Protein–RNA interactions for Protein: Q3U308

Ctu2, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctu2Q3U308 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ctu2Q3U308 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ctu2Q3U308 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ctu2Q3U308 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ctu2Q3U308 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ctu2Q3U308 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ctu2Q3U308 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ctu2Q3U308 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ctu2Q3U308 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ctu2Q3U308 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ctu2Q3U308 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ctu2Q3U308 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ctu2Q3U308 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ctu2Q3U308 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ctu2Q3U308 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ctu2Q3U308 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ctu2Q3U308 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ctu2Q3U308 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Ctu2Q3U308 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ctu2Q3U308 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ctu2Q3U308 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ctu2Q3U308 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ctu2Q3U308 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ctu2Q3U308 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ctu2Q3U308 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Ctu2Q3U308 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ctu2Q3U308 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ctu2Q3U308 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ctu2Q3U308 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ctu2Q3U308 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ctu2Q3U308 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ctu2Q3U308 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Ctu2Q3U308 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ctu2Q3U308 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ctu2Q3U308 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ctu2Q3U308 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ctu2Q3U308 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ctu2Q3U308 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Ctu2Q3U308 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ctu2Q3U308 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ctu2Q3U308 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ctu2Q3U308 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ctu2Q3U308 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ctu2Q3U308 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ctu2Q3U308 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ctu2Q3U308 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ctu2Q3U308 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ctu2Q3U308 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ctu2Q3U308 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ctu2Q3U308 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ctu2Q3U308 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ctu2Q3U308 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ctu2Q3U308 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ctu2Q3U308 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ctu2Q3U308 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ctu2Q3U308 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ctu2Q3U308 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ctu2Q3U308 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ctu2Q3U308 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ctu2Q3U308 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ctu2Q3U308 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ctu2Q3U308 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ctu2Q3U308 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ctu2Q3U308 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ctu2Q3U308 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Ctu2Q3U308 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ctu2Q3U308 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ctu2Q3U308 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ctu2Q3U308 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ctu2Q3U308 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ctu2Q3U308 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ctu2Q3U308 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ctu2Q3U308 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ctu2Q3U308 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ctu2Q3U308 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ctu2Q3U308 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ctu2Q3U308 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ctu2Q3U308 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ctu2Q3U308 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ctu2Q3U308 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ctu2Q3U308 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ctu2Q3U308 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ctu2Q3U308 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ctu2Q3U308 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ctu2Q3U308 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ctu2Q3U308 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ctu2Q3U308 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ctu2Q3U308 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ctu2Q3U308 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ctu2Q3U308 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ctu2Q3U308 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ctu2Q3U308 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ctu2Q3U308 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Ctu2Q3U308 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ctu2Q3U308 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ctu2Q3U308 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ctu2Q3U308 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ctu2Q3U308 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ctu2Q3U308 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ctu2Q3U308 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms