Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1X0

Nol3, Nucleolar protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nol3Q9D1X0 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nol3Q9D1X0 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nol3Q9D1X0 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Nol3Q9D1X0 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nol3Q9D1X0 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nol3Q9D1X0 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nol3Q9D1X0 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nol3Q9D1X0 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nol3Q9D1X0 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nol3Q9D1X0 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nol3Q9D1X0 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nol3Q9D1X0 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nol3Q9D1X0 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Nol3Q9D1X0 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Nol3Q9D1X0 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nol3Q9D1X0 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nol3Q9D1X0 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nol3Q9D1X0 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Nol3Q9D1X0 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Nol3Q9D1X0 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nol3Q9D1X0 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nol3Q9D1X0 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nol3Q9D1X0 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Nol3Q9D1X0 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nol3Q9D1X0 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nol3Q9D1X0 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nol3Q9D1X0 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nol3Q9D1X0 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nol3Q9D1X0 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nol3Q9D1X0 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nol3Q9D1X0 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nol3Q9D1X0 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nol3Q9D1X0 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nol3Q9D1X0 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nol3Q9D1X0 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nol3Q9D1X0 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nol3Q9D1X0 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nol3Q9D1X0 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nol3Q9D1X0 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nol3Q9D1X0 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nol3Q9D1X0 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nol3Q9D1X0 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nol3Q9D1X0 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nol3Q9D1X0 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nol3Q9D1X0 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nol3Q9D1X0 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nol3Q9D1X0 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nol3Q9D1X0 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nol3Q9D1X0 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nol3Q9D1X0 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nol3Q9D1X0 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nol3Q9D1X0 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nol3Q9D1X0 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nol3Q9D1X0 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nol3Q9D1X0 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nol3Q9D1X0 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nol3Q9D1X0 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nol3Q9D1X0 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nol3Q9D1X0 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nol3Q9D1X0 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nol3Q9D1X0 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nol3Q9D1X0 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nol3Q9D1X0 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nol3Q9D1X0 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nol3Q9D1X0 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nol3Q9D1X0 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nol3Q9D1X0 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nol3Q9D1X0 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nol3Q9D1X0 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nol3Q9D1X0 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nol3Q9D1X0 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nol3Q9D1X0 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nol3Q9D1X0 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nol3Q9D1X0 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nol3Q9D1X0 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nol3Q9D1X0 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nol3Q9D1X0 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nol3Q9D1X0 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nol3Q9D1X0 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Nol3Q9D1X0 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nol3Q9D1X0 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nol3Q9D1X0 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nol3Q9D1X0 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nol3Q9D1X0 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nol3Q9D1X0 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nol3Q9D1X0 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nol3Q9D1X0 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nol3Q9D1X0 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nol3Q9D1X0 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nol3Q9D1X0 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nol3Q9D1X0 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nol3Q9D1X0 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nol3Q9D1X0 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nol3Q9D1X0 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nol3Q9D1X0 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nol3Q9D1X0 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nol3Q9D1X0 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nol3Q9D1X0 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nol3Q9D1X0 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nol3Q9D1X0 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms