Protein–RNA interactions for Protein: Q0V8T9

Cntnap5a, Contactin-associated protein like 5-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntnap5aQ0V8T9 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cntnap5aQ0V8T9 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cntnap5aQ0V8T9 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cntnap5aQ0V8T9 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cntnap5aQ0V8T9 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cntnap5aQ0V8T9 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cntnap5aQ0V8T9 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cntnap5aQ0V8T9 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Cntnap5aQ0V8T9 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Cntnap5aQ0V8T9 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cntnap5aQ0V8T9 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cntnap5aQ0V8T9 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cntnap5aQ0V8T9 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Cntnap5aQ0V8T9 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cntnap5aQ0V8T9 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cntnap5aQ0V8T9 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cntnap5aQ0V8T9 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cntnap5aQ0V8T9 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cntnap5aQ0V8T9 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cntnap5aQ0V8T9 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cntnap5aQ0V8T9 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cntnap5aQ0V8T9 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cntnap5aQ0V8T9 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cntnap5aQ0V8T9 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cntnap5aQ0V8T9 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cntnap5aQ0V8T9 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cntnap5aQ0V8T9 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cntnap5aQ0V8T9 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cntnap5aQ0V8T9 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cntnap5aQ0V8T9 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cntnap5aQ0V8T9 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cntnap5aQ0V8T9 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cntnap5aQ0V8T9 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Cntnap5aQ0V8T9 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cntnap5aQ0V8T9 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cntnap5aQ0V8T9 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cntnap5aQ0V8T9 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cntnap5aQ0V8T9 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cntnap5aQ0V8T9 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cntnap5aQ0V8T9 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cntnap5aQ0V8T9 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cntnap5aQ0V8T9 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cntnap5aQ0V8T9 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cntnap5aQ0V8T9 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cntnap5aQ0V8T9 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cntnap5aQ0V8T9 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cntnap5aQ0V8T9 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cntnap5aQ0V8T9 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cntnap5aQ0V8T9 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cntnap5aQ0V8T9 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Cntnap5aQ0V8T9 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cntnap5aQ0V8T9 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cntnap5aQ0V8T9 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cntnap5aQ0V8T9 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cntnap5aQ0V8T9 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cntnap5aQ0V8T9 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cntnap5aQ0V8T9 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cntnap5aQ0V8T9 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cntnap5aQ0V8T9 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cntnap5aQ0V8T9 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cntnap5aQ0V8T9 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cntnap5aQ0V8T9 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cntnap5aQ0V8T9 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cntnap5aQ0V8T9 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cntnap5aQ0V8T9 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cntnap5aQ0V8T9 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cntnap5aQ0V8T9 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cntnap5aQ0V8T9 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cntnap5aQ0V8T9 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Cntnap5aQ0V8T9 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cntnap5aQ0V8T9 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cntnap5aQ0V8T9 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Cntnap5aQ0V8T9 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Cntnap5aQ0V8T9 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cntnap5aQ0V8T9 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cntnap5aQ0V8T9 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Cntnap5aQ0V8T9 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cntnap5aQ0V8T9 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Cntnap5aQ0V8T9 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
Cntnap5aQ0V8T9 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cntnap5aQ0V8T9 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cntnap5aQ0V8T9 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cntnap5aQ0V8T9 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cntnap5aQ0V8T9 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cntnap5aQ0V8T9 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cntnap5aQ0V8T9 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cntnap5aQ0V8T9 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cntnap5aQ0V8T9 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cntnap5aQ0V8T9 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cntnap5aQ0V8T9 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cntnap5aQ0V8T9 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cntnap5aQ0V8T9 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cntnap5aQ0V8T9 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cntnap5aQ0V8T9 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cntnap5aQ0V8T9 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cntnap5aQ0V8T9 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cntnap5aQ0V8T9 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cntnap5aQ0V8T9 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cntnap5aQ0V8T9 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Cntnap5aQ0V8T9 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms