Protein–RNA interactions for Protein: Q07657

SHS1, Seventh homolog of septin 1, yeastyeast

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SHS1Q07657 LDB16YCL005W 771 nt6.81□□□□□ -1.32
SHS1Q07657 SDH4YDR178W 546 nt6.8□□□□□ -1.32
SHS1Q07657 MED6YHR058C 888 nt6.8□□□□□ -1.32
SHS1Q07657 COX16YJL003W 357 nt6.8□□□□□ -1.32
SHS1Q07657 TOS6YNL300W 309 nt6.8□□□□□ -1.32
SHS1Q07657 RVB2YPL235W 1416 nt6.8□□□□□ -1.32
SHS1Q07657 YLL066CYLL066C 3618 nt6.8□□□□□ -1.32
SHS1Q07657 YLL067CYLL067C 3618 nt6.8□□□□□ -1.32
SHS1Q07657 YDR415CYDR415C 1125 nt6.79□□□□□ -1.32
SHS1Q07657 PRE3YJL001W 648 nt6.79□□□□□ -1.32
SHS1Q07657 ERG1YGR175C 1491 nt6.79□□□□□ -1.32
SHS1Q07657 BIM1YER016W 1035 nt6.78□□□□□ -1.32
SHS1Q07657 YPT1YFL038C 621 nt6.78□□□□□ -1.32
SHS1Q07657 YJR084WYJR084W 1272 nt6.78□□□□□ -1.32
SHS1Q07657 ZRT2YLR130C 1269 nt6.78□□□□□ -1.32
SHS1Q07657 ADH5YBR145W 1056 nt6.78□□□□□ -1.32
SHS1Q07657 FRT1YOR324C 1809 nt6.78□□□□□ -1.32
SHS1Q07657 ECM27YJR106W 2178 nt6.78□□□□□ -1.32
SHS1Q07657 EFM1YHL039W 1758 nt6.77□□□□□ -1.33
SHS1Q07657 RAD59YDL059C 717 nt6.77□□□□□ -1.33
SHS1Q07657 MEH1YKR007W 555 nt6.77□□□□□ -1.33
SHS1Q07657 PSR2YLR019W 1194 nt6.77□□□□□ -1.33
SHS1Q07657 COQ3YOL096C 939 nt6.77□□□□□ -1.33
SHS1Q07657 TSR3YOR006C 942 nt6.77□□□□□ -1.33
SHS1Q07657 RPS28AYOR167C 204 nt6.77□□□□□ -1.33
SHS1Q07657 MSY1YPL097W 1479 nt6.77□□□□□ -1.33
SHS1Q07657 SEC23YPR181C 2307 nt6.77□□□□□ -1.33
SHS1Q07657 PPT1YGR123C 1542 nt6.76□□□□□ -1.33
SHS1Q07657 GGC1YDL198C 903 nt6.76□□□□□ -1.33
SHS1Q07657 YKR032WYKR032W 315 nt6.76□□□□□ -1.33
SHS1Q07657 RPL5YPL131W 894 nt6.76□□□□□ -1.33
SHS1Q07657 LYS21YDL131W 1323 nt6.76□□□□□ -1.33
SHS1Q07657 YHR131CYHR131C 2553 nt6.75□□□□□ -1.33
SHS1Q07657 DYS1YHR068W 1164 nt6.75□□□□□ -1.33
SHS1Q07657 FBA1YKL060C 1080 nt6.75□□□□□ -1.33
SHS1Q07657 KIN1YDR122W 3195 nt6.74□□□□□ -1.33
SHS1Q07657 SQT1YIR012W 1296 nt6.74□□□□□ -1.33
SHS1Q07657 YJR107WYJR107W 987 nt6.74□□□□□ -1.33
SHS1Q07657 AAT2YLR027C 1257 nt6.74□□□□□ -1.33
SHS1Q07657 CRF1YDR223W 1404 nt6.74□□□□□ -1.33
SHS1Q07657 GUT1YHL032C 2130 nt6.73□□□□□ -1.33
SHS1Q07657 MOG1YJR074W 657 nt6.73□□□□□ -1.33
SHS1Q07657 AMD2YDR242W 1650 nt6.73□□□□□ -1.33
SHS1Q07657 THI2YBR240C 1353 nt6.72□□□□□ -1.33
SHS1Q07657 YLR312CYLR312C 1197 nt6.72□□□□□ -1.33
SHS1Q07657 SRF1YDL133W 1314 nt6.72□□□□□ -1.33
SHS1Q07657 CTF3YLR381W 2202 nt6.71□□□□□ -1.34
SHS1Q07657 BUG1YDL099W 1026 nt6.71□□□□□ -1.34
SHS1Q07657 YHR213W-AYHR213W-A 234 nt6.71□□□□□ -1.34
SHS1Q07657 AIM24YJR080C 1185 nt6.71□□□□□ -1.34
SHS1Q07657 TIM22YDL217C 624 nt6.7□□□□□ -1.34
SHS1Q07657 YNL285WYNL285W 372 nt6.7□□□□□ -1.34
SHS1Q07657 IVY1YDR229W 1362 nt6.69□□□□□ -1.34
SHS1Q07657 PMT3YOR321W 2262 nt6.69□□□□□ -1.34
SHS1Q07657 YGR068W-AYGR068W-A 96 nt6.69□□□□□ -1.34
SHS1Q07657 RPS3YNL178W 723 nt6.69□□□□□ -1.34
SHS1Q07657 PEX3YDR329C 1326 nt6.69□□□□□ -1.34
SHS1Q07657 MAK31YCR020C-A 267 nt6.68□□□□□ -1.34
SHS1Q07657 YDL218WYDL218W 954 nt6.68□□□□□ -1.34
SHS1Q07657 CCR4YAL021C 2514 nt6.67□□□□□ -1.34
SHS1Q07657 YDR015CYDR015C 240 nt6.67□□□□□ -1.34
SHS1Q07657 SUF5tG(CCC)O 72 nt6.67□□□□□ -1.34
SHS1Q07657 OPI8YKR035C 642 nt6.67□□□□□ -1.34
SHS1Q07657 RKI1YOR095C 777 nt6.67□□□□□ -1.34
SHS1Q07657 PRY3YJL078C 2646 nt6.67□□□□□ -1.34
SHS1Q07657 EMP65YER140W 1671 nt6.67□□□□□ -1.34
SHS1Q07657 YET3YDL072C 612 nt6.66□□□□□ -1.34
SHS1Q07657 RPP1YHR062C 882 nt6.66□□□□□ -1.34
SHS1Q07657 DOT5YIL010W 648 nt6.66□□□□□ -1.34
SHS1Q07657 YLR123CYLR123C 330 nt6.66□□□□□ -1.34
SHS1Q07657 POX1YGL205W 2247 nt6.65□□□□□ -1.34
SHS1Q07657 ECM14YHR132C 1293 nt6.65□□□□□ -1.34
SHS1Q07657 LCB3YJL134W 1230 nt6.65□□□□□ -1.34
SHS1Q07657 UIP4YPL186C 915 nt6.65□□□□□ -1.34
SHS1Q07657 RIX7YLL034C 2514 nt6.64□□□□□ -1.35
SHS1Q07657 CMK2YOL016C 1344 nt6.64□□□□□ -1.35
SHS1Q07657 MCH1YDL054C 1461 nt6.64□□□□□ -1.35
SHS1Q07657 CCC2YDR270W 3015 nt6.63□□□□□ -1.35
SHS1Q07657 ATO2YNR002C 849 nt6.63□□□□□ -1.35
SHS1Q07657 YKR023WYKR023W 1593 nt6.62□□□□□ -1.35
SHS1Q07657 YPR204WYPR204W 3099 nt6.62□□□□□ -1.35
SHS1Q07657 UTR2YEL040W 1404 nt6.62□□□□□ -1.35
SHS1Q07657 KTR1YOR099W 1182 nt6.62□□□□□ -1.35
SHS1Q07657 DAL7YIR031C 1665 nt6.61□□□□□ -1.35
SHS1Q07657 BUD32YGR262C 786 nt6.61□□□□□ -1.35
SHS1Q07657 QCR8YJL166W 285 nt6.61□□□□□ -1.35
SHS1Q07657 ILV1YER086W 1731 nt6.61□□□□□ -1.35
SHS1Q07657 ICL1YER065C 1674 nt6.61□□□□□ -1.35
SHS1Q07657 FRE5YOR384W 2085 nt6.61□□□□□ -1.35
SHS1Q07657 ADE17YMR120C 1779 nt6.6□□□□□ -1.35
SHS1Q07657 JNM1YMR294W 1122 nt6.6□□□□□ -1.35
SHS1Q07657 COX5AYNL052W 462 nt6.6□□□□□ -1.35
SHS1Q07657 CAF40YNL288W 1122 nt6.6□□□□□ -1.35
SHS1Q07657 PPS1YBR276C 2424 nt6.6□□□□□ -1.35
SHS1Q07657 YIL108WYIL108W 2091 nt6.59□□□□□ -1.35
SHS1Q07657 RPS5YJR123W 678 nt6.59□□□□□ -1.35
SHS1Q07657 IES2YNL215W 963 nt6.59□□□□□ -1.35
SHS1Q07657 PEX13YLR191W 1161 nt6.58□□□□□ -1.36
SHS1Q07657 POP5YAL033W 522 nt6.57□□□□□ -1.36
SHS1Q07657 GCV3YAL044C 513 nt6.57□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 57.3 ms