Protein–RNA interactions for Protein: P39005

KRE9, Cell wall synthesis protein KRE9, yeast

Predictions only

Length 276 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
KRE9	P39005	YPT1	YFL038C	621 nt		4.83	□□□□□ -1.64
KRE9	P39005	MIA40	YKL195W	1212 nt		4.83	□□□□□ -1.64
KRE9	P39005	SRL2	YLR082C	1179 nt		4.83	□□□□□ -1.64
KRE9	P39005	YNL092W	YNL092W	1203 nt		4.83	□□□□□ -1.64
KRE9	P39005	COS10	YNR075W	1125 nt		4.83	□□□□□ -1.64
KRE9	P39005	YBR113W	YBR113W	483 nt		4.83	□□□□□ -1.64
KRE9	P39005	snR34	snR34	203 nt		4.83	□□□□□ -1.64
KRE9	P39005	HEM1	YDR232W	1647 nt		4.83	□□□□□ -1.64
KRE9	P39005	NOG2	YNR053C	1461 nt		4.82	□□□□□ -1.64
KRE9	P39005	CLB4	YLR210W	1383 nt		4.82	□□□□□ -1.64
KRE9	P39005	COX10	YPL172C	1389 nt		4.82	□□□□□ -1.64
KRE9	P39005	GPI18	YBR004C	1302 nt		4.82	□□□□□ -1.64
KRE9	P39005	YBR284W	YBR284W	2394 nt		4.82	□□□□□ -1.64
KRE9	P39005	MPH3	YJR160C	1809 nt		4.82	□□□□□ -1.64
KRE9	P39005	MMS2	YGL087C	414 nt		4.82	□□□□□ -1.64
KRE9	P39005	ISY1	YJR050W	708 nt		4.82	□□□□□ -1.64
KRE9	P39005	LIA1	YJR070C	978 nt		4.82	□□□□□ -1.64
KRE9	P39005	YKL077W	YKL077W	1179 nt		4.82	□□□□□ -1.64
KRE9	P39005	MRI1	YPR118W	1236 nt		4.82	□□□□□ -1.64
KRE9	P39005	HAL5	YJL165C	2568 nt		4.82	□□□□□ -1.64
KRE9	P39005	HXT2	YMR011W	1626 nt		4.82	□□□□□ -1.64
KRE9	P39005	FMP40	YPL222W	2067 nt		4.81	□□□□□ -1.64
KRE9	P39005	SUF5	tG(CCC)O	72 nt		4.81	□□□□□ -1.64
KRE9	P39005	HOC1	YJR075W	1191 nt		4.81	□□□□□ -1.64
KRE9	P39005	RNH1	YMR234W	1047 nt		4.81	□□□□□ -1.64
KRE9	P39005	RFC4	YOL094C	972 nt		4.81	□□□□□ -1.64
KRE9	P39005	YPL250W-A	YPL250W-A	288 nt		4.81	□□□□□ -1.64
KRE9	P39005	RIO1	YOR119C	1455 nt		4.81	□□□□□ -1.64
KRE9	P39005	PLB3	YOL011W	2061 nt		4.81	□□□□□ -1.64
KRE9	P39005	POX1	YGL205W	2247 nt		4.8	□□□□□ -1.64
KRE9	P39005	GDA1	YEL042W	1557 nt		4.8	□□□□□ -1.64
KRE9	P39005	PEX13	YLR191W	1161 nt		4.8	□□□□□ -1.64
KRE9	P39005	KSH1	YNL024C-A	219 nt		4.8	□□□□□ -1.64
KRE9	P39005	MRPL23	YOR150W	492 nt		4.8	□□□□□ -1.64
KRE9	P39005	YHK8	YHR048W	1545 nt		4.8	□□□□□ -1.64
KRE9	P39005	ISR1	YPR106W	1332 nt		4.79	□□□□□ -1.64
KRE9	P39005	CRH1	YGR189C	1524 nt		4.79	□□□□□ -1.64
KRE9	P39005	CYC8	YBR112C	2901 nt		4.79	□□□□□ -1.64
KRE9	P39005	YCR099C	YCR099C	468 nt		4.79	□□□□□ -1.64
KRE9	P39005	YRB2	YIL063C	984 nt		4.79	□□□□□ -1.64
KRE9	P39005	YJR146W	YJR146W	354 nt		4.79	□□□□□ -1.64
KRE9	P39005	FBA1	YKL060C	1080 nt		4.79	□□□□□ -1.64
KRE9	P39005	YKL102C	YKL102C	306 nt		4.79	□□□□□ -1.64
KRE9	P39005	COX5A	YNL052W	462 nt		4.79	□□□□□ -1.64
KRE9	P39005	YNL194C	YNL194C	906 nt		4.79	□□□□□ -1.64
KRE9	P39005	YPL257W	YPL257W	582 nt		4.79	□□□□□ -1.64
KRE9	P39005	PAP1	YKR002W	1707 nt		4.79	□□□□□ -1.64
KRE9	P39005	GEF1	YJR040W	2340 nt		4.79	□□□□□ -1.64
KRE9	P39005	DRS1	YLL008W	2259 nt		4.79	□□□□□ -1.64
KRE9	P39005	PMT3	YOR321W	2262 nt		4.79	□□□□□ -1.64
KRE9	P39005	BIM1	YER016W	1035 nt		4.78	□□□□□ -1.64
KRE9	P39005	ASF1	YJL115W	840 nt		4.78	□□□□□ -1.64
KRE9	P39005	AIM33	YML087C	939 nt		4.78	□□□□□ -1.64
KRE9	P39005	SPC24	YMR117C	642 nt		4.78	□□□□□ -1.64
KRE9	P39005	YNL120C	YNL120C	486 nt		4.78	□□□□□ -1.64
KRE9	P39005	GLE1	YDL207W	1617 nt		4.78	□□□□□ -1.64
KRE9	P39005	CYS4	YGR155W	1524 nt		4.77	□□□□□ -1.65
KRE9	P39005	YOS9	YDR057W	1629 nt		4.77	□□□□□ -1.65
KRE9	P39005	GPD1	YDL022W	1176 nt		4.77	□□□□□ -1.65
KRE9	P39005	FAL1	YDR021W	1200 nt		4.77	□□□□□ -1.65
KRE9	P39005	HEM2	YGL040C	1029 nt		4.77	□□□□□ -1.65
KRE9	P39005	YGR291C	YGR291C	222 nt		4.77	□□□□□ -1.65
KRE9	P39005	FMO1	YHR176W	1299 nt		4.77	□□□□□ -1.65
KRE9	P39005	YHR213W-B	YHR213W-B	300 nt		4.77	□□□□□ -1.65
KRE9	P39005	SQT1	YIR012W	1296 nt		4.77	□□□□□ -1.65
KRE9	P39005	DID2	YKR035W-A	615 nt		4.77	□□□□□ -1.65
KRE9	P39005	YAR064W	YAR064W	300 nt		4.77	□□□□□ -1.65
KRE9	P39005	OGG1	YML060W	1131 nt		4.77	□□□□□ -1.65
KRE9	P39005	MTQ1	YNL063W	945 nt		4.77	□□□□□ -1.65
KRE9	P39005	PUS4	YNL292W	1212 nt		4.77	□□□□□ -1.65
KRE9	P39005	HST2	YPL015C	1074 nt		4.77	□□□□□ -1.65
KRE9	P39005	YBR298C-A	YBR298C-A	222 nt		4.77	□□□□□ -1.65
KRE9	P39005	MUM3	YOR298W	1440 nt		4.77	□□□□□ -1.65
KRE9	P39005	IES1	YFL013C	2079 nt		4.77	□□□□□ -1.65
KRE9	P39005	SES1	YDR023W	1389 nt		4.77	□□□□□ -1.65
KRE9	P39005	CSC1	YLR241W	2349 nt		4.77	□□□□□ -1.65
KRE9	P39005	MSY1	YPL097W	1479 nt		4.76	□□□□□ -1.65
KRE9	P39005	YCR006C	YCR006C	474 nt		4.76	□□□□□ -1.65
KRE9	P39005	ASN2	YGR124W	1719 nt		4.76	□□□□□ -1.65
KRE9	P39005	Q0144	Q0144	330 nt		4.76	□□□□□ -1.65
KRE9	P39005	CBT1	YKL208W	816 nt		4.76	□□□□□ -1.65
KRE9	P39005	REX3	YLR107W	1215 nt		4.76	□□□□□ -1.65
KRE9	P39005	LSC1	YOR142W	990 nt		4.76	□□□□□ -1.65
KRE9	P39005	ALG5	YPL227C	1005 nt		4.76	□□□□□ -1.65
KRE9	P39005	THI2	YBR240C	1353 nt		4.76	□□□□□ -1.65
KRE9	P39005	NTE1	YML059C	5040 nt		4.75	□□□□□ -1.65
KRE9	P39005	CNM67	YNL225C	1746 nt		4.75	□□□□□ -1.65
KRE9	P39005	MRPL35	YDR322W	1104 nt		4.75	□□□□□ -1.65
KRE9	P39005	LCL3	YGL085W	825 nt		4.75	□□□□□ -1.65
KRE9	P39005	RPP1	YHR062C	882 nt		4.75	□□□□□ -1.65
KRE9	P39005	RFA2	YNL312W	822 nt		4.75	□□□□□ -1.65
KRE9	P39005	MSO1	YNR049C	633 nt		4.75	□□□□□ -1.65
KRE9	P39005	FES1	YBR101C	873 nt		4.75	□□□□□ -1.65
KRE9	P39005	RGD1	YBR260C	2001 nt		4.75	□□□□□ -1.65
KRE9	P39005	OPT1	YJL212C	2400 nt		4.74	□□□□□ -1.65
KRE9	P39005	UTR2	YEL040W	1404 nt		4.74	□□□□□ -1.65
KRE9	P39005	EFT2	YDR385W	2529 nt		4.74	□□□□□ -1.65
KRE9	P39005	EFT1	YOR133W	2529 nt		4.74	□□□□□ -1.65
KRE9	P39005	CIS3	YJL158C	684 nt		4.74	□□□□□ -1.65
KRE9	P39005	MSA2	YKR077W	1092 nt		4.74	□□□□□ -1.65

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