Protein–RNA interactions for Protein: Q53H54

TRMT12, tRNA wybutosine-synthesizing protein 2 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMT12Q53H54 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRMT12Q53H54 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRMT12Q53H54 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRMT12Q53H54 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRMT12Q53H54 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRMT12Q53H54 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRMT12Q53H54 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRMT12Q53H54 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRMT12Q53H54 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRMT12Q53H54 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRMT12Q53H54 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRMT12Q53H54 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRMT12Q53H54 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRMT12Q53H54 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRMT12Q53H54 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRMT12Q53H54 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRMT12Q53H54 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRMT12Q53H54 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TRMT12Q53H54 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRMT12Q53H54 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRMT12Q53H54 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TRMT12Q53H54 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRMT12Q53H54 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRMT12Q53H54 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRMT12Q53H54 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRMT12Q53H54 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRMT12Q53H54 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRMT12Q53H54 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRMT12Q53H54 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRMT12Q53H54 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRMT12Q53H54 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
TRMT12Q53H54 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRMT12Q53H54 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRMT12Q53H54 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRMT12Q53H54 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRMT12Q53H54 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRMT12Q53H54 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRMT12Q53H54 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRMT12Q53H54 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRMT12Q53H54 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TRMT12Q53H54 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRMT12Q53H54 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRMT12Q53H54 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TRMT12Q53H54 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRMT12Q53H54 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TRMT12Q53H54 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRMT12Q53H54 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRMT12Q53H54 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRMT12Q53H54 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRMT12Q53H54 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRMT12Q53H54 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRMT12Q53H54 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRMT12Q53H54 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRMT12Q53H54 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRMT12Q53H54 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRMT12Q53H54 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRMT12Q53H54 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TRMT12Q53H54 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRMT12Q53H54 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TRMT12Q53H54 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRMT12Q53H54 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRMT12Q53H54 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRMT12Q53H54 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRMT12Q53H54 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRMT12Q53H54 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRMT12Q53H54 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRMT12Q53H54 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRMT12Q53H54 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRMT12Q53H54 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRMT12Q53H54 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRMT12Q53H54 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRMT12Q53H54 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRMT12Q53H54 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRMT12Q53H54 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRMT12Q53H54 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRMT12Q53H54 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRMT12Q53H54 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRMT12Q53H54 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRMT12Q53H54 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRMT12Q53H54 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRMT12Q53H54 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRMT12Q53H54 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TRMT12Q53H54 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRMT12Q53H54 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRMT12Q53H54 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRMT12Q53H54 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRMT12Q53H54 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TRMT12Q53H54 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TRMT12Q53H54 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRMT12Q53H54 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRMT12Q53H54 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRMT12Q53H54 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRMT12Q53H54 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRMT12Q53H54 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRMT12Q53H54 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRMT12Q53H54 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRMT12Q53H54 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRMT12Q53H54 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRMT12Q53H54 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRMT12Q53H54 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.2 ms