Protein–RNA interactions for Protein: Q3URY0

Rtl4, Retrotransposon Gag-like protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl4Q3URY0 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rtl4Q3URY0 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rtl4Q3URY0 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rtl4Q3URY0 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rtl4Q3URY0 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rtl4Q3URY0 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rtl4Q3URY0 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rtl4Q3URY0 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rtl4Q3URY0 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rtl4Q3URY0 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rtl4Q3URY0 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rtl4Q3URY0 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rtl4Q3URY0 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rtl4Q3URY0 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rtl4Q3URY0 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rtl4Q3URY0 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rtl4Q3URY0 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rtl4Q3URY0 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rtl4Q3URY0 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rtl4Q3URY0 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rtl4Q3URY0 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rtl4Q3URY0 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Rtl4Q3URY0 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rtl4Q3URY0 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rtl4Q3URY0 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rtl4Q3URY0 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rtl4Q3URY0 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rtl4Q3URY0 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rtl4Q3URY0 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rtl4Q3URY0 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rtl4Q3URY0 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rtl4Q3URY0 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rtl4Q3URY0 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rtl4Q3URY0 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Rtl4Q3URY0 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rtl4Q3URY0 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rtl4Q3URY0 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rtl4Q3URY0 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rtl4Q3URY0 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Rtl4Q3URY0 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rtl4Q3URY0 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rtl4Q3URY0 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rtl4Q3URY0 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rtl4Q3URY0 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rtl4Q3URY0 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rtl4Q3URY0 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rtl4Q3URY0 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rtl4Q3URY0 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rtl4Q3URY0 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rtl4Q3URY0 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rtl4Q3URY0 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rtl4Q3URY0 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rtl4Q3URY0 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rtl4Q3URY0 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Rtl4Q3URY0 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Rtl4Q3URY0 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rtl4Q3URY0 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rtl4Q3URY0 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rtl4Q3URY0 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rtl4Q3URY0 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rtl4Q3URY0 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rtl4Q3URY0 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rtl4Q3URY0 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rtl4Q3URY0 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Rtl4Q3URY0 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rtl4Q3URY0 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rtl4Q3URY0 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rtl4Q3URY0 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rtl4Q3URY0 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Rtl4Q3URY0 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rtl4Q3URY0 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rtl4Q3URY0 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rtl4Q3URY0 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rtl4Q3URY0 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rtl4Q3URY0 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rtl4Q3URY0 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rtl4Q3URY0 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rtl4Q3URY0 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rtl4Q3URY0 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Rtl4Q3URY0 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rtl4Q3URY0 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rtl4Q3URY0 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rtl4Q3URY0 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rtl4Q3URY0 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rtl4Q3URY0 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rtl4Q3URY0 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rtl4Q3URY0 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rtl4Q3URY0 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rtl4Q3URY0 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rtl4Q3URY0 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rtl4Q3URY0 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rtl4Q3URY0 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rtl4Q3URY0 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rtl4Q3URY0 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rtl4Q3URY0 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rtl4Q3URY0 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rtl4Q3URY0 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Rtl4Q3URY0 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rtl4Q3URY0 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rtl4Q3URY0 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 836.3 ms