Protein–RNA interactions for Protein: Q15424

SAFB, Scaffold attachment factor B1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 915 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAFBQ15424 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.481e-6■□□□□ 8.7
SAFBQ15424 RTN4-210ENST00000427710 589 ntTSL 416.75■□□□□ 0.271e-8■□□□□ 8.6
SAFBQ15424 ACSL3-209ENST00000535678 560 ntTSL 321.93■■□□□ 1.12e-8■□□□□ 8.6
SAFBQ15424 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.672e-8■□□□□ 8.6
SAFBQ15424 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.282e-8■□□□□ 8.6
SAFBQ15424 ACSL3-204ENST00000413316 650 ntTSL 411.75□□□□□ -0.532e-8■□□□□ 8.6
SAFBQ15424 SETD2-203ENST00000412450 4231 ntTSL 213.69□□□□□ -0.221e-8■□□□□ 8.6
SAFBQ15424 SETD2-202ENST00000409792 8142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.291e-8■□□□□ 8.6
SAFBQ15424 SETD2-201ENST00000330022 8172 ntTSL 1 (best)6.41□□□□□ -1.381e-8■□□□□ 8.6
SAFBQ15424 SETD2-204ENST00000431180 7555 ntTSL 26.17□□□□□ -1.421e-8■□□□□ 8.6
SAFBQ15424 SETD2-205ENST00000445387 7075 ntTSL 54.72□□□□□ -1.651e-8■□□□□ 8.6
SAFBQ15424 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.262e-6■□□□□ 8.5
SAFBQ15424 LRIF1-201ENST00000369763 3475 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.412e-6■□□□□ 8.5
SAFBQ15424 RBM41-202ENST00000372487 2579 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.56□□□□□ -1.041e-6■□□□□ 8.5
SAFBQ15424 RBM41-208ENST00000495517 3315 ntTSL 27.86□□□□□ -1.151e-6■□□□□ 8.5
SAFBQ15424 RBM41-201ENST00000372479 1662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.311e-6■□□□□ 8.5
SAFBQ15424 RBM41-203ENST00000434854 680 ntTSL 55.19□□□□□ -1.581e-6■□□□□ 8.5
SAFBQ15424 LRIF1-203ENST00000494675 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.852e-6■□□□□ 8.5
SAFBQ15424 NARF-207ENST00000577410 873 ntTSL 526.8■■□□□ 1.884e-8■□□□□ 8.5
SAFBQ15424 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.544e-8■□□□□ 8.5
SAFBQ15424 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.484e-8■□□□□ 8.5
SAFBQ15424 NARF-221ENST00000583181 505 ntTSL 522.77■■□□□ 1.244e-8■□□□□ 8.5
SAFBQ15424 NARF-216ENST00000581202 1013 ntTSL 522.4■■□□□ 1.184e-8■□□□□ 8.5
SAFBQ15424 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.924e-8■□□□□ 8.5
SAFBQ15424 NARF-203ENST00000374611 1722 ntTSL 519.09■□□□□ 0.654e-8■□□□□ 8.5
SAFBQ15424 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.64e-8■□□□□ 8.5
SAFBQ15424 NARF-217ENST00000581743 785 ntTSL 518.65■□□□□ 0.584e-8■□□□□ 8.5
SAFBQ15424 NARF-218ENST00000581795 1430 ntTSL 218.4■□□□□ 0.544e-8■□□□□ 8.5
SAFBQ15424 NARF-208ENST00000577432 866 ntTSL 518.36■□□□□ 0.534e-8■□□□□ 8.5
SAFBQ15424 NARF-224ENST00000584411 525 ntTSL 418.31■□□□□ 0.524e-8■□□□□ 8.5
SAFBQ15424 NARF-213ENST00000579198 599 ntTSL 517.95■□□□□ 0.464e-8■□□□□ 8.5
SAFBQ15424 NARF-214ENST00000580296 733 ntTSL 317.66■□□□□ 0.424e-8■□□□□ 8.5
SAFBQ15424 NARF-223ENST00000584192 495 ntTSL 316.59■□□□□ 0.254e-8■□□□□ 8.5
SAFBQ15424 NARF-220ENST00000582907 1454 ntTSL 515.92■□□□□ 0.144e-8■□□□□ 8.5
SAFBQ15424 NARF-210ENST00000578082 841 ntTSL 415.82■□□□□ 0.124e-8■□□□□ 8.5
SAFBQ15424 NARF-201ENST00000309794 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.134e-8■□□□□ 8.5
SAFBQ15424 NARF-215ENST00000580748 577 ntTSL 513.54□□□□□ -0.244e-8■□□□□ 8.5
SAFBQ15424 NARF-209ENST00000577812 2598 ntTSL 513.42□□□□□ -0.264e-8■□□□□ 8.5
SAFBQ15424 TNRC6A-203ENST00000450465 3700 ntTSL 29.61□□□□□ -0.874e-8■□□□□ 8.5
SAFBQ15424 RRBP1-209ENST00000495501 832 ntTSL 522.63■■□□□ 1.213e-12■□□□□ 8.5
SAFBQ15424 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.563e-12■□□□□ 8.5
SAFBQ15424 RRBP1-202ENST00000360807 3727 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.143e-12■□□□□ 8.5
SAFBQ15424 RRBP1-201ENST00000246043 4737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.063e-12■□□□□ 8.5
SAFBQ15424 RRBP1-206ENST00000455029 2485 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.043e-12■□□□□ 8.5
SAFBQ15424 RRBP1-210ENST00000610403 3309 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.293e-12■□□□□ 8.5
SAFBQ15424 RRBP1-203ENST00000377807 3792 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.323e-12■□□□□ 8.5
SAFBQ15424 ELL2-207ENST00000515020 340 ntTSL 227.73■■■□□ 2.032e-9■□□□□ 8.4
SAFBQ15424 ELL2-203ENST00000506628 520 ntTSL 523.33■■□□□ 1.332e-9■□□□□ 8.4
SAFBQ15424 ELL2-208ENST00000635633 467 ntTSL 36.63□□□□□ -1.352e-9■□□□□ 8.4
SAFBQ15424 FTCD-211ENST00000494498 840 ntTSL 322.01■■□□□ 1.116e-9■□□□□ 8.4
SAFBQ15424 FTCD-206ENST00000460011 1260 ntTSL 1 (best)21.55■■□□□ 1.046e-9■□□□□ 8.4
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SAFBQ15424 PHF3-210ENST00000509876 7124 ntTSL 1 (best)6.15□□□□□ -1.434e-8■□□□□ 8.4
SAFBQ15424 PHF3-207ENST00000505138 612 ntTSL 35.54□□□□□ -1.524e-8■□□□□ 8.4
SAFBQ15424 PHF3-202ENST00000393387 6947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.84e-8■□□□□ 8.4
SAFBQ15424 THOC1-214ENST00000582313 1811 ntTSL 510.53□□□□□ -0.722e-6■□□□□ 8.3
SAFBQ15424 THOC1-201ENST00000261600 2087 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.972e-6■□□□□ 8.3
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SAFBQ15424 THOC1-208ENST00000580038 2033 ntTSL 57.43□□□□□ -1.222e-6■□□□□ 8.3
SAFBQ15424 THOC1-207ENST00000579891 815 ntTSL 56.13□□□□□ -1.432e-6■□□□□ 8.3
SAFBQ15424 THOC1-206ENST00000579232 2277 ntTSL 55.13□□□□□ -1.592e-6■□□□□ 8.3
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SAFBQ15424 THOC1-220ENST00000621904 1083 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.752e-6■□□□□ 8.3
SAFBQ15424 THOC1-219ENST00000616322 2078 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.762e-6■□□□□ 8.3
SAFBQ15424 THOC1-215ENST00000583228 2791 ntTSL 23.37□□□□□ -1.872e-6■□□□□ 8.3
SAFBQ15424 THOC1-205ENST00000578529 2681 ntTSL 52.42□□□□□ -2.022e-6■□□□□ 8.3
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SAFBQ15424 AC139887.2-204ENST00000503405 550 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.625e-8■□□□□ 8.3
SAFBQ15424 RBM12-204ENST00000424458 1068 ntTSL 228.69■■■□□ 2.183e-8■□□□□ 8.3
SAFBQ15424 DDIT3-203ENST00000547526 644 ntTSL 313.8□□□□□ -0.23e-8■□□□□ 8.3
SAFBQ15424 DDIT3-201ENST00000346473 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.353e-8■□□□□ 8.3
SAFBQ15424 DDIT3-202ENST00000547303 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.453e-8■□□□□ 8.3
SAFBQ15424 DDIT3-205ENST00000552740 951 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.883e-8■□□□□ 8.3
SAFBQ15424 DDIT3-204ENST00000551116 1067 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.163e-8■□□□□ 8.3
SAFBQ15424 MIR616-201ENST00000385293 97 ntBASIC1.55□□□□□ -2.163e-8■□□□□ 8.3
SAFBQ15424 HPN-207ENST00000599363 1828 ntTSL 524.66■■□□□ 1.544e-8■□□□□ 8.2
SAFBQ15424 HPN-204ENST00000593305 2175 ntTSL 222.76■■□□□ 1.234e-8■□□□□ 8.2
SAFBQ15424 SLC2A1-202ENST00000415851 578 ntTSL 221.37■■□□□ 1.014e-8■□□□□ 8.2
SAFBQ15424 HPN-203ENST00000541345 1820 ntTSL 220.46■□□□□ 0.874e-8■□□□□ 8.2
SAFBQ15424 SLC2A1-206ENST00000625233 1031 ntTSL 219.95■□□□□ 0.784e-8■□□□□ 8.2
SAFBQ15424 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.774e-8■□□□□ 8.2
SAFBQ15424 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.614e-8■□□□□ 8.2
SAFBQ15424 SLC2A1-208ENST00000630287 2398 ntTSL 517.69■□□□□ 0.424e-8■□□□□ 8.2
SAFBQ15424 SLC2A1-201ENST00000372500 533 ntTSL 317.52■□□□□ 0.44e-8■□□□□ 8.2
SAFBQ15424 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.174e-8■□□□□ 8.2
SAFBQ15424 SLC2A1-205ENST00000475162 598 ntTSL 515.59■□□□□ 0.094e-8■□□□□ 8.2
SAFBQ15424 SLC2A1-203ENST00000426263 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.164e-8■□□□□ 8.2
SAFBQ15424 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.455e-6■□□□□ 8.2
SAFBQ15424 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.555e-6■□□□□ 8.2
SAFBQ15424 ARHGAP5-204ENST00000432921 5003 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.625e-6■□□□□ 8.2
SAFBQ15424 ARHGAP5-206ENST00000539826 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.475e-6■□□□□ 8.2
SAFBQ15424 ARHGAP5-210ENST00000556611 4824 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.55e-6■□□□□ 8.2
SAFBQ15424 ARHGAP5-207ENST00000554090 543 ntTSL 54.86□□□□□ -1.635e-6■□□□□ 8.2
SAFBQ15424 ARHGAP5-202ENST00000345122 9604 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.915e-6■□□□□ 8.2
SAFBQ15424 MALAT1-201ENST00000508832 1519 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.761e-323■□□□□ 8.2
SAFBQ15424 MALAT1-208ENST00000616527 572 ntTSL 3 BASIC9.07□□□□□ -0.961e-323■□□□□ 8.2
SAFBQ15424 MALAT1-214ENST00000618925 424 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31e-323■□□□□ 8.2
SAFBQ15424 CYP27A1-204ENST00000466602 1210 ntTSL 225.93■■□□□ 1.743e-6■□□□□ 8.2
SAFBQ15424 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.333e-6■□□□□ 8.2
SAFBQ15424 CYP27A1-205ENST00000494263 2566 ntTSL 220.27■□□□□ 0.833e-6■□□□□ 8.2
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