Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX1

SMIM12, Small integral membrane protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM12Q96EX1 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMIM12Q96EX1 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMIM12Q96EX1 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMIM12Q96EX1 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMIM12Q96EX1 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMIM12Q96EX1 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMIM12Q96EX1 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMIM12Q96EX1 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMIM12Q96EX1 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMIM12Q96EX1 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMIM12Q96EX1 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMIM12Q96EX1 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMIM12Q96EX1 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMIM12Q96EX1 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMIM12Q96EX1 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMIM12Q96EX1 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMIM12Q96EX1 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMIM12Q96EX1 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMIM12Q96EX1 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMIM12Q96EX1 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMIM12Q96EX1 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMIM12Q96EX1 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMIM12Q96EX1 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMIM12Q96EX1 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SMIM12Q96EX1 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMIM12Q96EX1 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMIM12Q96EX1 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMIM12Q96EX1 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMIM12Q96EX1 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMIM12Q96EX1 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMIM12Q96EX1 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMIM12Q96EX1 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMIM12Q96EX1 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMIM12Q96EX1 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SMIM12Q96EX1 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SMIM12Q96EX1 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SMIM12Q96EX1 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SMIM12Q96EX1 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMIM12Q96EX1 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMIM12Q96EX1 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SMIM12Q96EX1 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMIM12Q96EX1 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMIM12Q96EX1 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMIM12Q96EX1 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMIM12Q96EX1 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMIM12Q96EX1 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMIM12Q96EX1 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMIM12Q96EX1 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMIM12Q96EX1 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMIM12Q96EX1 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMIM12Q96EX1 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMIM12Q96EX1 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMIM12Q96EX1 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMIM12Q96EX1 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMIM12Q96EX1 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMIM12Q96EX1 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMIM12Q96EX1 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMIM12Q96EX1 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMIM12Q96EX1 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMIM12Q96EX1 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMIM12Q96EX1 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMIM12Q96EX1 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMIM12Q96EX1 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMIM12Q96EX1 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMIM12Q96EX1 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMIM12Q96EX1 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMIM12Q96EX1 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMIM12Q96EX1 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMIM12Q96EX1 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMIM12Q96EX1 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMIM12Q96EX1 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMIM12Q96EX1 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMIM12Q96EX1 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMIM12Q96EX1 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMIM12Q96EX1 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMIM12Q96EX1 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SMIM12Q96EX1 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMIM12Q96EX1 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMIM12Q96EX1 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMIM12Q96EX1 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMIM12Q96EX1 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMIM12Q96EX1 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMIM12Q96EX1 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMIM12Q96EX1 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMIM12Q96EX1 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.5
SMIM12Q96EX1 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMIM12Q96EX1 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMIM12Q96EX1 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMIM12Q96EX1 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMIM12Q96EX1 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMIM12Q96EX1 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMIM12Q96EX1 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMIM12Q96EX1 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SMIM12Q96EX1 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SMIM12Q96EX1 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMIM12Q96EX1 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMIM12Q96EX1 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMIM12Q96EX1 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMIM12Q96EX1 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMIM12Q96EX1 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms