Protein–RNA interactions for Protein: P39005

KRE9, Cell wall synthesis protein KRE9, yeast

Predictions only

Length 276 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
KRE9	P39005	VTA1	YLR181C	993 nt		4.64	□□□□□ -1.67
KRE9	P39005	NMD4	YLR363C	657 nt		4.64	□□□□□ -1.67
KRE9	P39005	GTO3	YMR251W	1101 nt		4.64	□□□□□ -1.67
KRE9	P39005	IES2	YNL215W	963 nt		4.64	□□□□□ -1.67
KRE9	P39005	PTC4	YBR125C	1182 nt		4.64	□□□□□ -1.67
KRE9	P39005	KTR5	YNL029C	1569 nt		4.64	□□□□□ -1.67
KRE9	P39005	YDR514C	YDR514C	1452 nt		4.63	□□□□□ -1.67
KRE9	P39005	ESC8	YOL017W	2145 nt		4.63	□□□□□ -1.67
KRE9	P39005	RSA4	YCR072C	1548 nt		4.63	□□□□□ -1.67
KRE9	P39005	ATG18	YFR021W	1503 nt		4.63	□□□□□ -1.67
KRE9	P39005	IMG1	YCR046C	510 nt		4.63	□□□□□ -1.67
KRE9	P39005	RAM1	YDL090C	1296 nt		4.63	□□□□□ -1.67
KRE9	P39005	tR(UCU)Q1	tR(UCU)Q1	73 nt		4.63	□□□□□ -1.67
KRE9	P39005	OAC1	YKL120W	975 nt		4.63	□□□□□ -1.67
KRE9	P39005	KTR1	YOR099W	1182 nt		4.63	□□□□□ -1.67
KRE9	P39005	HEM15	YOR176W	1182 nt		4.63	□□□□□ -1.67
KRE9	P39005	PGM1	YKL127W	1713 nt		4.63	□□□□□ -1.67
KRE9	P39005	PTC3	YBL056W	1407 nt		4.63	□□□□□ -1.67
KRE9	P39005	ARH1	YDR376W	1482 nt		4.62	□□□□□ -1.67
KRE9	P39005	STB5	YHR178W	2232 nt		4.62	□□□□□ -1.67
KRE9	P39005	POP1	YNL221C	2628 nt		4.62	□□□□□ -1.67
KRE9	P39005	RCK1	YGL158W	1539 nt		4.62	□□□□□ -1.67
KRE9	P39005	snR82	snR82	268 nt		4.62	□□□□□ -1.67
KRE9	P39005	MAF1	YDR005C	1188 nt		4.62	□□□□□ -1.67
KRE9	P39005	YEA6	YEL006W	1008 nt		4.62	□□□□□ -1.67
KRE9	P39005	PEX22	YAL055W	543 nt		4.62	□□□□□ -1.67
KRE9	P39005	YNL228W	YNL228W	777 nt		4.62	□□□□□ -1.67
KRE9	P39005	TSR3	YOR006C	942 nt		4.62	□□□□□ -1.67
KRE9	P39005	HAL1	YPR005C	885 nt		4.62	□□□□□ -1.67
KRE9	P39005	CMR1	YDL156W	1569 nt		4.61	□□□□□ -1.67
KRE9	P39005	COX9	YDL067C	180 nt		4.61	□□□□□ -1.67
KRE9	P39005	PCL9	YDL179W	915 nt		4.61	□□□□□ -1.67
KRE9	P39005	GPI11	YDR302W	660 nt		4.61	□□□□□ -1.67
KRE9	P39005	YGR127W	YGR127W	939 nt		4.61	□□□□□ -1.67
KRE9	P39005	POP5	YAL033W	522 nt		4.61	□□□□□ -1.67
KRE9	P39005	YLR412C-A	YLR412C-A	207 nt		4.61	□□□□□ -1.67
KRE9	P39005	BSC4	YNL269W	396 nt		4.61	□□□□□ -1.67
KRE9	P39005	YBR027C	YBR027C	333 nt		4.61	□□□□□ -1.67
KRE9	P39005	UIP5	YKR044W	1332 nt		4.61	□□□□□ -1.67
KRE9	P39005	YML133C	YML133C	4125 nt		4.61	□□□□□ -1.67
KRE9	P39005	ZWF1	YNL241C	1518 nt		4.61	□□□□□ -1.67
KRE9	P39005	YDL129W	YDL129W	876 nt		4.6	□□□□□ -1.67
KRE9	P39005	OMA1	YKR087C	1038 nt		4.6	□□□□□ -1.67
KRE9	P39005	FPR3	YML074C	1236 nt		4.6	□□□□□ -1.67
KRE9	P39005	YOR111W	YOR111W	699 nt		4.6	□□□□□ -1.67
KRE9	P39005	MST1	YKL194C	1389 nt		4.6	□□□□□ -1.67
KRE9	P39005	PTR2	YKR093W	1806 nt		4.6	□□□□□ -1.67
KRE9	P39005	YDR132C	YDR132C	1488 nt		4.59	□□□□□ -1.67
KRE9	P39005	AMD2	YDR242W	1650 nt		4.59	□□□□□ -1.67
KRE9	P39005	JIP4	YDR475C	2631 nt		4.59	□□□□□ -1.67
KRE9	P39005	YEF1	YEL041W	1488 nt		4.59	□□□□□ -1.67
KRE9	P39005	VHT1	YGR065C	1782 nt		4.59	□□□□□ -1.67
KRE9	P39005	MRPL25	YGR076C	474 nt		4.59	□□□□□ -1.67
KRE9	P39005	AIM20	YIL158W	615 nt		4.59	□□□□□ -1.67
KRE9	P39005	YLR311C	YLR311C	348 nt		4.59	□□□□□ -1.67
KRE9	P39005	YMR279C	YMR279C	1623 nt		4.59	□□□□□ -1.67
KRE9	P39005	RRP40	YOL142W	723 nt		4.59	□□□□□ -1.67
KRE9	P39005	MPC54	YOR177C	1395 nt		4.59	□□□□□ -1.67
KRE9	P39005	RPL21A	YBR191W	483 nt		4.59	□□□□□ -1.67
KRE9	P39005	AME1	YBR211C	975 nt		4.59	□□□□□ -1.67
KRE9	P39005	SGF29	YCL010C	780 nt		4.59	□□□□□ -1.67
KRE9	P39005	HRQ1	YDR291W	3234 nt		4.59	□□□□□ -1.68
KRE9	P39005	RGT2	YDL138W	2292 nt		4.58	□□□□□ -1.68
KRE9	P39005	DAL7	YIR031C	1665 nt		4.58	□□□□□ -1.68
KRE9	P39005	YFL052W	YFL052W	1398 nt		4.58	□□□□□ -1.68
KRE9	P39005	PCL6	YER059W	1263 nt		4.58	□□□□□ -1.68
KRE9	P39005	CUP2	YGL166W	678 nt		4.58	□□□□□ -1.68
KRE9	P39005	YJR084W	YJR084W	1272 nt		4.58	□□□□□ -1.68
KRE9	P39005	UBC12	YLR306W	567 nt		4.58	□□□□□ -1.68
KRE9	P39005	ODC2	YOR222W	924 nt		4.58	□□□□□ -1.68
KRE9	P39005	ATP4	YPL078C	735 nt		4.58	□□□□□ -1.68
KRE9	P39005	RIX7	YLL034C	2514 nt		4.57	□□□□□ -1.68
KRE9	P39005	YEN1	YER041W	2280 nt		4.57	□□□□□ -1.68
KRE9	P39005	EXG1	YLR300W	1347 nt		4.57	□□□□□ -1.68
KRE9	P39005	MRPL1	YDR116C	858 nt		4.57	□□□□□ -1.68
KRE9	P39005	THI4	YGR144W	981 nt		4.57	□□□□□ -1.68
KRE9	P39005	YAL016C-B	YAL016C-B	186 nt		4.57	□□□□□ -1.68
KRE9	P39005	RRT7	YLL030C	342 nt		4.57	□□□□□ -1.68
KRE9	P39005	ICT1	YLR099C	1185 nt		4.57	□□□□□ -1.68
KRE9	P39005	YLR361C-A	YLR361C-A	297 nt		4.57	□□□□□ -1.68
KRE9	P39005	YGP1	YNL160W	1065 nt		4.57	□□□□□ -1.68
KRE9	P39005	RPS3	YNL178W	723 nt		4.57	□□□□□ -1.68
KRE9	P39005	YDR387C	YDR387C	1668 nt		4.57	□□□□□ -1.68
KRE9	P39005	FET4	YMR319C	1659 nt		4.57	□□□□□ -1.68
KRE9	P39005	PYK2	YOR347C	1521 nt		4.56	□□□□□ -1.68
KRE9	P39005	PRP24	YMR268C	1335 nt		4.56	□□□□□ -1.68
KRE9	P39005	BUG1	YDL099W	1026 nt		4.56	□□□□□ -1.68
KRE9	P39005	SRG1	SRG1	551 nt		4.56	□□□□□ -1.68
KRE9	P39005	YDR187C	YDR187C	519 nt		4.56	□□□□□ -1.68
KRE9	P39005	TMT1	YER175C	900 nt		4.56	□□□□□ -1.68
KRE9	P39005	COA1	YIL157C	594 nt		4.56	□□□□□ -1.68
KRE9	P39005	MHO1	YJR008W	1017 nt		4.56	□□□□□ -1.68
KRE9	P39005	YKL153W	YKL153W	510 nt		4.56	□□□□□ -1.68
KRE9	P39005	YMC1	YPR058W	924 nt		4.56	□□□□□ -1.68
KRE9	P39005	AFG1	YEL052W	1530 nt		4.56	□□□□□ -1.68
KRE9	P39005	HXK2	YGL253W	1461 nt		4.56	□□□□□ -1.68
KRE9	P39005	VRP1	YLR337C	2454 nt		4.55	□□□□□ -1.68
KRE9	P39005	ILV1	YER086W	1731 nt		4.55	□□□□□ -1.68
KRE9	P39005	LPL1	YOR059C	1353 nt		4.55	□□□□□ -1.68
KRE9	P39005	YDR278C	YDR278C	318 nt		4.55	□□□□□ -1.68

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