Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJT2

Gfra4, GDNF family receptor alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra4Q9JJT2 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gfra4Q9JJT2 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Gfra4Q9JJT2 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gfra4Q9JJT2 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gfra4Q9JJT2 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gfra4Q9JJT2 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gfra4Q9JJT2 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gfra4Q9JJT2 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gfra4Q9JJT2 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gfra4Q9JJT2 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gfra4Q9JJT2 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gfra4Q9JJT2 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gfra4Q9JJT2 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gfra4Q9JJT2 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gfra4Q9JJT2 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gfra4Q9JJT2 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gfra4Q9JJT2 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gfra4Q9JJT2 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gfra4Q9JJT2 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Gfra4Q9JJT2 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gfra4Q9JJT2 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gfra4Q9JJT2 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gfra4Q9JJT2 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gfra4Q9JJT2 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Gfra4Q9JJT2 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gfra4Q9JJT2 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gfra4Q9JJT2 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gfra4Q9JJT2 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Gfra4Q9JJT2 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gfra4Q9JJT2 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gfra4Q9JJT2 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gfra4Q9JJT2 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gfra4Q9JJT2 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gfra4Q9JJT2 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gfra4Q9JJT2 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gfra4Q9JJT2 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gfra4Q9JJT2 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gfra4Q9JJT2 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gfra4Q9JJT2 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gfra4Q9JJT2 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gfra4Q9JJT2 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gfra4Q9JJT2 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gfra4Q9JJT2 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Gfra4Q9JJT2 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gfra4Q9JJT2 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gfra4Q9JJT2 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gfra4Q9JJT2 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Gfra4Q9JJT2 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gfra4Q9JJT2 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gfra4Q9JJT2 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Gfra4Q9JJT2 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gfra4Q9JJT2 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Gfra4Q9JJT2 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gfra4Q9JJT2 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gfra4Q9JJT2 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gfra4Q9JJT2 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gfra4Q9JJT2 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gfra4Q9JJT2 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gfra4Q9JJT2 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Gfra4Q9JJT2 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Gfra4Q9JJT2 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Gfra4Q9JJT2 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gfra4Q9JJT2 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gfra4Q9JJT2 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gfra4Q9JJT2 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gfra4Q9JJT2 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gfra4Q9JJT2 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gfra4Q9JJT2 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Gfra4Q9JJT2 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gfra4Q9JJT2 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gfra4Q9JJT2 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gfra4Q9JJT2 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gfra4Q9JJT2 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gfra4Q9JJT2 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gfra4Q9JJT2 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gfra4Q9JJT2 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gfra4Q9JJT2 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gfra4Q9JJT2 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gfra4Q9JJT2 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gfra4Q9JJT2 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Gfra4Q9JJT2 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gfra4Q9JJT2 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gfra4Q9JJT2 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gfra4Q9JJT2 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Gfra4Q9JJT2 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gfra4Q9JJT2 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gfra4Q9JJT2 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gfra4Q9JJT2 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gfra4Q9JJT2 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gfra4Q9JJT2 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gfra4Q9JJT2 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gfra4Q9JJT2 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gfra4Q9JJT2 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gfra4Q9JJT2 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gfra4Q9JJT2 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gfra4Q9JJT2 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gfra4Q9JJT2 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gfra4Q9JJT2 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gfra4Q9JJT2 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gfra4Q9JJT2 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms