Protein–RNA interactions for Protein: P97473

Tarbp2, RISC-loading complex subunit TARBP2, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tarbp2P97473 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tarbp2P97473 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tarbp2P97473 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tarbp2P97473 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tarbp2P97473 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Tarbp2P97473 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tarbp2P97473 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tarbp2P97473 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tarbp2P97473 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tarbp2P97473 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tarbp2P97473 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tarbp2P97473 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tarbp2P97473 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tarbp2P97473 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tarbp2P97473 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tarbp2P97473 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tarbp2P97473 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tarbp2P97473 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Tarbp2P97473 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tarbp2P97473 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tarbp2P97473 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tarbp2P97473 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tarbp2P97473 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Tarbp2P97473 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tarbp2P97473 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tarbp2P97473 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tarbp2P97473 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tarbp2P97473 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tarbp2P97473 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Tarbp2P97473 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tarbp2P97473 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tarbp2P97473 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Tarbp2P97473 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tarbp2P97473 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tarbp2P97473 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tarbp2P97473 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tarbp2P97473 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tarbp2P97473 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Tarbp2P97473 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tarbp2P97473 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tarbp2P97473 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Tarbp2P97473 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tarbp2P97473 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tarbp2P97473 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tarbp2P97473 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tarbp2P97473 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tarbp2P97473 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tarbp2P97473 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tarbp2P97473 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tarbp2P97473 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tarbp2P97473 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tarbp2P97473 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tarbp2P97473 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tarbp2P97473 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tarbp2P97473 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tarbp2P97473 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tarbp2P97473 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tarbp2P97473 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tarbp2P97473 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tarbp2P97473 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tarbp2P97473 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tarbp2P97473 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tarbp2P97473 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tarbp2P97473 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tarbp2P97473 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tarbp2P97473 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tarbp2P97473 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tarbp2P97473 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tarbp2P97473 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tarbp2P97473 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tarbp2P97473 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tarbp2P97473 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tarbp2P97473 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tarbp2P97473 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tarbp2P97473 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tarbp2P97473 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tarbp2P97473 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tarbp2P97473 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tarbp2P97473 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tarbp2P97473 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tarbp2P97473 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tarbp2P97473 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tarbp2P97473 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tarbp2P97473 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tarbp2P97473 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tarbp2P97473 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tarbp2P97473 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tarbp2P97473 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tarbp2P97473 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tarbp2P97473 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tarbp2P97473 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tarbp2P97473 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tarbp2P97473 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tarbp2P97473 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tarbp2P97473 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Tarbp2P97473 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tarbp2P97473 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tarbp2P97473 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Tarbp2P97473 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tarbp2P97473 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms