47 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Prkaa1Q5EG47 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Prkaa1Q5EG47 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Prkaa1Q5EG47 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Prkaa1Q5EG47 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Prkaa1Q5EG47 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prkaa1Q5EG47 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prkaa1Q5EG47 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prkaa1Q5EG47 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prkaa1Q5EG47 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prkaa1Q5EG47 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Prkaa1Q5EG47 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Prkaa1Q5EG47 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Prkaa1Q5EG47 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Prkaa1Q5EG47 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Prkaa1Q5EG47 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Prkaa1Q5EG47 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Prkaa1Q5EG47 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Prkaa1Q5EG47 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Prkaa1Q5EG47 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Prkaa1Q5EG47 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Prkaa1Q5EG47 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Prkaa1Q5EG47 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Prkaa1Q5EG47 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Prkaa1Q5EG47 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Prkaa1Q5EG47 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Prkaa1Q5EG47 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Prkaa1Q5EG47 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Prkaa1Q5EG47 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Prkaa1Q5EG47 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Prkaa1Q5EG47 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Prkaa1Q5EG47 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Prkaa1Q5EG47 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Prkaa1Q5EG47 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Prkaa1Q5EG47 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Prkaa1Q5EG47 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Prkaa1Q5EG47 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Prkaa1Q5EG47 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Prkaa1Q5EG47 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Prkaa1Q5EG47 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Prkaa1Q5EG47 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Prkaa1Q5EG47 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Prkaa1Q5EG47 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Prkaa1Q5EG47 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Prkaa1Q5EG47 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Prkaa1Q5EG47 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Prkaa1Q5EG47 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Prkaa1Q5EG47 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Prkaa1Q5EG47 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Prkaa1Q5EG47 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Prkaa1Q5EG47 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Prkaa1Q5EG47 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Prkaa1Q5EG47 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Prkaa1Q5EG47 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Prkaa1Q5EG47 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Prkaa1Q5EG47 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Prkaa1Q5EG47 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Prkaa1Q5EG47 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Prkaa1Q5EG47 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Prkaa1Q5EG47 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Prkaa1Q5EG47 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Prkaa1Q5EG47 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Prkaa1Q5EG47 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Prkaa1Q5EG47 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Prkaa1Q5EG47 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Prkaa1Q5EG47 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Prkaa1Q5EG47 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Prkaa1Q5EG47 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Prkaa1Q5EG47 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prkaa1Q5EG47 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prkaa1Q5EG47 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prkaa1Q5EG47 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prkaa1Q5EG47 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prkaa1Q5EG47 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prkaa1Q5EG47 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prkaa1Q5EG47 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prkaa1Q5EG47 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prkaa1Q5EG47 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Prkaa1Q5EG47 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Prkaa1Q5EG47 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Prkaa1Q5EG47 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Prkaa1Q5EG47 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Prkaa1Q5EG47 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Prkaa1Q5EG47 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Prkaa1Q5EG47 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Prkaa1Q5EG47 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Prkaa1Q5EG47 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Prkaa1Q5EG47 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Prkaa1Q5EG47 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Prkaa1Q5EG47 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Prkaa1Q5EG47 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms