Protein–RNA interactions for Protein: F6XWB2

Igkv1-99, Immunoglobulin kappa variable 1-99 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igkv1-99F6XWB2 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Igkv1-99F6XWB2 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Igkv1-99F6XWB2 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Igkv1-99F6XWB2 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Igkv1-99F6XWB2 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Igkv1-99F6XWB2 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Igkv1-99F6XWB2 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Igkv1-99F6XWB2 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Igkv1-99F6XWB2 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Igkv1-99F6XWB2 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Igkv1-99F6XWB2 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Igkv1-99F6XWB2 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Igkv1-99F6XWB2 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Igkv1-99F6XWB2 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Igkv1-99F6XWB2 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Igkv1-99F6XWB2 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Igkv1-99F6XWB2 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Igkv1-99F6XWB2 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Igkv1-99F6XWB2 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Igkv1-99F6XWB2 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Igkv1-99F6XWB2 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Igkv1-99F6XWB2 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Igkv1-99F6XWB2 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Igkv1-99F6XWB2 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Igkv1-99F6XWB2 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Igkv1-99F6XWB2 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Igkv1-99F6XWB2 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Igkv1-99F6XWB2 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Igkv1-99F6XWB2 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Igkv1-99F6XWB2 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Igkv1-99F6XWB2 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Igkv1-99F6XWB2 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Igkv1-99F6XWB2 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Igkv1-99F6XWB2 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Igkv1-99F6XWB2 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Igkv1-99F6XWB2 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Igkv1-99F6XWB2 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Igkv1-99F6XWB2 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Igkv1-99F6XWB2 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Igkv1-99F6XWB2 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Igkv1-99F6XWB2 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Igkv1-99F6XWB2 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Igkv1-99F6XWB2 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Igkv1-99F6XWB2 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Igkv1-99F6XWB2 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Igkv1-99F6XWB2 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Igkv1-99F6XWB2 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Igkv1-99F6XWB2 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Igkv1-99F6XWB2 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Igkv1-99F6XWB2 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Igkv1-99F6XWB2 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Igkv1-99F6XWB2 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Igkv1-99F6XWB2 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Igkv1-99F6XWB2 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Igkv1-99F6XWB2 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Igkv1-99F6XWB2 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Igkv1-99F6XWB2 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Igkv1-99F6XWB2 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Igkv1-99F6XWB2 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Igkv1-99F6XWB2 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Igkv1-99F6XWB2 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Igkv1-99F6XWB2 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Igkv1-99F6XWB2 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Igkv1-99F6XWB2 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Igkv1-99F6XWB2 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Igkv1-99F6XWB2 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Igkv1-99F6XWB2 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Igkv1-99F6XWB2 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Igkv1-99F6XWB2 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Igkv1-99F6XWB2 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Igkv1-99F6XWB2 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Igkv1-99F6XWB2 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Igkv1-99F6XWB2 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Igkv1-99F6XWB2 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Igkv1-99F6XWB2 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Igkv1-99F6XWB2 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Igkv1-99F6XWB2 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Igkv1-99F6XWB2 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Igkv1-99F6XWB2 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Igkv1-99F6XWB2 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Igkv1-99F6XWB2 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Igkv1-99F6XWB2 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Igkv1-99F6XWB2 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Igkv1-99F6XWB2 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Igkv1-99F6XWB2 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Igkv1-99F6XWB2 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Igkv1-99F6XWB2 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Igkv1-99F6XWB2 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Igkv1-99F6XWB2 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Igkv1-99F6XWB2 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Igkv1-99F6XWB2 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Igkv1-99F6XWB2 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Igkv1-99F6XWB2 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Igkv1-99F6XWB2 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Igkv1-99F6XWB2 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Igkv1-99F6XWB2 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Igkv1-99F6XWB2 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Igkv1-99F6XWB2 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Igkv1-99F6XWB2 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Igkv1-99F6XWB2 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms