Protein–RNA interactions for Protein: Q12441

TY1A-DR3, Transposon Ty1-DR3 Gag polyprotein, yeastyeast

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1A-DR3Q12441 IRC6YFR043C 714 nt7.14□□□□□ -1.27
TY1A-DR3Q12441 RPI1YIL119C 1224 nt7.14□□□□□ -1.27
TY1A-DR3Q12441 PRY1YJL079C 900 nt7.14□□□□□ -1.27
TY1A-DR3Q12441 HXT9YJL219W 1704 nt7.14□□□□□ -1.27
TY1A-DR3Q12441 SFK1YKL051W 1062 nt7.14□□□□□ -1.27
TY1A-DR3Q12441 IMD1YAR073W 1212 nt7.14□□□□□ -1.27
TY1A-DR3Q12441 COR1YBL045C 1374 nt7.14□□□□□ -1.27
TY1A-DR3Q12441 YOR342CYOR342C 960 nt7.14□□□□□ -1.27
TY1A-DR3Q12441 SCD6YPR129W 1050 nt7.14□□□□□ -1.27
TY1A-DR3Q12441 MED8YBR193C 672 nt7.14□□□□□ -1.27
TY1A-DR3Q12441 CTI6YPL181W 1521 nt7.13□□□□□ -1.27
TY1A-DR3Q12441 YHR177WYHR177W 1362 nt7.13□□□□□ -1.27
TY1A-DR3Q12441 YER152CYER152C 1332 nt7.13□□□□□ -1.27
TY1A-DR3Q12441 YDR094WYDR094W 336 nt7.13□□□□□ -1.27
TY1A-DR3Q12441 HST4YDR191W 1113 nt7.13□□□□□ -1.27
TY1A-DR3Q12441 YGL258W-AYGL258W-A 234 nt7.13□□□□□ -1.27
TY1A-DR3Q12441 TFG2YGR005C 1203 nt7.13□□□□□ -1.27
TY1A-DR3Q12441 YGR026WYGR026W 837 nt7.13□□□□□ -1.27
TY1A-DR3Q12441 ALB1YJL122W 528 nt7.13□□□□□ -1.27
TY1A-DR3Q12441 OPI3YJR073C 621 nt7.13□□□□□ -1.27
TY1A-DR3Q12441 YKL169CYKL169C 384 nt7.13□□□□□ -1.27
TY1A-DR3Q12441 STP3YLR375W 1032 nt7.13□□□□□ -1.27
TY1A-DR3Q12441 MTF1YMR228W 1026 nt7.13□□□□□ -1.27
TY1A-DR3Q12441 YMR253CYMR253C 1245 nt7.13□□□□□ -1.27
TY1A-DR3Q12441 RUF22RUF22 515 nt7.13□□□□□ -1.27
TY1A-DR3Q12441 PEX32YBR168W 1242 nt7.13□□□□□ -1.27
TY1A-DR3Q12441 MET1YKR069W 1782 nt7.13□□□□□ -1.27
TY1A-DR3Q12441 YIL108WYIL108W 2091 nt7.12□□□□□ -1.27
TY1A-DR3Q12441 YCR087WYCR087W 516 nt7.12□□□□□ -1.27
TY1A-DR3Q12441 AIM6YDL237W 1173 nt7.12□□□□□ -1.27
TY1A-DR3Q12441 ATC1YDR184C 885 nt7.12□□□□□ -1.27
TY1A-DR3Q12441 PEX14YGL153W 1026 nt7.12□□□□□ -1.27
TY1A-DR3Q12441 YGL185CYGL185C 1140 nt7.12□□□□□ -1.27
TY1A-DR3Q12441 YKL123WYKL123W 381 nt7.12□□□□□ -1.27
TY1A-DR3Q12441 ATP10YLR393W 840 nt7.12□□□□□ -1.27
TY1A-DR3Q12441 ERG6YML008C 1152 nt7.12□□□□□ -1.27
TY1A-DR3Q12441 TOM40YMR203W 1164 nt7.12□□□□□ -1.27
TY1A-DR3Q12441 SNN1YNL086W 309 nt7.12□□□□□ -1.27
TY1A-DR3Q12441 AIM45YPR004C 1035 nt7.12□□□□□ -1.27
TY1A-DR3Q12441 ATP20YPR020W 348 nt7.12□□□□□ -1.27
TY1A-DR3Q12441 GCN5YGR252W 1320 nt7.11□□□□□ -1.27
TY1A-DR3Q12441 ERR3YMR323W 1314 nt7.11□□□□□ -1.27
TY1A-DR3Q12441 RPT5YOR117W 1305 nt7.11□□□□□ -1.27
TY1A-DR3Q12441 ERR1YOR393W 1314 nt7.11□□□□□ -1.27
TY1A-DR3Q12441 ERR2YPL281C 1314 nt7.11□□□□□ -1.27
TY1A-DR3Q12441 IRC7YFR055W 1023 nt7.11□□□□□ -1.27
TY1A-DR3Q12441 IME1YJR094C 1083 nt7.11□□□□□ -1.27
TY1A-DR3Q12441 USV1YPL230W 1176 nt7.11□□□□□ -1.27
TY1A-DR3Q12441 CLN2YPL256C 1638 nt7.11□□□□□ -1.27
TY1A-DR3Q12441 MET13YGL125W 1803 nt7.11□□□□□ -1.27
TY1A-DR3Q12441 WSC4YHL028W 1818 nt7.11□□□□□ -1.27
TY1A-DR3Q12441 GGA2YHR108W 1758 nt7.1□□□□□ -1.27
TY1A-DR3Q12441 TRS31YDR472W 852 nt7.1□□□□□ -1.27
TY1A-DR3Q12441 DMC1YER179W 1005 nt7.1□□□□□ -1.27
TY1A-DR3Q12441 RRP46YGR095C 672 nt7.1□□□□□ -1.27
TY1A-DR3Q12441 NVJ1YHR195W 966 nt7.1□□□□□ -1.27
TY1A-DR3Q12441 HMX1YLR205C 954 nt7.1□□□□□ -1.27
TY1A-DR3Q12441 GPN3YLR243W 819 nt7.1□□□□□ -1.27
TY1A-DR3Q12441 YPT6YLR262C 648 nt7.1□□□□□ -1.27
TY1A-DR3Q12441 SWT21YNL187W 1074 nt7.1□□□□□ -1.27
TY1A-DR3Q12441 RTG2YGL252C 1767 nt7.1□□□□□ -1.27
TY1A-DR3Q12441 CCR4YAL021C 2514 nt7.09□□□□□ -1.27
TY1A-DR3Q12441 NOB1YOR056C 1380 nt7.09□□□□□ -1.27
TY1A-DR3Q12441 QRI7YDL104C 1224 nt7.09□□□□□ -1.27
TY1A-DR3Q12441 ACT1YFL039C 1128 nt7.09□□□□□ -1.27
TY1A-DR3Q12441 YGL230CYGL230C 444 nt7.09□□□□□ -1.27
TY1A-DR3Q12441 HAP2YGL237C 798 nt7.09□□□□□ -1.27
TY1A-DR3Q12441 IMO32YGR031W 1029 nt7.09□□□□□ -1.27
TY1A-DR3Q12441 CTR2YHR175W 570 nt7.09□□□□□ -1.27
TY1A-DR3Q12441 MRPL13YKR006C 795 nt7.09□□□□□ -1.27
TY1A-DR3Q12441 MRS4YKR052C 915 nt7.09□□□□□ -1.27
TY1A-DR3Q12441 PML1YLR016C 615 nt7.09□□□□□ -1.27
TY1A-DR3Q12441 YLR225CYLR225C 1224 nt7.09□□□□□ -1.27
TY1A-DR3Q12441 SPC2YML055W 537 nt7.09□□□□□ -1.27
TY1A-DR3Q12441 CAF40YNL288W 1122 nt7.09□□□□□ -1.27
TY1A-DR3Q12441 HST2YPL015C 1074 nt7.09□□□□□ -1.27
TY1A-DR3Q12441 YBR056C-BYBR056C-B 159 nt7.09□□□□□ -1.27
TY1A-DR3Q12441 MRL1YPR079W 1146 nt7.09□□□□□ -1.27
TY1A-DR3Q12441 YDR179W-AYDR179W-A 1392 nt7.08□□□□□ -1.28
TY1A-DR3Q12441 YDL162CYDL162C 357 nt7.08□□□□□ -1.28
TY1A-DR3Q12441 THI74YDR438W 1113 nt7.08□□□□□ -1.28
TY1A-DR3Q12441 YJR114WYJR114W 393 nt7.08□□□□□ -1.28
TY1A-DR3Q12441 YKR045CYKR045C 552 nt7.08□□□□□ -1.28
TY1A-DR3Q12441 HRT3YLR097C 1035 nt7.08□□□□□ -1.28
TY1A-DR3Q12441 GMC2YLR445W 567 nt7.08□□□□□ -1.28
TY1A-DR3Q12441 NBP1YLR457C 960 nt7.08□□□□□ -1.28
TY1A-DR3Q12441 STE50YCL032W 1041 nt7.08□□□□□ -1.28
TY1A-DR3Q12441 DBP5YOR046C 1449 nt7.08□□□□□ -1.28
TY1A-DR3Q12441 PFA5YDR459C 1125 nt7.07□□□□□ -1.28
TY1A-DR3Q12441 GIM4YEL003W 336 nt7.07□□□□□ -1.28
TY1A-DR3Q12441 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt7.07□□□□□ -1.28
TY1A-DR3Q12441 RNA15YGL044C 891 nt7.07□□□□□ -1.28
TY1A-DR3Q12441 SKI8YGL213C 1194 nt7.07□□□□□ -1.28
TY1A-DR3Q12441 YKL053WYKL053W 375 nt7.07□□□□□ -1.28
TY1A-DR3Q12441 PIN2YOR104W 849 nt7.07□□□□□ -1.28
TY1A-DR3Q12441 YOR364WYOR364W 369 nt7.07□□□□□ -1.28
TY1A-DR3Q12441 snR19snR19 568 nt7.07□□□□□ -1.28
TY1A-DR3Q12441 MAS2YHR024C 1449 nt7.07□□□□□ -1.28
TY1A-DR3Q12441 HST1YOL068C 1512 nt7.06□□□□□ -1.28
TY1A-DR3Q12441 YIL177CYIL177C 5277 nt7.06□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 45.7 ms